83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0724 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0724  Urease accessory protein UreD  100 
 
 		 271 aa  547  1e-155  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1812  urease accessory protein UreD  30.2 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1478  Urease accessory protein UreD  25.2 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0751352  normal  0.245102 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4831  urease accessory protein UreD  25.93 
 
 		 277 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0683  urease accessory protein UreD  24.71 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2718  urease accessory protein UreD  23.91 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.274036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1318  urease accessory protein UreD  23.56 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1362  urease accessory protein UreD  23.56 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2062  Urease accessory protein UreD  23.36 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000769283  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3658  urease accessory protein UreD  22.88 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0329  urease accessory protein  25.13 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1137  urease accessory protein UreD  23.35 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1083  urease accessory protein UreD  23.35 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0247  urease accessory protein UreD  24.47 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2361  urease accessory protein UreD  26.28 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.361313  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2318  urease accessory protein UreD  26.28 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00527457  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1875  urease accessory protein UreD  22.69 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.37143  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4414  Urease accessory protein UreD  32.03 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0473  urease accessory protein UreD  22.34 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.744472  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0396  Urease accessory protein UreD  22.77 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0749  urease accessory protein UreD  27.74 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2680  urease accessory protein UreD  21.74 
 
 		 302 aa  65.5  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4047  urease accessory protein UreD  20.75 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5120  Urease accessory protein UreD  22.22 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  21.63 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1555  Urease accessory protein UreD  23.51 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1301  urease accessory protein UreD  23.02 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1463  Urease accessory protein UreD  23.02 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1024  urease accessory protein UreD  21.82 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2455  urease accessory protein UreD  22.6 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1683  urease accessory protein UreD  20.75 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1264  urease accessory protein  25.77 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.647303 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0388  urease accessory protein UreD  20.91 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784238  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4890  urease accessory protein UreD  23.17 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09910  Urease accessory protein UreD  25.28 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930917  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0977  Urease accessory protein UreD  21.6 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4431  urease accessory protein UreD  22.35 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2389  urease accessory protein UreD  23.37 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.274527 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0585  urease accessory protein UreD  24.14 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4212  urease accessory protein UreD  22.05 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  24.12 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3486  urease accessory protein  23.86 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2624  urease accessory protein D  25.81 
 
 		 327 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.829261  normal  0.578413 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0991  urease accessory protein UreD  19.76 
 
 		 289 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271998  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1707  Urease accessory protein UreD  21.89 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605089 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0696  urease accessory protein UreD  22.42 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3057  Urease accessory protein UreD  21.3 
 
 		 273 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0397  Urease accessory protein UreD  20.25 
 
 		 280 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585213  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  21.71 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3308  urease accessory protein UreD  22.35 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0886683  normal  0.364033 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2767  Urease accessory protein UreD  19.33 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3101  Urease accessory protein UreD  19.37 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2014  Urease accessory protein UreD  21.97 
 
 		 282 aa  49.3  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64335  urease accessory protein  21.46 
 
 		 280 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5585  urease accessory protein  21.46 
 
 		 280 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1197  urease accessory protein UreD  24.49 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.294974  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2883  urease accessory protein UreD  22.36 
 
 		 296 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1052  urease accessory protein UreD  24.2 
 
 		 307 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0331  urease accessory protein UreD  23.88 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1770  urease accessory protein UreD  22.41 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3209  Urease accessory protein UreD  19.31 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3020  urease accessory protein UreD  20.5 
 
 		 338 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0059  Urease accessory protein UreD  21.89 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  23.81 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1186  urease accessory protein UreD  24.22 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1238  urease accessory protein UreD  23.39 
 
 		 329 aa  46.2  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3313  Urease accessory protein UreD  19.14 
 
 		 273 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08901  urease accessory protein UreD  25.1 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.697976  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2370  urease accessory protein  19.75 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.512779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7013  putative urease accessory protein UreD  30.63 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19231  urease accessory protein UreD  24.2 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.480391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2938  urease accessory protein UreD  21.08 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1744  urease accessory protein UreD  20.4 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.407934  normal  0.768182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2214  urease accessory protein UreD  20.47 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00280053 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  21.37 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  22.9 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2254  urease accessory protein D  21.88 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3245  Urease accessory protein UreD  19.67 
 
 		 309 aa  43.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2414  urease accessory protein UreD  24.39 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1212  urease accessory protein UreD  21.95 
 
 		 279 aa  42.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  21.54 
 
 		 283 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0281  urease accessory protein UreD  21.58 
 
 		 280 aa  42.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0267  urease accessory protein UreD  21.58 
 
 		 280 aa  42.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.628784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>