115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1555 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1555  Urease accessory protein UreD  100 
 
 		 315 aa  627  1e-179  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2062  Urease accessory protein UreD  38.49 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000769283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2718  urease accessory protein UreD  34.15 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.274036  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1362  urease accessory protein UreD  27.65 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1083  urease accessory protein UreD  30.82 
 
 		 321 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1137  urease accessory protein UreD  30.82 
 
 		 321 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1318  urease accessory protein UreD  26.96 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5120  Urease accessory protein UreD  30.85 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1683  urease accessory protein UreD  31.25 
 
 		 273 aa  106  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0059  Urease accessory protein UreD  30.32 
 
 		 271 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1301  urease accessory protein UreD  30.14 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1463  Urease accessory protein UreD  30.14 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2195  urease accessory protein UreD  28.88 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00406195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1875  urease accessory protein UreD  28.19 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.37143  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2408  urease accessory protein UreD  30.68 
 
 		 256 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.815614  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2318  urease accessory protein UreD  26.79 
 
 		 278 aa  89.7  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00527457  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2361  urease accessory protein UreD  26.79 
 
 		 278 aa  89.7  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.361313  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1812  urease accessory protein UreD  25.4 
 
 		 262 aa  89.4  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3658  urease accessory protein UreD  21.49 
 
 		 273 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4212  urease accessory protein UreD  29.23 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4440  putative urease accessory protein ureD  32.22 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4047  urease accessory protein UreD  31.58 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6187  urease accessory protein UreD  30.71 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2883  urease accessory protein UreD  25.86 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  29.09 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2308  urease accessory protein UreD  27.72 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1707  Urease accessory protein UreD  30.88 
 
 		 286 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605089 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2036  urease accessory protein ureD  28.26 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.133178  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1964  putative urease accessory protein ureD  28.57 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0749  urease accessory protein UreD  24.49 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2767  Urease accessory protein UreD  28.38 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1186  urease accessory protein UreD  26.26 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  31.37 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1138  Urease accessory protein UreD  27.27 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0683  urease accessory protein UreD  23.38 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4414  Urease accessory protein UreD  23.15 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  27.45 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0585  urease accessory protein UreD  30.59 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7013  putative urease accessory protein UreD  31.43 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03480  urease accessory protein UreH  32.17 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  29.52 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  28.99 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2188  Urease accessory protein UreD  25.91 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0396  Urease accessory protein UreD  25.61 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1865  Urease accessory protein UreD  25.91 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.479381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2455  urease accessory protein UreD  24.66 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4890  urease accessory protein UreD  26.95 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0724  Urease accessory protein UreD  23.51 
 
 		 271 aa  62.4  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2996  urease accessory protein UreD  27.72 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3245  Urease accessory protein UreD  26.64 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0329  urease accessory protein  21.4 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1197  urease accessory protein UreD  22.22 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.294974  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0331  urease accessory protein UreD  30.3 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4154  urease accessory protein UreD  29.27 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09910  Urease accessory protein UreD  30.29 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930917  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3020  urease accessory protein UreD  31.45 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  25.28 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2444  urease accessory protein UreD  26.77 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792758  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3209  Urease accessory protein UreD  29.63 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0218  urease accessory protein D  23.37 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.842987 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2680  urease accessory protein UreD  23.11 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0696  urease accessory protein UreD  25.56 
 
 		 278 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0397  Urease accessory protein UreD  26.67 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585213  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0879  urease accessory protein UreD  24.03 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0473  urease accessory protein UreD  23.77 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.744472  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1770  urease accessory protein UreD  25.93 
 
 		 285 aa  57  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4831  urease accessory protein UreD  23.5 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0977  Urease accessory protein UreD  31.03 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0267  urease accessory protein UreD  25.29 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.628784  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1238  urease accessory protein UreD  22.55 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0247  urease accessory protein UreD  24.39 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0281  urease accessory protein UreD  25.29 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2254  urease accessory protein D  26.99 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0957  urease accessory protein UreD  25.62 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0865404  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1478  Urease accessory protein UreD  24.07 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0751352  normal  0.245102 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2370  urease accessory protein  23.74 
 
 		 281 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.512779 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3057  Urease accessory protein UreD  27.61 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4431  urease accessory protein UreD  24.91 
 
 		 281 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0742  UreD-family accessory protein  26.16 
 
 		 341 aa  54.3  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.16649 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0991  urease accessory protein UreD  23.73 
 
 		 289 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271998  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3308  urease accessory protein UreD  28.83 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0886683  normal  0.364033 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1359  Urease accessory protein UreD  26.79 
 
 		 294 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1212  urease accessory protein UreD  26.63 
 
 		 279 aa  53.1  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00886  putative urease accessory protein UreD  21.33 
 
 		 320 aa  52.8  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0984  urease accessory protein UreD  30.93 
 
 		 275 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2214  urease accessory protein UreD  28.65 
 
 		 282 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00280053 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3936  Urease accessory protein UreD  33.06 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3313  Urease accessory protein UreD  25.42 
 
 		 273 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  23.68 
 
 		 279 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2469  urease accessory protein UreD  29.03 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3101  Urease accessory protein UreD  24.55 
 
 		 277 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3697  urease accessory protein UreD  32.31 
 
 		 277 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64335  urease accessory protein  26.05 
 
 		 280 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5585  urease accessory protein  26.05 
 
 		 280 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1024  urease accessory protein UreD  24.24 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1199  urease accessory protein UreD  26.43 
 
 		 294 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2014  Urease accessory protein UreD  25.9 
 
 		 282 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2624  urease accessory protein D  23.89 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.829261  normal  0.578413 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3971  Urease accessory protein UreD  21.43 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08901  urease accessory protein UreD  21.43 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.697976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>