136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1301 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1463  Urease accessory protein UreD  100 
 
 		 311 aa  634    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1301  urease accessory protein UreD  100 
 
 		 311 aa  634    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5120  Urease accessory protein UreD  89.39 
 
 		 311 aa  570  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1083  urease accessory protein UreD  47.83 
 
 		 321 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1137  urease accessory protein UreD  47.83 
 
 		 321 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1362  urease accessory protein UreD  44.04 
 
 		 302 aa  259  6e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1318  urease accessory protein UreD  44.04 
 
 		 302 aa  258  6e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2718  urease accessory protein UreD  38.18 
 
 		 308 aa  178  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.274036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2062  Urease accessory protein UreD  38.29 
 
 		 315 aa  165  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000769283  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1555  Urease accessory protein UreD  30.14 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0957  urease accessory protein UreD  29.75 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0865404  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2767  Urease accessory protein UreD  24.07 
 
 		 271 aa  89.7  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0329  urease accessory protein  24.41 
 
 		 279 aa  87.4  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1812  urease accessory protein UreD  31.25 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  31.43 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1964  putative urease accessory protein ureD  28.51 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2318  urease accessory protein UreD  29.79 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00527457  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2361  urease accessory protein UreD  29.79 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.361313  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0991  urease accessory protein UreD  28.07 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271998  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  27.68 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0396  Urease accessory protein UreD  26.71 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1138  Urease accessory protein UreD  26.91 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6187  urease accessory protein UreD  28.98 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03480  urease accessory protein UreH  28.08 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1238  urease accessory protein UreD  27.65 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09910  Urease accessory protein UreD  31.84 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930917  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0247  urease accessory protein UreD  26.2 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2883  urease accessory protein UreD  27.7 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0749  urease accessory protein UreD  21.93 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7013  putative urease accessory protein UreD  30.5 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3101  Urease accessory protein UreD  26.76 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1875  urease accessory protein UreD  24.82 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.37143  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1865  Urease accessory protein UreD  28.41 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.479381 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0683  urease accessory protein UreD  21.11 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1024  urease accessory protein UreD  27.59 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3936  Urease accessory protein UreD  28.77 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2455  urease accessory protein UreD  25.56 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3057  Urease accessory protein UreD  29.15 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2036  urease accessory protein ureD  27.24 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.133178  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1683  urease accessory protein UreD  26.09 
 
 		 273 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4212  urease accessory protein UreD  30.11 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1359  Urease accessory protein UreD  28.35 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500344  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3658  urease accessory protein UreD  27.66 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1199  urease accessory protein UreD  29.18 
 
 		 294 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  33.72 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0585  urease accessory protein UreD  30.17 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4414  Urease accessory protein UreD  20.41 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4440  putative urease accessory protein ureD  30.37 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3688  putative urease accessory protein  27.3 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139672 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0696  urease accessory protein UreD  29.17 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4047  urease accessory protein UreD  30.13 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2195  urease accessory protein UreD  24.39 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00406195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  33.83 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3209  Urease accessory protein UreD  28.35 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0473  urease accessory protein UreD  25.62 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.744472  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4431  urease accessory protein UreD  27.27 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2308  urease accessory protein UreD  30 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3313  Urease accessory protein UreD  28.05 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2370  urease accessory protein  30.21 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.512779 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1770  urease accessory protein UreD  26.3 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1197  urease accessory protein UreD  24.83 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.294974  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1707  Urease accessory protein UreD  33.1 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2842  urease accessory protein UreD  30.56 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2014  Urease accessory protein UreD  29.27 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3020  urease accessory protein UreD  31.3 
 
 		 338 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0949  Urease accessory protein UreD  30.05 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2469  urease accessory protein UreD  29.41 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3245  Urease accessory protein UreD  29.23 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2847  urease accessory protein UreD  30 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2389  urease accessory protein UreD  28.21 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.274527 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2444  urease accessory protein UreD  24.81 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792758  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2188  Urease accessory protein UreD  26.94 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0724  Urease accessory protein UreD  23.02 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3132  UreD-family accessory protein  25.2 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4009  urease accessory protein UreD  27.36 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4831  urease accessory protein UreD  24.64 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0793  urease accessory protein UreD  26.87 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2181  urease accessory protein UreD  26.07 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670086  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1499  urease accessory protein UreD  27.34 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0879  urease accessory protein UreD  35 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0903  urease accessory protein UreD  26.37 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0727  urease accessory protein UreD  26.07 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2560  urease accessory protein UreD  26.07 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3072  urease accessory protein UreD  26.07 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3108  urease accessory protein UreD  26.07 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2053  urease accessory protein UreD  26.07 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1186  urease accessory protein UreD  26.76 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2487  urease accessory protein UreD  26.87 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  25.18 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0424  urease accessory protein UreD  26.5 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64335  urease accessory protein  26.56 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5585  urease accessory protein  26.56 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2408  urease accessory protein UreD  23.29 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.815614  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2254  urease accessory protein D  25.09 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0782  urease accessory protein UreD  26.37 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  25.56 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0977  Urease accessory protein UreD  28.18 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0984  urease accessory protein UreD  34.31 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4154  urease accessory protein UreD  28.08 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2938  urease accessory protein UreD  25.61 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>