137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1499 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I1499  urease accessory protein UreD  100 
 
 
321 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3132  UreD-family accessory protein  92.6 
 
 
346 aa  577  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2181  urease accessory protein UreD  92.78 
 
 
291 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670086  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0727  urease accessory protein UreD  92.78 
 
 
291 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2560  urease accessory protein UreD  92.78 
 
 
291 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3072  urease accessory protein UreD  92.78 
 
 
291 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3108  urease accessory protein UreD  92.78 
 
 
291 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2053  urease accessory protein UreD  92.78 
 
 
291 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4009  urease accessory protein UreD  73.63 
 
 
291 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2487  urease accessory protein UreD  73.63 
 
 
291 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0793  urease accessory protein UreD  73.29 
 
 
291 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0782  urease accessory protein UreD  72.95 
 
 
291 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0873  urease accessory protein UreD  72.26 
 
 
291 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0903  urease accessory protein UreD  71.58 
 
 
291 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0424  urease accessory protein UreD  71.23 
 
 
291 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2256  urease accessory protein UreD  64.97 
 
 
293 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3688  putative urease accessory protein  59.86 
 
 
293 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.139672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0949  Urease accessory protein UreD  57.82 
 
 
293 aa  347  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0957  urease accessory protein UreD  51.24 
 
 
293 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0865404  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1865  Urease accessory protein UreD  51.6 
 
 
295 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.479381 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1197  urease accessory protein UreD  47.86 
 
 
301 aa  278  1e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.294974  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2188  Urease accessory protein UreD  50.89 
 
 
295 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2036  urease accessory protein ureD  50 
 
 
295 aa  276  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.133178  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0991  urease accessory protein UreD  53.6 
 
 
289 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271998  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1186  urease accessory protein UreD  44.52 
 
 
305 aa  235  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  43.88 
 
 
288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1770  urease accessory protein UreD  39.72 
 
 
285 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1092  urease accessory protein UreD  41.34 
 
 
278 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2883  urease accessory protein UreD  40.07 
 
 
296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3936  Urease accessory protein UreD  38.89 
 
 
292 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09910  Urease accessory protein UreD  40.86 
 
 
279 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930917  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3101  Urease accessory protein UreD  42.91 
 
 
277 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64335  urease accessory protein  41.09 
 
 
280 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164957  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5585  urease accessory protein  41.09 
 
 
280 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0585  urease accessory protein UreD  39.27 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2414  urease accessory protein UreD  41.3 
 
 
277 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  37.28 
 
 
293 aa  169  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4890  urease accessory protein UreD  38.95 
 
 
281 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0696  urease accessory protein UreD  38.91 
 
 
278 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  36.1 
 
 
279 aa  166  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4431  urease accessory protein UreD  38.77 
 
 
281 aa  165  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645112  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2444  urease accessory protein UreD  38.99 
 
 
274 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792758  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2996  urease accessory protein UreD  37.79 
 
 
298 aa  159  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1414  urease accessory protein UreD  41.71 
 
 
276 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.421382 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0879  urease accessory protein UreD  35.56 
 
 
302 aa  158  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  37.14 
 
 
284 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3971  Urease accessory protein UreD  35.82 
 
 
276 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3463  urease accessory protein UreD  37.72 
 
 
274 aa  156  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000478315  normal  0.195729 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3376  urease accessory protein UreD  35.34 
 
 
276 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2842  urease accessory protein UreD  40.22 
 
 
277 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2938  urease accessory protein UreD  38.77 
 
 
277 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2308  urease accessory protein UreD  37.28 
 
 
313 aa  153  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2847  urease accessory protein UreD  39.86 
 
 
278 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598121  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1238  urease accessory protein UreD  33.45 
 
 
329 aa  151  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1390  urease accessory protein UreD  37.28 
 
 
276 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1004  urease accessory protein UreD  35.47 
 
 
276 aa  150  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0742  UreD-family accessory protein  40.24 
 
 
341 aa  149  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.16649 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1082  urease accessory protein UreD  36.92 
 
 
276 aa  146  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0218  urease accessory protein D  31.88 
 
 
295 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.842987 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0953  urease accessory protein UreD  31.97 
 
 
312 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00886  putative urease accessory protein UreD  28.24 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2991  urease accessory protein UreD  28.09 
 
 
313 aa  116  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.866149 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0989  urease accessory protein UreD  33.63 
 
 
298 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2624  urease accessory protein D  30.23 
 
 
327 aa  92.8  6e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.829261  normal  0.578413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3057  Urease accessory protein UreD  36.68 
 
 
273 aa  93.2  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2469  urease accessory protein UreD  36.94 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229131  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3209  Urease accessory protein UreD  34.93 
 
 
266 aa  87  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4154  urease accessory protein UreD  32.39 
 
 
289 aa  86.7  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2718  urease accessory protein UreD  31.47 
 
 
308 aa  85.9  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.274036  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29781  urease accessory protein UreD  28.57 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1707  Urease accessory protein UreD  28.57 
 
 
286 aa  84  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605089 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2680  urease accessory protein UreD  30.05 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3313  Urease accessory protein UreD  34.3 
 
 
273 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0397  Urease accessory protein UreD  32.04 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585213  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  33.33 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1024  urease accessory protein UreD  28.95 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2214  urease accessory protein UreD  31.43 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00280053 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2254  urease accessory protein D  28.42 
 
 
325 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3245  Urease accessory protein UreD  30.69 
 
 
309 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2389  urease accessory protein UreD  32.62 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.274527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2062  Urease accessory protein UreD  29.43 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000769283  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3020  urease accessory protein UreD  33 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  36.18 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0267  urease accessory protein UreD  35.61 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.628784  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0281  urease accessory protein UreD  35.61 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  34.87 
 
 
279 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3486  urease accessory protein  35.71 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2014  Urease accessory protein UreD  28.57 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1362  urease accessory protein UreD  27.6 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1052  urease accessory protein UreD  22.34 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2767  Urease accessory protein UreD  23.11 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0331  urease accessory protein UreD  34.09 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2370  urease accessory protein  29.53 
 
 
281 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.512779 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0396  Urease accessory protein UreD  29.83 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19231  urease accessory protein UreD  23.64 
 
 
307 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.480391  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1318  urease accessory protein UreD  28.95 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7013  putative urease accessory protein UreD  34.13 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3308  urease accessory protein UreD  28.69 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0886683  normal  0.364033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3697  urease accessory protein UreD  35.48 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0984  urease accessory protein UreD  33.33 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130155  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>