143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1197 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1197  urease accessory protein UreD  100 
 
 		 301 aa  618  1e-176  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.294974  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1499  urease accessory protein UreD  47.86 
 
 		 321 aa  278  9e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4009  urease accessory protein UreD  48.1 
 
 		 291 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0793  urease accessory protein UreD  49.48 
 
 		 291 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2181  urease accessory protein UreD  47.5 
 
 		 291 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3132  UreD-family accessory protein  47.5 
 
 		 346 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0782  urease accessory protein UreD  49.48 
 
 		 291 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0727  urease accessory protein UreD  47.5 
 
 		 291 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2560  urease accessory protein UreD  47.5 
 
 		 291 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3072  urease accessory protein UreD  47.5 
 
 		 291 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3108  urease accessory protein UreD  47.5 
 
 		 291 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2053  urease accessory protein UreD  47.5 
 
 		 291 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0991  urease accessory protein UreD  47.14 
 
 		 289 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271998  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2487  urease accessory protein UreD  48.56 
 
 		 291 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0949  Urease accessory protein UreD  44.56 
 
 		 293 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3688  putative urease accessory protein  44.56 
 
 		 293 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139672 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0957  urease accessory protein UreD  44.37 
 
 		 293 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0865404  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0903  urease accessory protein UreD  47.06 
 
 		 291 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0873  urease accessory protein UreD  47.4 
 
 		 291 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0424  urease accessory protein UreD  46.71 
 
 		 291 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2256  urease accessory protein UreD  44.69 
 
 		 293 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2188  Urease accessory protein UreD  45.16 
 
 		 295 aa  255  6e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1865  Urease accessory protein UreD  45.16 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.479381 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2036  urease accessory protein ureD  45.88 
 
 		 295 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.133178  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  43.48 
 
 		 288 aa  232  7.000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1186  urease accessory protein UreD  39.66 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2883  urease accessory protein UreD  40.96 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3936  Urease accessory protein UreD  37.45 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09910  Urease accessory protein UreD  39.49 
 
 		 279 aa  200  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930917  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0585  urease accessory protein UreD  39.42 
 
 		 279 aa  199  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64335  urease accessory protein  38.27 
 
 		 280 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5585  urease accessory protein  38.27 
 
 		 280 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4890  urease accessory protein UreD  40.15 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1770  urease accessory protein UreD  37.41 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4431  urease accessory protein UreD  40.15 
 
 		 281 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0696  urease accessory protein UreD  37.32 
 
 		 278 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2444  urease accessory protein UreD  33.7 
 
 		 274 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792758  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  32.61 
 
 		 293 aa  166  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0218  urease accessory protein D  34.78 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.842987 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1238  urease accessory protein UreD  33.7 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3376  urease accessory protein UreD  34.05 
 
 		 276 aa  159  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0953  urease accessory protein UreD  32.06 
 
 		 312 aa  159  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3463  urease accessory protein UreD  35.66 
 
 		 274 aa  157  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000478315  normal  0.195729 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3101  Urease accessory protein UreD  33.21 
 
 		 277 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0742  UreD-family accessory protein  37.82 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.16649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2938  urease accessory protein UreD  33.69 
 
 		 277 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1004  urease accessory protein UreD  32.26 
 
 		 276 aa  145  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0879  urease accessory protein UreD  32.75 
 
 		 302 aa  145  8.000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1082  urease accessory protein UreD  42.13 
 
 		 276 aa  145  9e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2996  urease accessory protein UreD  32.97 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3971  Urease accessory protein UreD  32.5 
 
 		 276 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  31.16 
 
 		 284 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1390  urease accessory protein UreD  32.01 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2414  urease accessory protein UreD  32.14 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2308  urease accessory protein UreD  31.07 
 
 		 313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00886  putative urease accessory protein UreD  29.25 
 
 		 320 aa  139  7e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1092  urease accessory protein UreD  39.11 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1414  urease accessory protein UreD  38.38 
 
 		 276 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  30.18 
 
 		 279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2991  urease accessory protein UreD  34.95 
 
 		 313 aa  135  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.866149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2842  urease accessory protein UreD  31.02 
 
 		 277 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2847  urease accessory protein UreD  30.29 
 
 		 278 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4154  urease accessory protein UreD  32.26 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2680  urease accessory protein UreD  28.2 
 
 		 302 aa  102  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3486  urease accessory protein  31.3 
 
 		 278 aa  99  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3057  Urease accessory protein UreD  30.5 
 
 		 273 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3313  Urease accessory protein UreD  31.13 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1707  Urease accessory protein UreD  25.83 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605089 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0989  urease accessory protein UreD  31.07 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1024  urease accessory protein UreD  26.81 
 
 		 289 aa  93.6  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3308  urease accessory protein UreD  27.71 
 
 		 270 aa  90.5  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0886683  normal  0.364033 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1052  urease accessory protein UreD  27.64 
 
 		 307 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  31.74 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2370  urease accessory protein  30.19 
 
 		 281 aa  87.4  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.512779 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29781  urease accessory protein UreD  26.3 
 
 		 299 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  27.61 
 
 		 283 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19231  urease accessory protein UreD  27.27 
 
 		 307 aa  86.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.480391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7013  putative urease accessory protein UreD  30.59 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2014  Urease accessory protein UreD  24.23 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3209  Urease accessory protein UreD  28.78 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2469  urease accessory protein UreD  30.5 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2214  urease accessory protein UreD  28.44 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00280053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0397  Urease accessory protein UreD  29.33 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585213  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2389  urease accessory protein UreD  26.89 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.274527 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3658  urease accessory protein UreD  23.48 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3245  Urease accessory protein UreD  28.78 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0388  urease accessory protein UreD  25 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2767  Urease accessory protein UreD  22.91 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0683  urease accessory protein UreD  22.87 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2062  Urease accessory protein UreD  24.09 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000769283  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0984  urease accessory protein UreD  31.43 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3020  urease accessory protein UreD  31.37 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  29.34 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2718  urease accessory protein UreD  24.44 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.274036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2624  urease accessory protein D  25.17 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.829261  normal  0.578413 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1212  urease accessory protein UreD  30.4 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1812  urease accessory protein UreD  24.66 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1362  urease accessory protein UreD  26.16 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1318  urease accessory protein UreD  26.16 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4047  urease accessory protein UreD  28.08 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>