140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0879 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0879  urease accessory protein UreD  100 
 
 
302 aa  622  1e-177  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2996  urease accessory protein UreD  66.2 
 
 
298 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2308  urease accessory protein UreD  61.62 
 
 
313 aa  363  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0218  urease accessory protein D  35.95 
 
 
295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.842987 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  40.64 
 
 
288 aa  182  8.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2444  urease accessory protein UreD  37.37 
 
 
274 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1186  urease accessory protein UreD  35.96 
 
 
305 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2036  urease accessory protein ureD  38.7 
 
 
295 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.133178  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1865  Urease accessory protein UreD  38.03 
 
 
295 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.479381 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0953  urease accessory protein UreD  37.06 
 
 
312 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00886  putative urease accessory protein UreD  34.13 
 
 
320 aa  167  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2883  urease accessory protein UreD  40.07 
 
 
296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  38.6 
 
 
293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2991  urease accessory protein UreD  37.04 
 
 
313 aa  165  6.9999999999999995e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.866149 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2188  Urease accessory protein UreD  37.05 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2181  urease accessory protein UreD  36.97 
 
 
291 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3132  UreD-family accessory protein  36.97 
 
 
346 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0727  urease accessory protein UreD  36.97 
 
 
291 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2560  urease accessory protein UreD  36.97 
 
 
291 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3072  urease accessory protein UreD  36.97 
 
 
291 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3108  urease accessory protein UreD  36.97 
 
 
291 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2053  urease accessory protein UreD  36.97 
 
 
291 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3101  Urease accessory protein UreD  37.54 
 
 
277 aa  162  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3463  urease accessory protein UreD  37.72 
 
 
274 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000478315  normal  0.195729 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4431  urease accessory protein UreD  39.57 
 
 
281 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645112  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1770  urease accessory protein UreD  35.59 
 
 
285 aa  159  7e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64335  urease accessory protein  40.22 
 
 
280 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164957  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5585  urease accessory protein  40.22 
 
 
280 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4890  urease accessory protein UreD  39.35 
 
 
281 aa  158  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1499  urease accessory protein UreD  35.56 
 
 
321 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09910  Urease accessory protein UreD  39.49 
 
 
279 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930917  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0696  urease accessory protein UreD  38.77 
 
 
278 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0957  urease accessory protein UreD  35.31 
 
 
293 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0865404  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2414  urease accessory protein UreD  36.55 
 
 
277 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0742  UreD-family accessory protein  37.71 
 
 
341 aa  152  7e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.16649 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0793  urease accessory protein UreD  36.24 
 
 
291 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0585  urease accessory protein UreD  38.77 
 
 
279 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0991  urease accessory protein UreD  34.62 
 
 
289 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271998  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0949  Urease accessory protein UreD  35.95 
 
 
293 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0903  urease accessory protein UreD  35.34 
 
 
291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3376  urease accessory protein UreD  35.21 
 
 
276 aa  146  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0782  urease accessory protein UreD  35.54 
 
 
291 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2938  urease accessory protein UreD  35.48 
 
 
277 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  32.61 
 
 
279 aa  145  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0873  urease accessory protein UreD  35.69 
 
 
291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3688  putative urease accessory protein  34 
 
 
293 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.139672 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1197  urease accessory protein UreD  32.75 
 
 
301 aa  145  8.000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.294974  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3936  Urease accessory protein UreD  35.59 
 
 
292 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0424  urease accessory protein UreD  34.98 
 
 
291 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4009  urease accessory protein UreD  34.98 
 
 
291 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2487  urease accessory protein UreD  34.28 
 
 
291 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1238  urease accessory protein UreD  32.37 
 
 
329 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3971  Urease accessory protein UreD  33.92 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2847  urease accessory protein UreD  35.13 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598121  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2842  urease accessory protein UreD  34.77 
 
 
277 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1092  urease accessory protein UreD  33.57 
 
 
278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2256  urease accessory protein UreD  33.45 
 
 
293 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1390  urease accessory protein UreD  35.31 
 
 
276 aa  136  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  33.21 
 
 
284 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1414  urease accessory protein UreD  32.87 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.421382 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1004  urease accessory protein UreD  32.17 
 
 
276 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1082  urease accessory protein UreD  37.78 
 
 
276 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0989  urease accessory protein UreD  29.97 
 
 
298 aa  119  9e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  30.95 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1707  Urease accessory protein UreD  29.43 
 
 
286 aa  92.8  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605089 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  30.38 
 
 
283 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3209  Urease accessory protein UreD  32.44 
 
 
266 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0397  Urease accessory protein UreD  29.81 
 
 
280 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585213  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1052  urease accessory protein UreD  29.52 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2455  urease accessory protein UreD  30.51 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3486  urease accessory protein  27.39 
 
 
278 aa  84.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  29.13 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3020  urease accessory protein UreD  31.17 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2469  urease accessory protein UreD  35.8 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229131  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19231  urease accessory protein UreD  28.92 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.480391  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2254  urease accessory protein D  26.78 
 
 
325 aa  82.4  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2624  urease accessory protein D  27.07 
 
 
327 aa  82  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.829261  normal  0.578413 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29781  urease accessory protein UreD  30.43 
 
 
299 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4154  urease accessory protein UreD  34.87 
 
 
289 aa  82  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3245  Urease accessory protein UreD  30.74 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1212  urease accessory protein UreD  30.89 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1024  urease accessory protein UreD  32.14 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08921  urease accessory protein UreD  27.15 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00733999  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08901  urease accessory protein UreD  24.81 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.697976  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2370  urease accessory protein  29.57 
 
 
281 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.512779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2214  urease accessory protein UreD  28.38 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00280053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7013  putative urease accessory protein UreD  35.25 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2014  Urease accessory protein UreD  27.19 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5120  Urease accessory protein UreD  30.4 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0683  urease accessory protein UreD  29.17 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2680  urease accessory protein UreD  25.34 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0331  urease accessory protein UreD  34.92 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3057  Urease accessory protein UreD  28.66 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0833  urease accessory protein UreD  27.85 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0267  urease accessory protein UreD  27.69 
 
 
280 aa  68.9  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.628784  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3308  urease accessory protein UreD  29.73 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0886683  normal  0.364033 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0281  urease accessory protein UreD  27.69 
 
 
280 aa  68.9  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0984  urease accessory protein UreD  30.3 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130155  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3313  Urease accessory protein UreD  31.16 
 
 
273 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3697  urease accessory protein UreD  40 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>