131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2318 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2318  urease accessory protein UreD  100 
 
 		 278 aa  573  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00527457  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2361  urease accessory protein UreD  100 
 
 		 278 aa  573  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.361313  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1875  urease accessory protein UreD  68.71 
 
 		 278 aa  419  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.37143  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2767  Urease accessory protein UreD  38.83 
 
 		 271 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3658  urease accessory protein UreD  38.97 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0683  urease accessory protein UreD  36.63 
 
 		 274 aa  202  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0396  Urease accessory protein UreD  34.41 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0247  urease accessory protein UreD  34.77 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03480  urease accessory protein UreH  31.07 
 
 		 284 aa  155  9e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0473  urease accessory protein UreD  28.79 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.744472  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1812  urease accessory protein UreD  27.35 
 
 		 262 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0329  urease accessory protein  28.21 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2718  urease accessory protein UreD  26.19 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.274036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4831  urease accessory protein UreD  26.79 
 
 		 277 aa  102  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1362  urease accessory protein UreD  26.57 
 
 		 302 aa  95.5  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2062  Urease accessory protein UreD  25.64 
 
 		 315 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000769283  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1318  urease accessory protein UreD  26.09 
 
 		 302 aa  92.4  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1555  Urease accessory protein UreD  26.79 
 
 		 315 aa  89.7  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2455  urease accessory protein UreD  25.42 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1083  urease accessory protein UreD  25.31 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1137  urease accessory protein UreD  25.31 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1301  urease accessory protein UreD  29.79 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1463  Urease accessory protein UreD  29.79 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4212  urease accessory protein UreD  20.87 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3688  putative urease accessory protein  21.57 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5120  Urease accessory protein UreD  28.57 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3101  Urease accessory protein UreD  25.41 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4047  urease accessory protein UreD  29.93 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  21.83 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02144  urease accessory protein UreD (AFU_orthologue; AFUA_2G16070)  26.34 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0749  urease accessory protein UreD  25.23 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2256  urease accessory protein UreD  21.23 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4890  urease accessory protein UreD  28.57 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  24.68 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4414  Urease accessory protein UreD  24.15 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0977  Urease accessory protein UreD  26 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1197  urease accessory protein UreD  21.74 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.294974  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3463  urease accessory protein UreD  25.61 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000478315  normal  0.195729 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1238  urease accessory protein UreD  26.03 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1478  Urease accessory protein UreD  21.58 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0751352  normal  0.245102 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0724  Urease accessory protein UreD  26.28 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0949  Urease accessory protein UreD  20.24 
 
 		 293 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1264  urease accessory protein  23.68 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.647303 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0585  urease accessory protein UreD  27.01 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2938  urease accessory protein UreD  22.14 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0742  UreD-family accessory protein  22.44 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.16649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4431  urease accessory protein UreD  27.27 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2842  urease accessory protein UreD  21.88 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1052  urease accessory protein UreD  24.66 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19231  urease accessory protein UreD  24.55 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.480391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64335  urease accessory protein  25.39 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5585  urease accessory protein  25.39 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2036  urease accessory protein ureD  19 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.133178  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0696  urease accessory protein UreD  23.53 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7013  putative urease accessory protein UreD  25.96 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2847  urease accessory protein UreD  24.72 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0991  urease accessory protein UreD  18.25 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271998  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2996  urease accessory protein UreD  24.05 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  21.58 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08901  urease accessory protein UreD  24.82 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.697976  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0953  urease accessory protein UreD  23.5 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  23.5 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  25.69 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09910  Urease accessory protein UreD  25 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930917  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2308  urease accessory protein UreD  23.78 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3020  urease accessory protein UreD  20.98 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2414  urease accessory protein UreD  25.29 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0424  urease accessory protein UreD  22.89 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08921  urease accessory protein UreD  25.28 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00733999  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00886  putative urease accessory protein UreD  22.61 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0903  urease accessory protein UreD  22.11 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3313  Urease accessory protein UreD  24.64 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3245  Urease accessory protein UreD  20.54 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1770  urease accessory protein UreD  24.24 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1092  urease accessory protein UreD  21.05 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3376  urease accessory protein UreD  24.32 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1390  urease accessory protein UreD  25.33 
 
 		 276 aa  57  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2188  Urease accessory protein UreD  19.62 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  22.22 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3209  Urease accessory protein UreD  20.54 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4009  urease accessory protein UreD  25.33 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0873  urease accessory protein UreD  22.39 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0957  urease accessory protein UreD  18.58 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0865404  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1865  Urease accessory protein UreD  18.87 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.479381 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2487  urease accessory protein UreD  25.33 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0833  urease accessory protein UreD  24.11 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0218  urease accessory protein D  25 
 
 		 295 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.842987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0397  Urease accessory protein UreD  24.81 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585213  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  19.85 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1082  urease accessory protein UreD  19.82 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0782  urease accessory protein UreD  25.17 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2991  urease accessory protein UreD  24.84 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.866149 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0793  urease accessory protein UreD  25.17 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2014  Urease accessory protein UreD  21.6 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2181  urease accessory protein UreD  20.34 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670086  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3057  Urease accessory protein UreD  22.63 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0727  urease accessory protein UreD  20.34 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2560  urease accessory protein UreD  20.34 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3072  urease accessory protein UreD  20.34 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3108  urease accessory protein UreD  20.34 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>