78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1264 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1264  urease accessory protein  100 
 
 		 285 aa  591  1e-168  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.647303 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4047  urease accessory protein UreD  30.99 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0977  Urease accessory protein UreD  28.74 
 
 		 298 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2455  urease accessory protein UreD  26.61 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2718  urease accessory protein UreD  24.62 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.274036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48625  predicted protein  25.4 
 
 		 666 aa  79.7  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3658  urease accessory protein UreD  23.76 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0329  urease accessory protein  28.29 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119681  urease accessory protein URED, putative  23.86 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1318  urease accessory protein UreD  27.95 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1362  urease accessory protein UreD  27.95 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2062  Urease accessory protein UreD  24.06 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000769283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0683  urease accessory protein UreD  23.03 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1875  urease accessory protein UreD  20.6 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.37143  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2318  urease accessory protein UreD  23.68 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00527457  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2361  urease accessory protein UreD  23.68 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.361313  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0473  urease accessory protein UreD  23.36 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.744472  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02144  urease accessory protein UreD (AFU_orthologue; AFUA_2G16070)  29.37 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4831  urease accessory protein UreD  23.93 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2256  urease accessory protein UreD  24.71 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  27.67 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0742  UreD-family accessory protein  24.74 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.16649 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03480  urease accessory protein UreH  20.88 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1683  urease accessory protein UreD  22.45 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0724  Urease accessory protein UreD  25.77 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  28.17 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1092  urease accessory protein UreD  21.43 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0388  urease accessory protein UreD  25.87 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2767  Urease accessory protein UreD  21.29 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3101  Urease accessory protein UreD  23.28 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4212  urease accessory protein UreD  26.81 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1052  urease accessory protein UreD  23.08 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1478  Urease accessory protein UreD  23.03 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0751352  normal  0.245102 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1812  urease accessory protein UreD  22.99 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1414  urease accessory protein UreD  26.49 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0949  Urease accessory protein UreD  21.46 
 
 		 293 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0585  urease accessory protein UreD  21.24 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19231  urease accessory protein UreD  21.79 
 
 		 307 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.480391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0749  urease accessory protein UreD  20.39 
 
 		 279 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2370  urease accessory protein  24.55 
 
 		 281 aa  49.7  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.512779 
 
 
-
 
NC_004310  BR0267  urease accessory protein UreD  26.67 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.628784  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2444  urease accessory protein UreD  22.8 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792758  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0281  urease accessory protein UreD  26.67 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0953  urease accessory protein UreD  25.28 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09910  Urease accessory protein UreD  21.2 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930917  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4890  urease accessory protein UreD  21.02 
 
 		 281 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2487  urease accessory protein UreD  24.44 
 
 		 291 aa  45.8  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2014  Urease accessory protein UreD  22.52 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1082  urease accessory protein UreD  23.33 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1083  urease accessory protein UreD  19.74 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3688  putative urease accessory protein  21.63 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139672 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1137  urease accessory protein UreD  19.74 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4414  Urease accessory protein UreD  20.83 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1024  urease accessory protein UreD  23.47 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2469  urease accessory protein UreD  28.35 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3971  Urease accessory protein UreD  22.16 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03280  urease accessory protein UreH  21.34 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0396  Urease accessory protein UreD  21.13 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2680  urease accessory protein UreD  24.14 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3108  urease accessory protein UreD  23.11 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2181  urease accessory protein UreD  23.11 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2053  urease accessory protein UreD  23.11 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0696  urease accessory protein UreD  19.8 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3072  urease accessory protein UreD  23.11 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0727  urease accessory protein UreD  23.11 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2560  urease accessory protein UreD  23.11 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0247  urease accessory protein UreD  19.34 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3376  urease accessory protein UreD  23.37 
 
 		 276 aa  43.5  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3132  UreD-family accessory protein  23.11 
 
 		 346 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0331  urease accessory protein UreD  22.63 
 
 		 283 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4431  urease accessory protein UreD  20.45 
 
 		 281 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2996  urease accessory protein UreD  20.5 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2883  urease accessory protein UreD  19.79 
 
 		 296 aa  42.7  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  19.54 
 
 		 305 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2254  urease accessory protein D  22.15 
 
 		 325 aa  42.4  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1004  urease accessory protein UreD  23.67 
 
 		 276 aa  42.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5585  urease accessory protein  20.21 
 
 		 280 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64335  urease accessory protein  20.21 
 
 		 280 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164957  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>