88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4414 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4414  Urease accessory protein UreD  100 
 
 		 260 aa  541  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0749  urease accessory protein UreD  48.24 
 
 		 279 aa  263  3e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2718  urease accessory protein UreD  26.8 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.274036  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1362  urease accessory protein UreD  27.03 
 
 		 302 aa  94.7  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2062  Urease accessory protein UreD  23.29 
 
 		 315 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000769283  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1318  urease accessory protein UreD  26.58 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4047  urease accessory protein UreD  26.46 
 
 		 297 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3658  urease accessory protein UreD  25.81 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0977  Urease accessory protein UreD  28.37 
 
 		 298 aa  82  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  24.9 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1137  urease accessory protein UreD  25.58 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1083  urease accessory protein UreD  25.58 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1138  Urease accessory protein UreD  25.59 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1875  urease accessory protein UreD  25.55 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.37143  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1359  Urease accessory protein UreD  27.62 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1199  urease accessory protein UreD  27.2 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0396  Urease accessory protein UreD  24.24 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1964  putative urease accessory protein ureD  24.48 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2318  urease accessory protein UreD  24.15 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00527457  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1683  urease accessory protein UreD  25 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2361  urease accessory protein UreD  24.15 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.361313  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6187  urease accessory protein UreD  25.42 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317653  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2408  urease accessory protein UreD  24.7 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.815614  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5120  Urease accessory protein UreD  21.36 
 
 		 311 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1555  Urease accessory protein UreD  23.15 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0683  urease accessory protein UreD  24.65 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0724  Urease accessory protein UreD  32.03 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2195  urease accessory protein UreD  23.51 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00406195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1301  urease accessory protein UreD  20.41 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1463  Urease accessory protein UreD  20.41 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  25.21 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  24.39 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0247  urease accessory protein UreD  23.51 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03480  urease accessory protein UreH  29.03 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2767  Urease accessory protein UreD  25.71 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1478  Urease accessory protein UreD  27.7 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0751352  normal  0.245102 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1812  urease accessory protein UreD  25.73 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2624  urease accessory protein D  24.18 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.829261  normal  0.578413 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2455  urease accessory protein UreD  23.21 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1024  urease accessory protein UreD  24.32 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29781  urease accessory protein UreD  20.5 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1499  urease accessory protein UreD  23.21 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0059  Urease accessory protein UreD  21.4 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3209  Urease accessory protein UreD  25.78 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2254  urease accessory protein D  23.12 
 
 		 325 aa  54.7  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4831  urease accessory protein UreD  26.67 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02144  urease accessory protein UreD (AFU_orthologue; AFUA_2G16070)  28.03 
 
 		 357 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1707  Urease accessory protein UreD  24.84 
 
 		 286 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605089 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4212  urease accessory protein UreD  19.73 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0388  urease accessory protein UreD  22.01 
 
 		 297 aa  53.5  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08901  urease accessory protein UreD  23.5 
 
 		 300 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.697976  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2444  urease accessory protein UreD  23.94 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792758  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3020  urease accessory protein UreD  24.22 
 
 		 338 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3486  urease accessory protein  27.69 
 
 		 278 aa  52.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1052  urease accessory protein UreD  21.61 
 
 		 307 aa  52.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0949  Urease accessory protein UreD  21.28 
 
 		 293 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08921  urease accessory protein UreD  24.36 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00733999  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3308  urease accessory protein UreD  23.83 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0886683  normal  0.364033 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1197  urease accessory protein UreD  21.3 
 
 		 301 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.294974  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3108  urease accessory protein UreD  21.83 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0991  urease accessory protein UreD  22.57 
 
 		 289 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0727  urease accessory protein UreD  21.83 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2181  urease accessory protein UreD  21.83 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670086  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3072  urease accessory protein UreD  21.83 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2053  urease accessory protein UreD  21.83 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2560  urease accessory protein UreD  21.83 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3245  Urease accessory protein UreD  23.44 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0218  urease accessory protein D  24.29 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.842987 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0833  urease accessory protein UreD  23.08 
 
 		 300 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3132  UreD-family accessory protein  21.83 
 
 		 346 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2014  Urease accessory protein UreD  21.69 
 
 		 282 aa  49.7  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4440  putative urease accessory protein ureD  21.03 
 
 		 286 aa  49.3  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0957  urease accessory protein UreD  22.47 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0865404  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19231  urease accessory protein UreD  21.76 
 
 		 307 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.480391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2469  urease accessory protein UreD  24.31 
 
 		 288 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119681  urease accessory protein URED, putative  23.37 
 
 		 336 aa  46.2  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0397  Urease accessory protein UreD  22.66 
 
 		 280 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585213  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0331  urease accessory protein UreD  23.08 
 
 		 283 aa  46.2  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1238  urease accessory protein UreD  21.33 
 
 		 329 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7013  putative urease accessory protein UreD  23.44 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2370  urease accessory protein  19.91 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.512779 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1212  urease accessory protein UreD  27.55 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1264  urease accessory protein  20.83 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.647303 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1955  urease accessory protein UreD  26.36 
 
 		 275 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0984  urease accessory protein UreD  21.05 
 
 		 275 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2214  urease accessory protein UreD  21.88 
 
 		 282 aa  42.7  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00280053 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48625  predicted protein  21.8 
 
 		 666 aa  42.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0879  urease accessory protein UreD  21.77 
 
 		 302 aa  42.4  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>