146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2014 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2014  Urease accessory protein UreD  100 
 
 		 282 aa  551  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2214  urease accessory protein UreD  43.8 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00280053 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4154  urease accessory protein UreD  43.03 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3245  Urease accessory protein UreD  39.78 
 
 		 309 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3057  Urease accessory protein UreD  39.26 
 
 		 273 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2389  urease accessory protein UreD  39.68 
 
 		 277 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.274527 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3209  Urease accessory protein UreD  42.08 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2680  urease accessory protein UreD  38.26 
 
 		 302 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3020  urease accessory protein UreD  39.42 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1024  urease accessory protein UreD  35.74 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3313  Urease accessory protein UreD  39.26 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1707  Urease accessory protein UreD  41.08 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605089 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3486  urease accessory protein  35.77 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  39.43 
 
 		 283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  39.02 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0397  Urease accessory protein UreD  39 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585213  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0267  urease accessory protein UreD  38.31 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.628784  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0281  urease accessory protein UreD  38.31 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  36.86 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2469  urease accessory protein UreD  41.1 
 
 		 288 aa  126  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0331  urease accessory protein UreD  37.85 
 
 		 283 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2370  urease accessory protein  33.46 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.512779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7013  putative urease accessory protein UreD  35.6 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1212  urease accessory protein UreD  35.63 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0388  urease accessory protein UreD  31.82 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0984  urease accessory protein UreD  35.07 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1238  urease accessory protein UreD  34.5 
 
 		 329 aa  109  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3308  urease accessory protein UreD  33.46 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0886683  normal  0.364033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  31.12 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3697  urease accessory protein UreD  34.44 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1744  urease accessory protein UreD  34.03 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.407934  normal  0.768182 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2062  Urease accessory protein UreD  37.63 
 
 		 315 aa  98.6  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000769283  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0310  urease accessory protein UreD  34.69 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0585  urease accessory protein UreD  33.67 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4890  urease accessory protein UreD  31.48 
 
 		 281 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1955  urease accessory protein UreD  33.95 
 
 		 275 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0957  urease accessory protein UreD  30.77 
 
 		 293 aa  95.5  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0865404  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0977  Urease accessory protein UreD  36.52 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09910  Urease accessory protein UreD  33.64 
 
 		 279 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930917  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4431  urease accessory protein UreD  33.17 
 
 		 281 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2254  urease accessory protein D  32.28 
 
 		 325 aa  93.2  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2444  urease accessory protein UreD  30.85 
 
 		 274 aa  92.8  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792758  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2414  urease accessory protein UreD  29.05 
 
 		 277 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3936  Urease accessory protein UreD  33.97 
 
 		 292 aa  92  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2938  urease accessory protein UreD  27.71 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3101  Urease accessory protein UreD  32.14 
 
 		 277 aa  89  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2624  urease accessory protein D  30.17 
 
 		 327 aa  88.2  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.829261  normal  0.578413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2842  urease accessory protein UreD  29.78 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  34.91 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2847  urease accessory protein UreD  27.02 
 
 		 278 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2718  urease accessory protein UreD  35.71 
 
 		 308 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.274036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2883  urease accessory protein UreD  29.46 
 
 		 296 aa  85.9  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0991  urease accessory protein UreD  29.32 
 
 		 289 aa  85.5  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271998  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4047  urease accessory protein UreD  33 
 
 		 297 aa  85.5  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  29.14 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  30.53 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0953  urease accessory protein UreD  25.99 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2308  urease accessory protein UreD  31.01 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64335  urease accessory protein  33.17 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5585  urease accessory protein  33.17 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1197  urease accessory protein UreD  24.23 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.294974  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0696  urease accessory protein UreD  32.16 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3463  urease accessory protein UreD  26.79 
 
 		 274 aa  82  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000478315  normal  0.195729 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1770  urease accessory protein UreD  29.81 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1186  urease accessory protein UreD  28.66 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3688  putative urease accessory protein  31.25 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139672 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1865  Urease accessory protein UreD  27.1 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.479381 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29781  urease accessory protein UreD  27.55 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2181  urease accessory protein UreD  29.84 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670086  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0727  urease accessory protein UreD  29.84 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2560  urease accessory protein UreD  29.84 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3072  urease accessory protein UreD  29.84 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3108  urease accessory protein UreD  29.84 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2053  urease accessory protein UreD  29.84 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3132  UreD-family accessory protein  29.84 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1499  urease accessory protein UreD  28.57 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0879  urease accessory protein UreD  27.19 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0949  Urease accessory protein UreD  31.18 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2487  urease accessory protein UreD  31.48 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2256  urease accessory protein UreD  28.71 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2036  urease accessory protein ureD  26.83 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.133178  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2188  Urease accessory protein UreD  26.29 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2996  urease accessory protein UreD  28.51 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1812  urease accessory protein UreD  27.75 
 
 		 262 aa  72  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4009  urease accessory protein UreD  27.91 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0424  urease accessory protein UreD  29.01 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0218  urease accessory protein D  24.59 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.842987 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0782  urease accessory protein UreD  28.4 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0903  urease accessory protein UreD  29.01 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1052  urease accessory protein UreD  26.4 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0793  urease accessory protein UreD  28.4 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19231  urease accessory protein UreD  25.87 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.480391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0742  UreD-family accessory protein  26.71 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.16649 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5120  Urease accessory protein UreD  29.27 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1004  urease accessory protein UreD  25.56 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0873  urease accessory protein UreD  27.78 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3971  Urease accessory protein UreD  27.19 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1414  urease accessory protein UreD  24.47 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1683  urease accessory protein UreD  26.15 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6187  urease accessory protein UreD  29.36 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317653  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>