101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1199 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1199  urease accessory protein UreD  100 
 
 		 294 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1359  Urease accessory protein UreD  96.94 
 
 		 294 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1138  Urease accessory protein UreD  90.14 
 
 		 294 aa  512  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6187  urease accessory protein UreD  61.73 
 
 		 278 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1964  putative urease accessory protein ureD  42.05 
 
 		 280 aa  179  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4440  putative urease accessory protein ureD  35.9 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2195  urease accessory protein UreD  34.26 
 
 		 285 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00406195  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2408  urease accessory protein UreD  33.71 
 
 		 256 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.815614  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5120  Urease accessory protein UreD  28.18 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1301  urease accessory protein UreD  30.24 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1463  Urease accessory protein UreD  30.24 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2718  urease accessory protein UreD  26.3 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.274036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1083  urease accessory protein UreD  25.89 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1137  urease accessory protein UreD  25.89 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4414  Urease accessory protein UreD  27.2 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2062  Urease accessory protein UreD  28.95 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000769283  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1362  urease accessory protein UreD  22.86 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0749  urease accessory protein UreD  27.31 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1318  urease accessory protein UreD  22.14 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1683  urease accessory protein UreD  31.65 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  31.58 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3101  Urease accessory protein UreD  30.71 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  29.02 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1555  Urease accessory protein UreD  26.67 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0953  urease accessory protein UreD  28.02 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09910  Urease accessory protein UreD  30.49 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930917  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0683  urease accessory protein UreD  21.46 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4212  urease accessory protein UreD  28.36 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0267  urease accessory protein UreD  33.57 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.628784  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0281  urease accessory protein UreD  33.57 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0585  urease accessory protein UreD  29.67 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2414  urease accessory protein UreD  31.11 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  30.74 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1186  urease accessory protein UreD  29.45 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0696  urease accessory protein UreD  27.24 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2938  urease accessory protein UreD  28.74 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3658  urease accessory protein UreD  21.76 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03480  urease accessory protein UreH  28.52 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2767  Urease accessory protein UreD  22.26 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0331  urease accessory protein UreD  29.82 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  25.93 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0782  urease accessory protein UreD  26.56 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1092  urease accessory protein UreD  28.05 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3308  urease accessory protein UreD  28.64 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0886683  normal  0.364033 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0059  Urease accessory protein UreD  36.73 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0218  urease accessory protein D  26.6 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.842987 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  27.62 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2181  urease accessory protein UreD  27.08 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670086  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0727  urease accessory protein UreD  27.08 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2560  urease accessory protein UreD  27.08 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3072  urease accessory protein UreD  27.08 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3108  urease accessory protein UreD  27.08 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2053  urease accessory protein UreD  27.08 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0793  urease accessory protein UreD  26.56 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1499  urease accessory protein UreD  26.22 
 
 		 321 aa  53.1  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3132  UreD-family accessory protein  27.08 
 
 		 346 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2842  urease accessory protein UreD  32.09 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1770  urease accessory protein UreD  26.46 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2455  urease accessory protein UreD  26.1 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0873  urease accessory protein UreD  25.26 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2014  Urease accessory protein UreD  28.86 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3971  Urease accessory protein UreD  29.44 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0991  urease accessory protein UreD  29.15 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271998  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1414  urease accessory protein UreD  28.77 
 
 		 276 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421382 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0424  urease accessory protein UreD  25.26 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0903  urease accessory protein UreD  25.26 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1812  urease accessory protein UreD  28 
 
 		 262 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3376  urease accessory protein UreD  33.58 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2444  urease accessory protein UreD  26.33 
 
 		 274 aa  50.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792758  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2847  urease accessory protein UreD  31.58 
 
 		 278 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0957  urease accessory protein UreD  26.44 
 
 		 293 aa  49.7  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0865404  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64335  urease accessory protein  27.92 
 
 		 280 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5585  urease accessory protein  27.92 
 
 		 280 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  27.48 
 
 		 284 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2680  urease accessory protein UreD  28.14 
 
 		 302 aa  49.3  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4047  urease accessory protein UreD  32.37 
 
 		 297 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4009  urease accessory protein UreD  25 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2883  urease accessory protein UreD  25.56 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1955  urease accessory protein UreD  34.23 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0310  urease accessory protein UreD  33.33 
 
 		 275 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0388  urease accessory protein UreD  29.41 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2308  urease accessory protein UreD  30.94 
 
 		 313 aa  46.6  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1238  urease accessory protein UreD  23.12 
 
 		 329 aa  45.8  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2996  urease accessory protein UreD  28.8 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1004  urease accessory protein UreD  29.87 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0977  Urease accessory protein UreD  33 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4890  urease accessory protein UreD  27.33 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1024  urease accessory protein UreD  32.97 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7013  putative urease accessory protein UreD  27.19 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0984  urease accessory protein UreD  30.28 
 
 		 275 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3486  urease accessory protein  26.04 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1875  urease accessory protein UreD  18.54 
 
 		 278 aa  43.5  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.37143  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  27.87 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4154  urease accessory protein UreD  31.94 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2487  urease accessory protein UreD  24.35 
 
 		 291 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2256  urease accessory protein UreD  26.32 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0396  Urease accessory protein UreD  29.03 
 
 		 321 aa  43.5  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1707  Urease accessory protein UreD  32.69 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605089 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0247  urease accessory protein UreD  26.77 
 
 		 261 aa  43.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3463  urease accessory protein UreD  23.11 
 
 		 274 aa  43.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000478315  normal  0.195729 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>