30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0830 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0830  putative urease accessory protein  100 
 
 		 319 aa  595  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5702  putative urease accessory protein UreD  51.02 
 
 		 297 aa  235  9e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.119929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3207  Urease accessory protein UreD  46.55 
 
 		 256 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00681143  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6444  urease accessory protein  35.46 
 
 		 270 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31216  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0502  urease accessory protein UreD  37.32 
 
 		 281 aa  125  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03280  urease accessory protein UreH  35.59 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3079  putative urease accessory protein  40.56 
 
 		 208 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0546713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3349  putative urease accessory protein  40.91 
 
 		 212 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2846  putative urease accessory protein  37.5 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.72908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2829  putative urease accessory protein  37.5 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2802  putative urease accessory protein  37.5 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0194  putative urease accessory protein  42.38 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11881  urease accessory protein ureD  38.57 
 
 		 214 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.339466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0275  Urease accessory protein UreH-like protein  37.36 
 
 		 240 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2752  hypothetical protein  30.19 
 
 		 233 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0794267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3507  Urease accessory protein UreH-like protein  34.34 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.223661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0694  Urease accessory protein UreH-like protein  31.8 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0135434  hitchhiker  0.0000000541672 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3406  putative urease accessory protein  33.15 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  36.28 
 
 		 279 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03480  urease accessory protein UreH  29.63 
 
 		 284 aa  50.8  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  27.93 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  33.65 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2455  urease accessory protein UreD  27.6 
 
 		 287 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0693  hypothetical protein  36.08 
 
 		 284 aa  49.7  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0249128  hitchhiker  0.0000000487689 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  28 
 
 		 293 aa  49.3  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1754  hypothetical protein  34.52 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.477178  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2718  urease accessory protein UreD  27.44 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.274036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3057  Urease accessory protein UreD  29.22 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2996  urease accessory protein UreD  25.56 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0984  urease accessory protein UreD  31.82 
 
 		 275 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130155  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>