85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3207 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3207  Urease accessory protein UreD  100 
 
 		 256 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00681143  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0830  putative urease accessory protein  46.32 
 
 		 319 aa  174  9e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5702  putative urease accessory protein UreD  45.59 
 
 		 297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.119929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6444  urease accessory protein  43.43 
 
 		 270 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31216  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0502  urease accessory protein UreD  42.68 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03280  urease accessory protein UreH  38.96 
 
 		 299 aa  113  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2846  putative urease accessory protein  46.38 
 
 		 210 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.72908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2802  putative urease accessory protein  46.38 
 
 		 210 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2829  putative urease accessory protein  46.38 
 
 		 210 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0194  putative urease accessory protein  46.2 
 
 		 239 aa  108  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3079  putative urease accessory protein  41.78 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0546713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11881  urease accessory protein ureD  36.82 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.339466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3349  putative urease accessory protein  43.94 
 
 		 212 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2752  hypothetical protein  42.66 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0794267  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0275  Urease accessory protein UreH-like protein  37.43 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3507  Urease accessory protein UreH-like protein  35.36 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.223661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0694  Urease accessory protein UreH-like protein  35.12 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0135434  hitchhiker  0.0000000541672 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  33.48 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4047  urease accessory protein UreD  33.33 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  31.91 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0059  Urease accessory protein UreD  33.48 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2370  urease accessory protein  30.57 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.512779 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3057  Urease accessory protein UreD  30.69 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3406  putative urease accessory protein  37.21 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2455  urease accessory protein UreD  32.54 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0267  urease accessory protein UreD  31.55 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.628784  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0281  urease accessory protein UreD  31.55 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2680  urease accessory protein UreD  27.27 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0957  urease accessory protein UreD  32.68 
 
 		 293 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0865404  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  31.55 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1024  urease accessory protein UreD  31.22 
 
 		 289 aa  53.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0331  urease accessory protein UreD  30.67 
 
 		 283 aa  53.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2444  urease accessory protein UreD  28.78 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792758  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0984  urease accessory protein UreD  35.25 
 
 		 275 aa  52  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5120  Urease accessory protein UreD  26.12 
 
 		 311 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0397  Urease accessory protein UreD  31.47 
 
 		 280 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585213  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2308  urease accessory protein UreD  27.15 
 
 		 313 aa  51.2  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2767  Urease accessory protein UreD  26.32 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  29.11 
 
 		 305 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2996  urease accessory protein UreD  30.3 
 
 		 298 aa  48.9  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2014  Urease accessory protein UreD  30.21 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  32.11 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3101  Urease accessory protein UreD  32.49 
 
 		 277 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3313  Urease accessory protein UreD  29.41 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4154  urease accessory protein UreD  29.65 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0879  urease accessory protein UreD  29.67 
 
 		 302 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2469  urease accessory protein UreD  30.57 
 
 		 288 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2718  urease accessory protein UreD  28.02 
 
 		 308 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.274036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1707  Urease accessory protein UreD  29.71 
 
 		 286 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3020  urease accessory protein UreD  32.8 
 
 		 338 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1463  Urease accessory protein UreD  24.9 
 
 		 311 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1301  urease accessory protein UreD  24.9 
 
 		 311 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3245  Urease accessory protein UreD  29.8 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0977  Urease accessory protein UreD  34.4 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7013  putative urease accessory protein UreD  30.3 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2938  urease accessory protein UreD  27.27 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2414  urease accessory protein UreD  29.29 
 
 		 277 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1865  Urease accessory protein UreD  28.78 
 
 		 295 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.479381 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3688  putative urease accessory protein  32.84 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2214  urease accessory protein UreD  28.95 
 
 		 282 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00280053 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1138  Urease accessory protein UreD  29.74 
 
 		 294 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1212  urease accessory protein UreD  29.29 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  26.88 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2389  urease accessory protein UreD  27.51 
 
 		 277 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.274527 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2036  urease accessory protein ureD  30.05 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.133178  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1683  urease accessory protein UreD  30.41 
 
 		 273 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2847  urease accessory protein UreD  26.87 
 
 		 278 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3486  urease accessory protein  25.25 
 
 		 278 aa  42.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1197  urease accessory protein UreD  23.35 
 
 		 301 aa  42.7  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.294974  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6187  urease accessory protein UreD  29.11 
 
 		 278 aa  42.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1186  urease accessory protein UreD  29.94 
 
 		 305 aa  42.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1812  urease accessory protein UreD  27.89 
 
 		 262 aa  42.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3209  Urease accessory protein UreD  31.4 
 
 		 266 aa  42.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1318  urease accessory protein UreD  23.66 
 
 		 302 aa  42  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0749  urease accessory protein UreD  26.73 
 
 		 279 aa  42  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0727  urease accessory protein UreD  27.2 
 
 		 291 aa  42  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2560  urease accessory protein UreD  27.2 
 
 		 291 aa  42  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4414  Urease accessory protein UreD  22.9 
 
 		 260 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3072  urease accessory protein UreD  27.2 
 
 		 291 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2842  urease accessory protein UreD  26.87 
 
 		 277 aa  42  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1770  urease accessory protein UreD  28.65 
 
 		 285 aa  42  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3108  urease accessory protein UreD  27.2 
 
 		 291 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2053  urease accessory protein UreD  27.2 
 
 		 291 aa  42  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2181  urease accessory protein UreD  27.2 
 
 		 291 aa  42  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670086  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1362  urease accessory protein UreD  23.66 
 
 		 302 aa  42  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>