122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1137 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1083  urease accessory protein UreD  100 
 
 		 321 aa  670    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1137  urease accessory protein UreD  100 
 
 		 321 aa  670    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1362  urease accessory protein UreD  51.68 
 
 		 302 aa  341  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1318  urease accessory protein UreD  51.01 
 
 		 302 aa  336  1.9999999999999998e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1463  Urease accessory protein UreD  47.83 
 
 		 311 aa  291  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1301  urease accessory protein UreD  47.83 
 
 		 311 aa  291  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5120  Urease accessory protein UreD  47 
 
 		 311 aa  291  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2062  Urease accessory protein UreD  33.99 
 
 		 315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000769283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2718  urease accessory protein UreD  31.31 
 
 		 308 aa  155  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.274036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1555  Urease accessory protein UreD  30.82 
 
 		 315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1683  urease accessory protein UreD  27.27 
 
 		 273 aa  102  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0991  urease accessory protein UreD  28.21 
 
 		 289 aa  90.1  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271998  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1812  urease accessory protein UreD  26.19 
 
 		 262 aa  89  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4212  urease accessory protein UreD  36.3 
 
 		 272 aa  89  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0396  Urease accessory protein UreD  25.75 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3658  urease accessory protein UreD  25.33 
 
 		 273 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1865  Urease accessory protein UreD  29.75 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.479381 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2318  urease accessory protein UreD  25.31 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00527457  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2361  urease accessory protein UreD  25.31 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.361313  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6187  urease accessory protein UreD  26.42 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1875  urease accessory protein UreD  23.38 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.37143  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2188  Urease accessory protein UreD  30.04 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4414  Urease accessory protein UreD  25.58 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2036  urease accessory protein ureD  27.76 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.133178  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0683  urease accessory protein UreD  25.12 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1138  Urease accessory protein UreD  24.91 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0957  urease accessory protein UreD  24.83 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0865404  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0329  urease accessory protein  24.26 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03480  urease accessory protein UreH  27.2 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2938  urease accessory protein UreD  27.24 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  27.46 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2414  urease accessory protein UreD  25.71 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2195  urease accessory protein UreD  24.23 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00406195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0247  urease accessory protein UreD  24.88 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2767  Urease accessory protein UreD  21.48 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1964  putative urease accessory protein ureD  28.1 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0749  urease accessory protein UreD  25.71 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2842  urease accessory protein UreD  27.76 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2847  urease accessory protein UreD  27.5 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4047  urease accessory protein UreD  28.64 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0724  Urease accessory protein UreD  23.35 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2408  urease accessory protein UreD  22.69 
 
 		 256 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.815614  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0473  urease accessory protein UreD  25.71 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.744472  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  22.1 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1359  Urease accessory protein UreD  25.09 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1199  urease accessory protein UreD  24.72 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1238  urease accessory protein UreD  28.34 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  34.81 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1186  urease accessory protein UreD  23.05 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2455  urease accessory protein UreD  22.81 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4009  urease accessory protein UreD  27.57 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0949  Urease accessory protein UreD  30.3 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3688  putative urease accessory protein  29.35 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139672 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2883  urease accessory protein UreD  25.99 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2308  urease accessory protein UreD  26.74 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0424  urease accessory protein UreD  26.76 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0903  urease accessory protein UreD  26.64 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0977  Urease accessory protein UreD  32.2 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3936  Urease accessory protein UreD  29.23 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  22.86 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09910  Urease accessory protein UreD  26.83 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4440  putative urease accessory protein ureD  23.84 
 
 		 286 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2256  urease accessory protein UreD  25.25 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1052  urease accessory protein UreD  22.47 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4890  urease accessory protein UreD  27.6 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0585  urease accessory protein UreD  26.64 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1478  Urease accessory protein UreD  22.89 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0751352  normal  0.245102 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0059  Urease accessory protein UreD  24.18 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0793  urease accessory protein UreD  25.23 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0696  urease accessory protein UreD  24.81 
 
 		 278 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0873  urease accessory protein UreD  25.7 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1707  Urease accessory protein UreD  28.97 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605089 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2487  urease accessory protein UreD  24.77 
 
 		 291 aa  53.9  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3463  urease accessory protein UreD  22.68 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000478315  normal  0.195729 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0782  urease accessory protein UreD  24.77 
 
 		 291 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4431  urease accessory protein UreD  27.57 
 
 		 281 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3101  Urease accessory protein UreD  24.54 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4831  urease accessory protein UreD  23.4 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2370  urease accessory protein  24.03 
 
 		 281 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.512779 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1499  urease accessory protein UreD  24.8 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19231  urease accessory protein UreD  21.59 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.480391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3209  Urease accessory protein UreD  23.57 
 
 		 266 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2996  urease accessory protein UreD  28.06 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0742  UreD-family accessory protein  26.11 
 
 		 341 aa  50.4  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.16649 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  24.35 
 
 		 283 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0984  urease accessory protein UreD  29.63 
 
 		 275 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3245  Urease accessory protein UreD  27.84 
 
 		 309 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2014  Urease accessory protein UreD  22.52 
 
 		 282 aa  50.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  24.61 
 
 		 279 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0879  urease accessory protein UreD  27.85 
 
 		 302 aa  49.7  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3132  UreD-family accessory protein  23.89 
 
 		 346 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1212  urease accessory protein UreD  26.73 
 
 		 279 aa  49.7  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1770  urease accessory protein UreD  24.53 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1024  urease accessory protein UreD  24.86 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29781  urease accessory protein UreD  21.74 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3020  urease accessory protein UreD  26.8 
 
 		 338 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0267  urease accessory protein UreD  25.41 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.628784  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2624  urease accessory protein D  24.03 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.829261  normal  0.578413 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0281  urease accessory protein UreD  25.41 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3486  urease accessory protein  27.21 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>