132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_08901 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_08901  urease accessory protein UreD  100 
 
 		 300 aa  611  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.697976  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0833  urease accessory protein UreD  93.33 
 
 		 300 aa  551  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08921  urease accessory protein UreD  93.33 
 
 		 300 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00733999  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1052  urease accessory protein UreD  40.74 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19231  urease accessory protein UreD  40.07 
 
 		 307 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.480391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29781  urease accessory protein UreD  38.7 
 
 		 299 aa  241  9e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2624  urease accessory protein D  38.14 
 
 		 327 aa  239  2.9999999999999997e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.829261  normal  0.578413 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2254  urease accessory protein D  37.11 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  30.55 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  28.52 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0218  urease accessory protein D  29.23 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.842987 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2444  urease accessory protein UreD  26.64 
 
 		 274 aa  96.3  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792758  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64335  urease accessory protein  26.07 
 
 		 280 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5585  urease accessory protein  26.07 
 
 		 280 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0953  urease accessory protein UreD  26.98 
 
 		 312 aa  93.6  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1770  urease accessory protein UreD  26.75 
 
 		 285 aa  93.2  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0696  urease accessory protein UreD  24.51 
 
 		 278 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  25.54 
 
 		 288 aa  92.8  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09910  Urease accessory protein UreD  23.11 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930917  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4890  urease accessory protein UreD  26.43 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1092  urease accessory protein UreD  22.37 
 
 		 278 aa  90.5  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  22.26 
 
 		 293 aa  89.4  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0585  urease accessory protein UreD  23.76 
 
 		 279 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1238  urease accessory protein UreD  26.29 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3936  Urease accessory protein UreD  21.91 
 
 		 292 aa  87.4  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3463  urease accessory protein UreD  25.26 
 
 		 274 aa  87  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000478315  normal  0.195729 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2883  urease accessory protein UreD  23.13 
 
 		 296 aa  86.3  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1024  urease accessory protein UreD  24.6 
 
 		 289 aa  86.3  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3313  Urease accessory protein UreD  29.86 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0879  urease accessory protein UreD  23.71 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  27.78 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1197  urease accessory protein UreD  26.32 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.294974  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2414  urease accessory protein UreD  23.34 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2938  urease accessory protein UreD  23.69 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2256  urease accessory protein UreD  23.05 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0742  UreD-family accessory protein  26.44 
 
 		 341 aa  82.8  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.16649 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3057  Urease accessory protein UreD  30.2 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2469  urease accessory protein UreD  29.14 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4431  urease accessory protein UreD  25.21 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00886  putative urease accessory protein UreD  23.76 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0991  urease accessory protein UreD  22.54 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271998  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0989  urease accessory protein UreD  25.89 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3209  Urease accessory protein UreD  24.26 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0793  urease accessory protein UreD  22.86 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0949  Urease accessory protein UreD  21.22 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2847  urease accessory protein UreD  23.17 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598121  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2842  urease accessory protein UreD  23.85 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  31.62 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2181  urease accessory protein UreD  21.92 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3132  UreD-family accessory protein  21.92 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0727  urease accessory protein UreD  21.92 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2560  urease accessory protein UreD  21.92 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3072  urease accessory protein UreD  21.92 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3108  urease accessory protein UreD  21.92 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2053  urease accessory protein UreD  21.92 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2767  Urease accessory protein UreD  28.09 
 
 		 271 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1362  urease accessory protein UreD  24.4 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3101  Urease accessory protein UreD  20.61 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1865  Urease accessory protein UreD  23.93 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.479381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1186  urease accessory protein UreD  28 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1499  urease accessory protein UreD  22.6 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  30.4 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0782  urease accessory protein UreD  22.5 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3020  urease accessory protein UreD  29.08 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0873  urease accessory protein UreD  22.14 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3658  urease accessory protein UreD  25.52 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0903  urease accessory protein UreD  21.79 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4009  urease accessory protein UreD  21.43 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3245  Urease accessory protein UreD  25 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2487  urease accessory protein UreD  20.75 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2188  Urease accessory protein UreD  23.26 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3486  urease accessory protein  21.65 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0424  urease accessory protein UreD  21.43 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2680  urease accessory protein UreD  23.97 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2996  urease accessory protein UreD  21.03 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2389  urease accessory protein UreD  26.2 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.274527 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3971  Urease accessory protein UreD  23.12 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1318  urease accessory protein UreD  23.71 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2036  urease accessory protein ureD  26.95 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.133178  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1707  Urease accessory protein UreD  22.07 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605089 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7013  putative urease accessory protein UreD  29.31 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0957  urease accessory protein UreD  21.4 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0865404  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1390  urease accessory protein UreD  23.12 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2318  urease accessory protein UreD  24.82 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00527457  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2361  urease accessory protein UreD  24.82 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.361313  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0683  urease accessory protein UreD  27.19 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3308  urease accessory protein UreD  27.86 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0886683  normal  0.364033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3376  urease accessory protein UreD  24.18 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2370  urease accessory protein  24.55 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.512779 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1875  urease accessory protein UreD  24.25 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.37143  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1082  urease accessory protein UreD  25.66 
 
 		 276 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03480  urease accessory protein UreH  23.67 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2308  urease accessory protein UreD  23.12 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0331  urease accessory protein UreD  26.83 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3688  putative urease accessory protein  20.64 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1414  urease accessory protein UreD  23.23 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421382 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0388  urease accessory protein UreD  24.66 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1812  urease accessory protein UreD  27.33 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0267  urease accessory protein UreD  23.67 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.628784  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0281  urease accessory protein UreD  23.67 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>