23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0194 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0194  putative urease accessory protein  100 
 
 		 239 aa  449  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3079  putative urease accessory protein  44.88 
 
 		 208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0546713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11881  urease accessory protein ureD  41.18 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.339466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3349  putative urease accessory protein  44.05 
 
 		 212 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2802  putative urease accessory protein  45.56 
 
 		 210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2846  putative urease accessory protein  45.56 
 
 		 210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.72908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2829  putative urease accessory protein  45.56 
 
 		 210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3207  Urease accessory protein UreD  45.75 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00681143  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6444  urease accessory protein  38.58 
 
 		 270 aa  99.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31216  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0502  urease accessory protein UreD  44.51 
 
 		 281 aa  98.2  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2752  hypothetical protein  36.61 
 
 		 233 aa  85.5  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0794267  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0830  putative urease accessory protein  42.38 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5702  putative urease accessory protein UreD  39.23 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.119929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03280  urease accessory protein UreH  34.29 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3507  Urease accessory protein UreH-like protein  38.85 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.223661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3209  Urease accessory protein UreD  31.73 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0694  Urease accessory protein UreH-like protein  31.68 
 
 		 291 aa  52.8  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0135434  hitchhiker  0.0000000541672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  33.11 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0275  Urease accessory protein UreH-like protein  36.09 
 
 		 240 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3245  Urease accessory protein UreD  33.33 
 
 		 309 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3020  urease accessory protein UreD  33.33 
 
 		 338 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2036  urease accessory protein ureD  32.69 
 
 		 295 aa  42.7  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.133178  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  31.78 
 
 		 305 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>