57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3507 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3507  Urease accessory protein UreH-like protein  100 
 
 
248 aa  462  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.223661  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0275  Urease accessory protein UreH-like protein  47.22 
 
 
240 aa  116  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3406  putative urease accessory protein  44.27 
 
 
232 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0694  Urease accessory protein UreH-like protein  45.31 
 
 
291 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0135434  hitchhiker  0.0000000541672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3207  Urease accessory protein UreD  35.36 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00681143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5702  putative urease accessory protein UreD  33.47 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.119929  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03280  urease accessory protein UreH  31.4 
 
 
299 aa  67  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0693  hypothetical protein  34.68 
 
 
284 aa  62  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0249128  hitchhiker  0.0000000487689 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0830  putative urease accessory protein  34.34 
 
 
319 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6444  urease accessory protein  31.29 
 
 
270 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31216  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0194  putative urease accessory protein  38.85 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0502  urease accessory protein UreD  35.93 
 
 
281 aa  55.5  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  34.72 
 
 
279 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  26.67 
 
 
279 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0331  urease accessory protein UreD  33.06 
 
 
283 aa  52.8  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2680  urease accessory protein UreD  31.91 
 
 
302 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0267  urease accessory protein UreD  30.13 
 
 
280 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.628784  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0281  urease accessory protein UreD  30.13 
 
 
280 aa  51.2  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0984  urease accessory protein UreD  33.59 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130155  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1812  urease accessory protein UreD  24.53 
 
 
262 aa  50.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2370  urease accessory protein  35.04 
 
 
281 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.512779 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64335  urease accessory protein  30.67 
 
 
280 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164957  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5585  urease accessory protein  30.67 
 
 
280 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3349  putative urease accessory protein  32.08 
 
 
212 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  28.42 
 
 
288 aa  48.9  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7013  putative urease accessory protein UreD  35.35 
 
 
278 aa  48.9  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2414  urease accessory protein UreD  33.33 
 
 
277 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0696  urease accessory protein UreD  29.81 
 
 
278 aa  47  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  31.76 
 
 
283 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0388  urease accessory protein UreD  29.17 
 
 
297 aa  47  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784238  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1212  urease accessory protein UreD  31.72 
 
 
279 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2996  urease accessory protein UreD  32.34 
 
 
298 aa  46.2  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1024  urease accessory protein UreD  28.87 
 
 
289 aa  46.6  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  32.85 
 
 
293 aa  46.6  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2036  urease accessory protein ureD  32.1 
 
 
295 aa  46.2  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.133178  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0957  urease accessory protein UreD  28.96 
 
 
293 aa  46.2  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0865404  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0793  urease accessory protein UreD  31.79 
 
 
291 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6187  urease accessory protein UreD  28.57 
 
 
278 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317653  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3308  urease accessory protein UreD  29.56 
 
 
270 aa  45.8  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0886683  normal  0.364033 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4212  urease accessory protein UreD  30.26 
 
 
272 aa  45.4  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1744  urease accessory protein UreD  31.58 
 
 
250 aa  45.4  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.407934  normal  0.768182 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0218  urease accessory protein D  27.62 
 
 
295 aa  45.4  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.842987 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0749  urease accessory protein UreD  28.16 
 
 
279 aa  45.4  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1362  urease accessory protein UreD  26.79 
 
 
302 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1390  urease accessory protein UreD  28.79 
 
 
276 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09910  Urease accessory protein UreD  30.29 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930917  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1318  urease accessory protein UreD  26.79 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0782  urease accessory protein UreD  31.79 
 
 
291 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1955  urease accessory protein UreD  39.71 
 
 
275 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1865  Urease accessory protein UreD  29.44 
 
 
295 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.479381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  29.56 
 
 
305 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2842  urease accessory protein UreD  29.73 
 
 
277 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3936  Urease accessory protein UreD  27.88 
 
 
292 aa  42.7  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0310  urease accessory protein UreD  38.24 
 
 
275 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2938  urease accessory protein UreD  29.05 
 
 
277 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  31.86 
 
 
284 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0873  urease accessory protein UreD  31.4 
 
 
291 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>