52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4831 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4831  urease accessory protein UreD  100 
 
 		 277 aa  575  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1478  Urease accessory protein UreD  40.08 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0751352  normal  0.245102 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1812  urease accessory protein UreD  31.64 
 
 		 262 aa  155  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0683  urease accessory protein UreD  24.7 
 
 		 274 aa  102  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2361  urease accessory protein UreD  26.79 
 
 		 278 aa  102  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.361313  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2318  urease accessory protein UreD  26.79 
 
 		 278 aa  102  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00527457  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1875  urease accessory protein UreD  25.23 
 
 		 278 aa  99.8  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.37143  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3658  urease accessory protein UreD  24.28 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2767  Urease accessory protein UreD  25.38 
 
 		 271 aa  92.4  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0724  Urease accessory protein UreD  25.93 
 
 		 271 aa  91.3  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1362  urease accessory protein UreD  27.89 
 
 		 302 aa  89  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1318  urease accessory protein UreD  27.49 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0473  urease accessory protein UreD  25.47 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.744472  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0329  urease accessory protein  22.44 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0396  Urease accessory protein UreD  24.11 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0247  urease accessory protein UreD  23.01 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2062  Urease accessory protein UreD  26.02 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000769283  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2455  urease accessory protein UreD  23.18 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1264  urease accessory protein  23.93 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.647303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2718  urease accessory protein UreD  23.74 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.274036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1301  urease accessory protein UreD  24.64 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1463  Urease accessory protein UreD  24.64 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4212  urease accessory protein UreD  22.03 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0977  Urease accessory protein UreD  22.22 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5120  Urease accessory protein UreD  23.37 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1555  Urease accessory protein UreD  23.5 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4414  Urease accessory protein UreD  26.67 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03480  urease accessory protein UreH  21.75 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4047  urease accessory protein UreD  18.18 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  20.74 
 
 		 305 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0749  urease accessory protein UreD  25 
 
 		 279 aa  53.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2469  urease accessory protein UreD  20.71 
 
 		 288 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1137  urease accessory protein UreD  23.4 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1083  urease accessory protein UreD  23.4 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2389  urease accessory protein UreD  24.14 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.274527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  21.48 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3057  Urease accessory protein UreD  19.6 
 
 		 273 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0585  urease accessory protein UreD  19.14 
 
 		 279 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  22.22 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1197  urease accessory protein UreD  21.28 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.294974  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0397  Urease accessory protein UreD  20.62 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585213  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1024  urease accessory protein UreD  20.24 
 
 		 289 aa  47  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2624  urease accessory protein D  22.14 
 
 		 327 aa  46.2  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.829261  normal  0.578413 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09910  Urease accessory protein UreD  20.25 
 
 		 279 aa  45.8  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930917  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2991  urease accessory protein UreD  23.24 
 
 		 313 aa  45.8  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.866149 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4431  urease accessory protein UreD  21.26 
 
 		 281 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3313  Urease accessory protein UreD  18.29 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2014  Urease accessory protein UreD  18.72 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1770  urease accessory protein UreD  18.93 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19231  urease accessory protein UreD  20.96 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.480391  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4890  urease accessory protein UreD  20.69 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1499  urease accessory protein UreD  19.43 
 
 		 321 aa  42.7  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>