147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2273 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  100 
 
 
284 aa  580  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  60.07 
 
 
279 aa  349  3e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1770  urease accessory protein UreD  37.64 
 
 
285 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1865  Urease accessory protein UreD  39.29 
 
 
295 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.479381 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2036  urease accessory protein ureD  39.39 
 
 
295 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.133178  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2188  Urease accessory protein UreD  38.21 
 
 
295 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4431  urease accessory protein UreD  37.5 
 
 
281 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645112  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1238  urease accessory protein UreD  35.14 
 
 
329 aa  175  8e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  35.84 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09910  Urease accessory protein UreD  37.64 
 
 
279 aa  172  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930917  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2883  urease accessory protein UreD  38.1 
 
 
296 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4890  urease accessory protein UreD  36.4 
 
 
281 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2444  urease accessory protein UreD  35.16 
 
 
274 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792758  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2487  urease accessory protein UreD  39.57 
 
 
291 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2256  urease accessory protein UreD  43.84 
 
 
293 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0793  urease accessory protein UreD  38.27 
 
 
291 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4009  urease accessory protein UreD  39.57 
 
 
291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64335  urease accessory protein  36.26 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164957  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5585  urease accessory protein  36.26 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0696  urease accessory protein UreD  36.76 
 
 
278 aa  166  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0903  urease accessory protein UreD  44.22 
 
 
291 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0782  urease accessory protein UreD  37.91 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0991  urease accessory protein UreD  37.59 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271998  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0424  urease accessory protein UreD  43.94 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2624  urease accessory protein D  40.07 
 
 
327 aa  163  3e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.829261  normal  0.578413 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0873  urease accessory protein UreD  37.55 
 
 
291 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0957  urease accessory protein UreD  35.36 
 
 
293 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0865404  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0585  urease accessory protein UreD  35.66 
 
 
279 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0949  Urease accessory protein UreD  34.06 
 
 
293 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2181  urease accessory protein UreD  37.86 
 
 
291 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3132  UreD-family accessory protein  38.87 
 
 
346 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0727  urease accessory protein UreD  37.86 
 
 
291 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2560  urease accessory protein UreD  37.86 
 
 
291 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3072  urease accessory protein UreD  37.86 
 
 
291 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3108  urease accessory protein UreD  37.86 
 
 
291 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2053  urease accessory protein UreD  37.86 
 
 
291 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2414  urease accessory protein UreD  36.23 
 
 
277 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1499  urease accessory protein UreD  37.14 
 
 
321 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1186  urease accessory protein UreD  35.52 
 
 
305 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0218  urease accessory protein D  34.06 
 
 
295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.842987 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3688  putative urease accessory protein  37.8 
 
 
293 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.139672 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1052  urease accessory protein UreD  33.45 
 
 
307 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2938  urease accessory protein UreD  35.69 
 
 
277 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19231  urease accessory protein UreD  32.77 
 
 
307 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.480391  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2254  urease accessory protein D  37.63 
 
 
325 aa  145  8.000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29781  urease accessory protein UreD  35.69 
 
 
299 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0953  urease accessory protein UreD  31.83 
 
 
312 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3101  Urease accessory protein UreD  33.69 
 
 
277 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3936  Urease accessory protein UreD  33.09 
 
 
292 aa  142  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1197  urease accessory protein UreD  31.16 
 
 
301 aa  142  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.294974  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2842  urease accessory protein UreD  35.19 
 
 
277 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2847  urease accessory protein UreD  35.44 
 
 
278 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598121  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1004  urease accessory protein UreD  32.29 
 
 
276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3463  urease accessory protein UreD  34.3 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000478315  normal  0.195729 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2308  urease accessory protein UreD  32.86 
 
 
313 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2996  urease accessory protein UreD  36.2 
 
 
298 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0742  UreD-family accessory protein  39.81 
 
 
341 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.16649 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  34.55 
 
 
293 aa  136  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3971  Urease accessory protein UreD  32.01 
 
 
276 aa  135  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0879  urease accessory protein UreD  33.21 
 
 
302 aa  135  8e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1414  urease accessory protein UreD  32.14 
 
 
276 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.421382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1092  urease accessory protein UreD  32.5 
 
 
278 aa  133  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3376  urease accessory protein UreD  30.71 
 
 
276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1024  urease accessory protein UreD  31.93 
 
 
289 aa  127  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2991  urease accessory protein UreD  30.69 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.866149 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00886  putative urease accessory protein UreD  27.43 
 
 
320 aa  121  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1390  urease accessory protein UreD  30.11 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08921  urease accessory protein UreD  29 
 
 
300 aa  119  7e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00733999  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08901  urease accessory protein UreD  28.52 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.697976  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2062  Urease accessory protein UreD  31.78 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000769283  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0833  urease accessory protein UreD  30.47 
 
 
300 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1082  urease accessory protein UreD  29.18 
 
 
276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0683  urease accessory protein UreD  26.49 
 
 
274 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3209  Urease accessory protein UreD  31.15 
 
 
266 aa  106  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4154  urease accessory protein UreD  31.4 
 
 
289 aa  105  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  32.53 
 
 
279 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  32.91 
 
 
283 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2455  urease accessory protein UreD  34.26 
 
 
287 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2469  urease accessory protein UreD  32.78 
 
 
288 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229131  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3020  urease accessory protein UreD  29.23 
 
 
338 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3245  Urease accessory protein UreD  28.85 
 
 
309 aa  99  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3486  urease accessory protein  28.52 
 
 
278 aa  98.6  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7013  putative urease accessory protein UreD  28.46 
 
 
278 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  28.95 
 
 
305 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2680  urease accessory protein UreD  31.84 
 
 
302 aa  95.5  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1707  Urease accessory protein UreD  27.34 
 
 
286 aa  93.2  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605089 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0397  Urease accessory protein UreD  30.83 
 
 
280 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585213  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2214  urease accessory protein UreD  33.68 
 
 
282 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00280053 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2767  Urease accessory protein UreD  26.15 
 
 
271 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2370  urease accessory protein  30.11 
 
 
281 aa  91.3  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.512779 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3658  urease accessory protein UreD  21.77 
 
 
273 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0267  urease accessory protein UreD  34.39 
 
 
280 aa  90.5  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.628784  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0281  urease accessory protein UreD  34.39 
 
 
280 aa  90.5  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2718  urease accessory protein UreD  30.23 
 
 
308 aa  89.4  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.274036  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4047  urease accessory protein UreD  30.23 
 
 
297 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1744  urease accessory protein UreD  32.56 
 
 
250 aa  88.6  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.407934  normal  0.768182 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0388  urease accessory protein UreD  30.04 
 
 
297 aa  88.2  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784238  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03480  urease accessory protein UreH  26.97 
 
 
284 aa  88.2  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2389  urease accessory protein UreD  31.35 
 
 
277 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.274527 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3697  urease accessory protein UreD  31.84 
 
 
277 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>