54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03280 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_03280  urease accessory protein UreH  100 
 
 		 299 aa  582  1.0000000000000001e-165  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6444  urease accessory protein  39.47 
 
 		 270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31216  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3207  Urease accessory protein UreD  40.83 
 
 		 256 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00681143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5702  putative urease accessory protein UreD  34.46 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.119929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0830  putative urease accessory protein  36.27 
 
 		 319 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0502  urease accessory protein UreD  39.7 
 
 		 281 aa  99.4  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0275  Urease accessory protein UreH-like protein  34.36 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3406  putative urease accessory protein  37.01 
 
 		 232 aa  72  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0194  putative urease accessory protein  34.29 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3507  Urease accessory protein UreH-like protein  31.63 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.223661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3079  putative urease accessory protein  33.54 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0546713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11881  urease accessory protein ureD  31.91 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.339466 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2842  urease accessory protein UreD  30.17 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2847  urease accessory protein UreD  30.17 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2938  urease accessory protein UreD  29.61 
 
 		 277 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2414  urease accessory protein UreD  31.94 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2718  urease accessory protein UreD  26.09 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.274036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0397  Urease accessory protein UreD  28.18 
 
 		 280 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585213  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2846  putative urease accessory protein  28.87 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.72908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  31.61 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2829  putative urease accessory protein  28.87 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2802  putative urease accessory protein  28.87 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0694  Urease accessory protein UreH-like protein  27.27 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0135434  hitchhiker  0.0000000541672 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2752  hypothetical protein  30.4 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0794267  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2469  urease accessory protein UreD  27.81 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  27.85 
 
 		 305 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2036  urease accessory protein ureD  24.15 
 
 		 295 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.133178  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  33.68 
 
 		 279 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0693  hypothetical protein  27.59 
 
 		 284 aa  48.9  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0249128  hitchhiker  0.0000000487689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1744  urease accessory protein UreD  28.65 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.407934  normal  0.768182 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0388  urease accessory protein UreD  29.09 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0683  urease accessory protein UreD  25.24 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0991  urease accessory protein UreD  29.08 
 
 		 289 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271998  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2308  urease accessory protein UreD  26.03 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0977  Urease accessory protein UreD  31.76 
 
 		 298 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0696  urease accessory protein UreD  32.46 
 
 		 278 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1137  urease accessory protein UreD  24.69 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3936  Urease accessory protein UreD  26.59 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1083  urease accessory protein UreD  24.69 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0331  urease accessory protein UreD  23.81 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1197  urease accessory protein UreD  22.49 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.294974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1186  urease accessory protein UreD  34.41 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1865  Urease accessory protein UreD  23.77 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.479381 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0879  urease accessory protein UreD  26.56 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1264  urease accessory protein  22.42 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.647303 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2188  Urease accessory protein UreD  24.25 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  25.82 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  31.58 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1092  urease accessory protein UreD  32.97 
 
 		 278 aa  43.1  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1238  urease accessory protein UreD  27.2 
 
 		 329 aa  42.7  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0281  urease accessory protein UreD  24.48 
 
 		 280 aa  42.7  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0267  urease accessory protein UreD  24.48 
 
 		 280 aa  42.7  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.628784  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3376  urease accessory protein UreD  36.26 
 
 		 276 aa  42.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3349  putative urease accessory protein  31.1 
 
 		 212 aa  42.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>