60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0275 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0275  Urease accessory protein UreH-like protein  100 
 
 		 240 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3406  putative urease accessory protein  46.4 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0694  Urease accessory protein UreH-like protein  47.69 
 
 		 291 aa  136  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0135434  hitchhiker  0.0000000541672 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3507  Urease accessory protein UreH-like protein  47.22 
 
 		 248 aa  116  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.223661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0693  hypothetical protein  43.18 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0249128  hitchhiker  0.0000000487689 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03280  urease accessory protein UreH  34.19 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3207  Urease accessory protein UreD  37.43 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00681143  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6444  urease accessory protein  38.1 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31216  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  35.37 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5702  putative urease accessory protein UreD  34.65 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.119929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0830  putative urease accessory protein  37.36 
 
 		 319 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7013  putative urease accessory protein UreD  33.9 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  31.54 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1770  urease accessory protein UreD  37.25 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0502  urease accessory protein UreD  39.04 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4154  urease accessory protein UreD  30 
 
 		 289 aa  57  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4047  urease accessory protein UreD  31.91 
 
 		 297 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1024  urease accessory protein UreD  30.86 
 
 		 289 aa  53.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  29.66 
 
 		 305 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1707  Urease accessory protein UreD  36 
 
 		 286 aa  52.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605089 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1744  urease accessory protein UreD  29.35 
 
 		 250 aa  52.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.407934  normal  0.768182 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1238  urease accessory protein UreD  27.63 
 
 		 329 aa  52  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0397  Urease accessory protein UreD  36.73 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585213  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0194  putative urease accessory protein  36.09 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  24.19 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2214  urease accessory protein UreD  31.3 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00280053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3313  Urease accessory protein UreD  27.85 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  25.27 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3020  urease accessory protein UreD  31.96 
 
 		 338 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3245  Urease accessory protein UreD  32.11 
 
 		 309 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0281  urease accessory protein UreD  30.1 
 
 		 280 aa  48.9  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0267  urease accessory protein UreD  30.1 
 
 		 280 aa  48.9  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.628784  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1212  urease accessory protein UreD  28.65 
 
 		 279 aa  48.5  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2370  urease accessory protein  30.81 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.512779 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3079  putative urease accessory protein  31.87 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0546713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1197  urease accessory protein UreD  27.15 
 
 		 301 aa  47.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.294974  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2842  urease accessory protein UreD  32.22 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6187  urease accessory protein UreD  28.99 
 
 		 278 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2938  urease accessory protein UreD  31.11 
 
 		 277 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3697  urease accessory protein UreD  34.15 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0957  urease accessory protein UreD  33.6 
 
 		 293 aa  46.2  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0865404  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2414  urease accessory protein UreD  31.11 
 
 		 277 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2469  urease accessory protein UreD  32.9 
 
 		 288 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2847  urease accessory protein UreD  30 
 
 		 278 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3486  urease accessory protein  28.42 
 
 		 278 aa  45.8  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0331  urease accessory protein UreD  25.19 
 
 		 283 aa  45.8  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09910  Urease accessory protein UreD  31.97 
 
 		 279 aa  45.4  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930917  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2014  Urease accessory protein UreD  29.24 
 
 		 282 aa  45.4  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2752  hypothetical protein  35.56 
 
 		 233 aa  45.4  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0794267  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1186  urease accessory protein UreD  33.33 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3057  Urease accessory protein UreD  27.16 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2829  putative urease accessory protein  32.68 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2846  putative urease accessory protein  32.68 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.72908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2802  putative urease accessory protein  32.68 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2389  urease accessory protein UreD  27.33 
 
 		 277 aa  42.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.274527 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1137  urease accessory protein UreD  26.26 
 
 		 321 aa  42.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1083  urease accessory protein UreD  26.26 
 
 		 321 aa  42.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  28.72 
 
 		 293 aa  42.4  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  31.46 
 
 		 288 aa  42  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2036  urease accessory protein ureD  30 
 
 		 295 aa  41.6  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.133178  normal  0.368181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>