36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3406 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3406  putative urease accessory protein  100 
 
 		 232 aa  439  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0694  Urease accessory protein UreH-like protein  48.8 
 
 		 291 aa  140  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0135434  hitchhiker  0.0000000541672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0275  Urease accessory protein UreH-like protein  46.09 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3507  Urease accessory protein UreH-like protein  44.27 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.223661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0693  hypothetical protein  40.14 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0249128  hitchhiker  0.0000000487689 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03280  urease accessory protein UreH  37.01 
 
 		 299 aa  71.6  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0830  putative urease accessory protein  33.15 
 
 		 319 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3207  Urease accessory protein UreD  37.21 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00681143  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0502  urease accessory protein UreD  34.63 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5702  putative urease accessory protein UreD  36.92 
 
 		 297 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.119929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6444  urease accessory protein  26.97 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31216  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2752  hypothetical protein  34.11 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0794267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2718  urease accessory protein UreD  32.73 
 
 		 308 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.274036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  31.93 
 
 		 279 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3079  putative urease accessory protein  29.45 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0546713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2062  Urease accessory protein UreD  34.51 
 
 		 315 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000769283  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11881  urease accessory protein ureD  30.43 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.339466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0397  Urease accessory protein UreD  29.03 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585213  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2829  putative urease accessory protein  31.06 
 
 		 210 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2802  putative urease accessory protein  31.06 
 
 		 210 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2846  putative urease accessory protein  31.06 
 
 		 210 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.72908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  34.07 
 
 		 283 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5120  Urease accessory protein UreD  28.02 
 
 		 311 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0727  urease accessory protein UreD  30.46 
 
 		 291 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2181  urease accessory protein UreD  30.46 
 
 		 291 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2053  urease accessory protein UreD  30.46 
 
 		 291 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3108  urease accessory protein UreD  30.46 
 
 		 291 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3072  urease accessory protein UreD  30.46 
 
 		 291 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2560  urease accessory protein UreD  30.46 
 
 		 291 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0879  urease accessory protein UreD  29.03 
 
 		 302 aa  43.9  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3132  UreD-family accessory protein  30.46 
 
 		 346 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3245  Urease accessory protein UreD  29.85 
 
 		 309 aa  42.7  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3020  urease accessory protein UreD  29.01 
 
 		 338 aa  42.7  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  30.77 
 
 		 305 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  29.55 
 
 		 293 aa  42.4  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2308  urease accessory protein UreD  31.53 
 
 		 313 aa  42  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>