99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2195 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2195  urease accessory protein UreD  100 
 
 		 285 aa  577  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00406195  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2408  urease accessory protein UreD  83.2 
 
 		 256 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.815614  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1138  Urease accessory protein UreD  34.04 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6187  urease accessory protein UreD  34.17 
 
 		 278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1359  Urease accessory protein UreD  33.33 
 
 		 294 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1199  urease accessory protein UreD  35.36 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2718  urease accessory protein UreD  32.13 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.274036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1964  putative urease accessory protein ureD  30.86 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1555  Urease accessory protein UreD  28.88 
 
 		 315 aa  98.2  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2062  Urease accessory protein UreD  27.8 
 
 		 315 aa  89.4  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000769283  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1318  urease accessory protein UreD  26.32 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1362  urease accessory protein UreD  25.91 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1083  urease accessory protein UreD  24.23 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1137  urease accessory protein UreD  24.23 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5120  Urease accessory protein UreD  24.18 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1024  urease accessory protein UreD  30.86 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0749  urease accessory protein UreD  25.29 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1238  urease accessory protein UreD  26.85 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4154  urease accessory protein UreD  33.04 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4440  putative urease accessory protein ureD  27.73 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0059  Urease accessory protein UreD  25.09 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  27.12 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0991  urease accessory protein UreD  28.18 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271998  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1683  urease accessory protein UreD  28.34 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4414  Urease accessory protein UreD  23.51 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1301  urease accessory protein UreD  24.39 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3658  urease accessory protein UreD  20.09 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3486  urease accessory protein  29.28 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1463  Urease accessory protein UreD  24.39 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1092  urease accessory protein UreD  28.45 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0696  urease accessory protein UreD  31.44 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2414  urease accessory protein UreD  27.39 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7013  putative urease accessory protein UreD  31.37 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  28.76 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3376  urease accessory protein UreD  30.87 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  25.55 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2938  urease accessory protein UreD  26.2 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1082  urease accessory protein UreD  27.95 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3101  Urease accessory protein UreD  29.26 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  26.76 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1186  urease accessory protein UreD  27.16 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3313  Urease accessory protein UreD  26.89 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0397  Urease accessory protein UreD  28.12 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585213  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2680  urease accessory protein UreD  25.88 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3463  urease accessory protein UreD  25.43 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000478315  normal  0.195729 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2847  urease accessory protein UreD  32 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598121  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0267  urease accessory protein UreD  27.11 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.628784  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2842  urease accessory protein UreD  32 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0281  urease accessory protein UreD  27.11 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0984  urease accessory protein UreD  30.08 
 
 		 275 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0957  urease accessory protein UreD  25 
 
 		 293 aa  52.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0865404  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3057  Urease accessory protein UreD  26.17 
 
 		 273 aa  52.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2455  urease accessory protein UreD  26.75 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2389  urease accessory protein UreD  29.63 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.274527 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2883  urease accessory protein UreD  25.66 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1004  urease accessory protein UreD  27.39 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1770  urease accessory protein UreD  25.12 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  24.82 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1414  urease accessory protein UreD  26.59 
 
 		 276 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421382 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1212  urease accessory protein UreD  26.12 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1390  urease accessory protein UreD  27.84 
 
 		 276 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3308  urease accessory protein UreD  25.81 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0886683  normal  0.364033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1865  Urease accessory protein UreD  25.97 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.479381 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4047  urease accessory protein UreD  29.55 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0953  urease accessory protein UreD  24.71 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1955  urease accessory protein UreD  29.55 
 
 		 275 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3697  urease accessory protein UreD  32 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0331  urease accessory protein UreD  28.49 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0310  urease accessory protein UreD  28.79 
 
 		 275 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3108  urease accessory protein UreD  24.56 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2053  urease accessory protein UreD  24.56 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3072  urease accessory protein UreD  24.56 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2181  urease accessory protein UreD  24.56 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670086  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0727  urease accessory protein UreD  24.56 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2560  urease accessory protein UreD  24.56 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3132  UreD-family accessory protein  24.56 
 
 		 346 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2767  Urease accessory protein UreD  22.97 
 
 		 271 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29781  urease accessory protein UreD  24.1 
 
 		 299 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0782  urease accessory protein UreD  26.17 
 
 		 291 aa  45.8  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2469  urease accessory protein UreD  26.59 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1707  Urease accessory protein UreD  26.81 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605089 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1499  urease accessory protein UreD  26.24 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4890  urease accessory protein UreD  25.78 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2188  Urease accessory protein UreD  25.11 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2256  urease accessory protein UreD  25.35 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2996  urease accessory protein UreD  30.63 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0585  urease accessory protein UreD  24.89 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0793  urease accessory protein UreD  25.5 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09910  Urease accessory protein UreD  25.26 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930917  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0329  urease accessory protein  20.75 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0742  UreD-family accessory protein  29.36 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.16649 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1197  urease accessory protein UreD  23.72 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.294974  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4431  urease accessory protein UreD  24.44 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2370  urease accessory protein  26.42 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.512779 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3688  putative urease accessory protein  26.97 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139672 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2036  urease accessory protein ureD  25.1 
 
 		 295 aa  42.7  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.133178  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3245  Urease accessory protein UreD  26.45 
 
 		 309 aa  42.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3020  urease accessory protein UreD  26.45 
 
 		 338 aa  42.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  28.09 
 
 		 288 aa  42.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>