46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0502 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0502  urease accessory protein UreD  100 
 
 		 281 aa  533  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0830  putative urease accessory protein  37.32 
 
 		 319 aa  125  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3207  Urease accessory protein UreD  42.55 
 
 		 256 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00681143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5702  putative urease accessory protein UreD  38.1 
 
 		 297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.119929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6444  urease accessory protein  38.37 
 
 		 270 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31216  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03280  urease accessory protein UreH  39.79 
 
 		 299 aa  99.4  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0194  putative urease accessory protein  44.51 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3079  putative urease accessory protein  40.15 
 
 		 208 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0546713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11881  urease accessory protein ureD  40.88 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.339466 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2802  putative urease accessory protein  36.43 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2829  putative urease accessory protein  36.43 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2846  putative urease accessory protein  36.43 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.72908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3349  putative urease accessory protein  42.75 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2752  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0794267  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  32.18 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09910  Urease accessory protein UreD  34.39 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930917  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0275  Urease accessory protein UreH-like protein  39.04 
 
 		 240 aa  57  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3406  putative urease accessory protein  34.31 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  35.77 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3507  Urease accessory protein UreH-like protein  35.93 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.223661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0694  Urease accessory protein UreH-like protein  32.88 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0135434  hitchhiker  0.0000000541672 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2469  urease accessory protein UreD  34.39 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  36.49 
 
 		 293 aa  53.5  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4890  urease accessory protein UreD  31.79 
 
 		 281 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1186  urease accessory protein UreD  40.22 
 
 		 305 aa  52.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0585  urease accessory protein UreD  32.02 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  32.52 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1092  urease accessory protein UreD  28.86 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4431  urease accessory protein UreD  31.47 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  30.97 
 
 		 279 aa  49.3  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  33.33 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0397  Urease accessory protein UreD  30.17 
 
 		 280 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585213  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08901  urease accessory protein UreD  22.68 
 
 		 300 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.697976  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0742  UreD-family accessory protein  32.59 
 
 		 341 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.16649 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08921  urease accessory protein UreD  22.68 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00733999  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0267  urease accessory protein UreD  30.71 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.628784  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1238  urease accessory protein UreD  30.77 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0281  urease accessory protein UreD  30.71 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1197  urease accessory protein UreD  25.31 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.294974  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3209  Urease accessory protein UreD  34.78 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0696  urease accessory protein UreD  31.64 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2718  urease accessory protein UreD  29.06 
 
 		 308 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.274036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64335  urease accessory protein  30.77 
 
 		 280 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5585  urease accessory protein  30.77 
 
 		 280 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1770  urease accessory protein UreD  31.21 
 
 		 285 aa  42.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2883  urease accessory protein UreD  31.76 
 
 		 296 aa  42.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>