152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0181 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  100 
 
 
293 aa  581  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3101  Urease accessory protein UreD  53.79 
 
 
277 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2414  urease accessory protein UreD  45.79 
 
 
277 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0991  urease accessory protein UreD  42.61 
 
 
289 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271998  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2938  urease accessory protein UreD  42.49 
 
 
277 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  42.6 
 
 
288 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3463  urease accessory protein UreD  43.37 
 
 
274 aa  206  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000478315  normal  0.195729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2842  urease accessory protein UreD  42.86 
 
 
277 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2847  urease accessory protein UreD  42.49 
 
 
278 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598121  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09910  Urease accessory protein UreD  45.2 
 
 
279 aa  198  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930917  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3936  Urease accessory protein UreD  43.77 
 
 
292 aa  195  7e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1865  Urease accessory protein UreD  39.45 
 
 
295 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.479381 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0696  urease accessory protein UreD  43.01 
 
 
278 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2188  Urease accessory protein UreD  38.75 
 
 
295 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0957  urease accessory protein UreD  37.98 
 
 
293 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0865404  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2036  urease accessory protein ureD  38.41 
 
 
295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.133178  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2996  urease accessory protein UreD  44.13 
 
 
298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3688  putative urease accessory protein  38.68 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.139672 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4890  urease accessory protein UreD  39.35 
 
 
281 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64335  urease accessory protein  41.91 
 
 
280 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164957  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5585  urease accessory protein  41.91 
 
 
280 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2883  urease accessory protein UreD  38.98 
 
 
296 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0585  urease accessory protein UreD  40.65 
 
 
279 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0782  urease accessory protein UreD  38.41 
 
 
291 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0793  urease accessory protein UreD  38.41 
 
 
291 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2444  urease accessory protein UreD  36.36 
 
 
274 aa  178  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792758  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2181  urease accessory protein UreD  38.35 
 
 
291 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670086  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0727  urease accessory protein UreD  38.35 
 
 
291 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2560  urease accessory protein UreD  38.35 
 
 
291 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3072  urease accessory protein UreD  38.35 
 
 
291 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3108  urease accessory protein UreD  38.35 
 
 
291 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2053  urease accessory protein UreD  38.35 
 
 
291 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4431  urease accessory protein UreD  38.49 
 
 
281 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645112  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3132  UreD-family accessory protein  38.35 
 
 
346 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2487  urease accessory protein UreD  38.63 
 
 
291 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3376  urease accessory protein UreD  41.01 
 
 
276 aa  175  8e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2256  urease accessory protein UreD  38.13 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0218  urease accessory protein D  38.14 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.842987 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0742  UreD-family accessory protein  41.26 
 
 
341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.16649 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1770  urease accessory protein UreD  36.43 
 
 
285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3971  Urease accessory protein UreD  39.43 
 
 
276 aa  172  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0873  urease accessory protein UreD  38.27 
 
 
291 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4009  urease accessory protein UreD  37.91 
 
 
291 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0953  urease accessory protein UreD  36.97 
 
 
312 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1499  urease accessory protein UreD  37.28 
 
 
321 aa  169  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1004  urease accessory protein UreD  40.21 
 
 
276 aa  169  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0903  urease accessory protein UreD  37.55 
 
 
291 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2308  urease accessory protein UreD  39.72 
 
 
313 aa  168  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1186  urease accessory protein UreD  38.49 
 
 
305 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0949  Urease accessory protein UreD  38.1 
 
 
293 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0879  urease accessory protein UreD  38.6 
 
 
302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1197  urease accessory protein UreD  32.61 
 
 
301 aa  166  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.294974  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0424  urease accessory protein UreD  37.18 
 
 
291 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1238  urease accessory protein UreD  34.49 
 
 
329 aa  158  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00886  putative urease accessory protein UreD  32.03 
 
 
320 aa  156  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1092  urease accessory protein UreD  37.32 
 
 
278 aa  155  8e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  35.11 
 
 
279 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1390  urease accessory protein UreD  38.71 
 
 
276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1414  urease accessory protein UreD  37.77 
 
 
276 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.421382 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2991  urease accessory protein UreD  34 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.866149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1082  urease accessory protein UreD  39.43 
 
 
276 aa  143  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  34.55 
 
 
284 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1024  urease accessory protein UreD  33.91 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0989  urease accessory protein UreD  27.42 
 
 
298 aa  106  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2254  urease accessory protein D  31.03 
 
 
325 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29781  urease accessory protein UreD  30.53 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1707  Urease accessory protein UreD  32.35 
 
 
286 aa  98.2  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605089 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2680  urease accessory protein UreD  30.64 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2214  urease accessory protein UreD  32.32 
 
 
282 aa  89  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00280053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2062  Urease accessory protein UreD  30.11 
 
 
315 aa  89  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000769283  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0397  Urease accessory protein UreD  33.08 
 
 
280 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585213  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2014  Urease accessory protein UreD  34.91 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3209  Urease accessory protein UreD  30.68 
 
 
266 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3245  Urease accessory protein UreD  29.57 
 
 
309 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19231  urease accessory protein UreD  27.24 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.480391  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2370  urease accessory protein  31.42 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.512779 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1052  urease accessory protein UreD  26.37 
 
 
307 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4154  urease accessory protein UreD  30.95 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2455  urease accessory protein UreD  26.71 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5120  Urease accessory protein UreD  27.8 
 
 
311 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_004310  BR1362  urease accessory protein UreD  27.62 
 
 
302 aa  82  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1463  Urease accessory protein UreD  27.68 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2718  urease accessory protein UreD  29.45 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.274036  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1301  urease accessory protein UreD  27.68 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1318  urease accessory protein UreD  27.27 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3020  urease accessory protein UreD  29.57 
 
 
338 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3057  Urease accessory protein UreD  31.22 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08921  urease accessory protein UreD  23.18 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00733999  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08901  urease accessory protein UreD  22.26 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.697976  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2624  urease accessory protein D  30.51 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.829261  normal  0.578413 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0833  urease accessory protein UreD  22.84 
 
 
300 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  29.79 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1555  Urease accessory protein UreD  29.09 
 
 
315 aa  75.9  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3658  urease accessory protein UreD  21.37 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2469  urease accessory protein UreD  31.17 
 
 
288 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229131  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1137  urease accessory protein UreD  27.46 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1083  urease accessory protein UreD  27.46 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1744  urease accessory protein UreD  30.71 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.407934  normal  0.768182 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3486  urease accessory protein  32.5 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0331  urease accessory protein UreD  36.13 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>