111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2991 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2991  urease accessory protein UreD  100 
 
 		 313 aa  652    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.866149 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00886  putative urease accessory protein UreD  54.19 
 
 		 320 aa  345  5e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0953  urease accessory protein UreD  40.13 
 
 		 312 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  37.54 
 
 		 288 aa  192  7e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2444  urease accessory protein UreD  34.48 
 
 		 274 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792758  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0218  urease accessory protein D  33.87 
 
 		 295 aa  176  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.842987 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0879  urease accessory protein UreD  37.04 
 
 		 302 aa  176  6e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09910  Urease accessory protein UreD  36.08 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930917  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2996  urease accessory protein UreD  36.3 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3936  Urease accessory protein UreD  33.33 
 
 		 292 aa  169  8e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2308  urease accessory protein UreD  34.54 
 
 		 313 aa  165  8e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1770  urease accessory protein UreD  30.64 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0696  urease accessory protein UreD  34.58 
 
 		 278 aa  159  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1238  urease accessory protein UreD  30.79 
 
 		 329 aa  157  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3463  urease accessory protein UreD  34.24 
 
 		 274 aa  157  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000478315  normal  0.195729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0585  urease accessory protein UreD  34.55 
 
 		 279 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64335  urease accessory protein  34.36 
 
 		 280 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5585  urease accessory protein  34.36 
 
 		 280 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  34 
 
 		 293 aa  155  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4890  urease accessory protein UreD  33.89 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2883  urease accessory protein UreD  32.76 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1186  urease accessory protein UreD  31.75 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4431  urease accessory protein UreD  34.22 
 
 		 281 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3971  Urease accessory protein UreD  32.19 
 
 		 276 aa  148  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2938  urease accessory protein UreD  34.36 
 
 		 277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3376  urease accessory protein UreD  34.19 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1197  urease accessory protein UreD  30.21 
 
 		 301 aa  146  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.294974  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3101  Urease accessory protein UreD  31.38 
 
 		 277 aa  145  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2414  urease accessory protein UreD  32.99 
 
 		 277 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2842  urease accessory protein UreD  33.45 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2847  urease accessory protein UreD  33.33 
 
 		 278 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  29.33 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  30.69 
 
 		 284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1004  urease accessory protein UreD  30.34 
 
 		 276 aa  135  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0742  UreD-family accessory protein  31.45 
 
 		 341 aa  135  9e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.16649 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2036  urease accessory protein ureD  29.45 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.133178  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3688  putative urease accessory protein  28.28 
 
 		 293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139672 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2256  urease accessory protein UreD  28.42 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0949  Urease accessory protein UreD  28.52 
 
 		 293 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1499  urease accessory protein UreD  28.09 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1865  Urease accessory protein UreD  28.97 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.479381 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1092  urease accessory protein UreD  31.19 
 
 		 278 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1414  urease accessory protein UreD  30.34 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421382 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2188  Urease accessory protein UreD  28.62 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0957  urease accessory protein UreD  27.74 
 
 		 293 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0865404  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2181  urease accessory protein UreD  27.74 
 
 		 291 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3132  UreD-family accessory protein  27.74 
 
 		 346 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0727  urease accessory protein UreD  27.74 
 
 		 291 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2560  urease accessory protein UreD  27.74 
 
 		 291 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3072  urease accessory protein UreD  27.74 
 
 		 291 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3108  urease accessory protein UreD  27.74 
 
 		 291 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2053  urease accessory protein UreD  27.74 
 
 		 291 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0991  urease accessory protein UreD  27.84 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271998  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1082  urease accessory protein UreD  31.2 
 
 		 276 aa  116  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1390  urease accessory protein UreD  29.17 
 
 		 276 aa  115  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0782  urease accessory protein UreD  25.99 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4009  urease accessory protein UreD  26.67 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2487  urease accessory protein UreD  26.67 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0793  urease accessory protein UreD  25.66 
 
 		 291 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0989  urease accessory protein UreD  28.81 
 
 		 298 aa  105  8e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0873  urease accessory protein UreD  26.67 
 
 		 291 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0903  urease accessory protein UreD  25.67 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0424  urease accessory protein UreD  24.67 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4154  urease accessory protein UreD  26.81 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2254  urease accessory protein D  25.65 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1052  urease accessory protein UreD  25.82 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1024  urease accessory protein UreD  25.66 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19231  urease accessory protein UreD  26.02 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.480391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29781  urease accessory protein UreD  23.47 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2062  Urease accessory protein UreD  23.47 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000769283  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0397  Urease accessory protein UreD  24.48 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585213  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2214  urease accessory protein UreD  23.83 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00280053 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2624  urease accessory protein D  23.05 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.829261  normal  0.578413 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  25.71 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3308  urease accessory protein UreD  22.94 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0886683  normal  0.364033 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1875  urease accessory protein UreD  23.81 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.37143  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  22.99 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2680  urease accessory protein UreD  26.54 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08901  urease accessory protein UreD  23.73 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.697976  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2014  Urease accessory protein UreD  25.31 
 
 		 282 aa  62.4  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0833  urease accessory protein UreD  23.29 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3209  Urease accessory protein UreD  22.03 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3057  Urease accessory protein UreD  23.11 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  26.12 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08921  urease accessory protein UreD  22.41 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00733999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2767  Urease accessory protein UreD  26.51 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3313  Urease accessory protein UreD  21.5 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2469  urease accessory protein UreD  21.94 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3245  Urease accessory protein UreD  22.31 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2389  urease accessory protein UreD  22.61 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.274527 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3486  urease accessory protein  23.44 
 
 		 278 aa  57  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0329  urease accessory protein  22.88 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2455  urease accessory protein UreD  24.91 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4212  urease accessory protein UreD  26.13 
 
 		 272 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3658  urease accessory protein UreD  20 
 
 		 273 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3697  urease accessory protein UreD  26.55 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2318  urease accessory protein UreD  25.53 
 
 		 278 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00527457  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2361  urease accessory protein UreD  25.53 
 
 		 278 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.361313  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3020  urease accessory protein UreD  21.51 
 
 		 338 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1555  Urease accessory protein UreD  19.8 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>