67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5702 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5702  putative urease accessory protein UreD  100 
 
 		 297 aa  548  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.119929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0830  putative urease accessory protein  51.02 
 
 		 319 aa  235  8e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3207  Urease accessory protein UreD  45.78 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00681143  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6444  urease accessory protein  37.78 
 
 		 270 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31216  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0502  urease accessory protein UreD  38.1 
 
 		 281 aa  115  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03280  urease accessory protein UreH  35.19 
 
 		 299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3079  putative urease accessory protein  44.27 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0546713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2846  putative urease accessory protein  41.98 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.72908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2802  putative urease accessory protein  41.98 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2829  putative urease accessory protein  41.98 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0194  putative urease accessory protein  39.23 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11881  urease accessory protein ureD  35.27 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.339466 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3507  Urease accessory protein UreH-like protein  33.47 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.223661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3349  putative urease accessory protein  47.11 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2752  hypothetical protein  41.73 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0794267  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0275  Urease accessory protein UreH-like protein  34.65 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1024  urease accessory protein UreD  28.22 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0694  Urease accessory protein UreH-like protein  34.58 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0135434  hitchhiker  0.0000000541672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2214  urease accessory protein UreD  32.49 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00280053 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  29.29 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4890  urease accessory protein UreD  33.86 
 
 		 281 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0977  Urease accessory protein UreD  32.26 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3406  putative urease accessory protein  36.92 
 
 		 232 aa  54.3  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1212  urease accessory protein UreD  31.58 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  28.33 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4047  urease accessory protein UreD  34.15 
 
 		 297 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  39.39 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2444  urease accessory protein UreD  26.79 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792758  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1707  Urease accessory protein UreD  34.48 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2718  urease accessory protein UreD  30.06 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.274036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4154  urease accessory protein UreD  30.68 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5585  urease accessory protein  36.27 
 
 		 280 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0585  urease accessory protein UreD  37.25 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64335  urease accessory protein  36.27 
 
 		 280 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2455  urease accessory protein UreD  27.44 
 
 		 287 aa  49.3  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1197  urease accessory protein UreD  25.12 
 
 		 301 aa  49.3  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.294974  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3658  urease accessory protein UreD  23.89 
 
 		 273 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0281  urease accessory protein UreD  26.96 
 
 		 280 aa  48.9  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0267  urease accessory protein UreD  26.96 
 
 		 280 aa  48.9  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.628784  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2414  urease accessory protein UreD  30.64 
 
 		 277 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0696  urease accessory protein UreD  36.27 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3209  Urease accessory protein UreD  34.48 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2996  urease accessory protein UreD  33.08 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4431  urease accessory protein UreD  35.29 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2370  urease accessory protein  30.41 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.512779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1186  urease accessory protein UreD  31.97 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09910  Urease accessory protein UreD  36.27 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930917  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2014  Urease accessory protein UreD  27.31 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5120  Urease accessory protein UreD  33.67 
 
 		 311 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1238  urease accessory protein UreD  29.82 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2469  urease accessory protein UreD  35.85 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  35.35 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0957  urease accessory protein UreD  31.67 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0865404  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0388  urease accessory protein UreD  29.9 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1463  Urease accessory protein UreD  32.65 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1301  urease accessory protein UreD  32.65 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2680  urease accessory protein UreD  29.23 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0397  Urease accessory protein UreD  29.96 
 
 		 280 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585213  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0949  Urease accessory protein UreD  34.86 
 
 		 293 aa  43.9  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2062  Urease accessory protein UreD  29.28 
 
 		 315 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000769283  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  31.91 
 
 		 305 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6187  urease accessory protein UreD  31.11 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3936  Urease accessory protein UreD  29.46 
 
 		 292 aa  42.7  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3688  putative urease accessory protein  33.33 
 
 		 293 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2842  urease accessory protein UreD  29.73 
 
 		 277 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3101  Urease accessory protein UreD  29.25 
 
 		 277 aa  42.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1499  urease accessory protein UreD  26.77 
 
 		 321 aa  42.4  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>