99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4440 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4440  putative urease accessory protein ureD  100 
 
 		 286 aa  558  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1138  Urease accessory protein UreD  36.05 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1359  Urease accessory protein UreD  36.29 
 
 		 294 aa  125  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1199  urease accessory protein UreD  36.05 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1964  putative urease accessory protein ureD  39.44 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6187  urease accessory protein UreD  33.61 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1555  Urease accessory protein UreD  32.22 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2718  urease accessory protein UreD  29.89 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.274036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2195  urease accessory protein UreD  27.73 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00406195  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2408  urease accessory protein UreD  27.2 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.815614  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2036  urease accessory protein ureD  32.07 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.133178  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1463  Urease accessory protein UreD  30.37 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1301  urease accessory protein UreD  30.37 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5120  Urease accessory protein UreD  28 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1186  urease accessory protein UreD  33.09 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0749  urease accessory protein UreD  25.28 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  25.82 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1683  urease accessory protein UreD  28.04 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2256  urease accessory protein UreD  28.68 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  28.49 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2389  urease accessory protein UreD  37.11 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.274527 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0696  urease accessory protein UreD  29.17 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1083  urease accessory protein UreD  23.84 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1137  urease accessory protein UreD  23.84 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3688  putative urease accessory protein  32.12 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0949  Urease accessory protein UreD  30.88 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  34.59 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09910  Urease accessory protein UreD  30.5 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0782  urease accessory protein UreD  29.41 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0793  urease accessory protein UreD  26.84 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  26.09 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2062  Urease accessory protein UreD  26.77 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000769283  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2370  urease accessory protein  29.27 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.512779 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3101  Urease accessory protein UreD  32.95 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4009  urease accessory protein UreD  28.68 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3658  urease accessory protein UreD  23.89 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3132  UreD-family accessory protein  28 
 
 		 346 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2188  Urease accessory protein UreD  28.49 
 
 		 295 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3108  urease accessory protein UreD  28.27 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2181  urease accessory protein UreD  28.27 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2053  urease accessory protein UreD  28.27 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3072  urease accessory protein UreD  28.27 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2560  urease accessory protein UreD  28.27 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0727  urease accessory protein UreD  28.27 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0903  urease accessory protein UreD  31.9 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0424  urease accessory protein UreD  31.9 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1875  urease accessory protein UreD  24.06 
 
 		 278 aa  52.8  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.37143  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0991  urease accessory protein UreD  29.12 
 
 		 289 aa  52.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271998  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0984  urease accessory protein UreD  35.14 
 
 		 275 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1812  urease accessory protein UreD  28.97 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1707  Urease accessory protein UreD  32.99 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605089 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0059  Urease accessory protein UreD  28.29 
 
 		 271 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0331  urease accessory protein UreD  33.33 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0957  urease accessory protein UreD  30.43 
 
 		 293 aa  49.7  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0865404  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1499  urease accessory protein UreD  31.75 
 
 		 321 aa  49.7  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0585  urease accessory protein UreD  26.24 
 
 		 279 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1865  Urease accessory protein UreD  30.6 
 
 		 295 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.479381 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0873  urease accessory protein UreD  28.68 
 
 		 291 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4154  urease accessory protein UreD  30.86 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4414  Urease accessory protein UreD  21.03 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3486  urease accessory protein  28.87 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03480  urease accessory protein UreH  29.2 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7013  putative urease accessory protein UreD  32.65 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3020  urease accessory protein UreD  36.89 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0683  urease accessory protein UreD  21.77 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0388  urease accessory protein UreD  27.19 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784238  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0267  urease accessory protein UreD  32.99 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.628784  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2487  urease accessory protein UreD  27.94 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0281  urease accessory protein UreD  32.99 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2938  urease accessory protein UreD  30.06 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1770  urease accessory protein UreD  29.1 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3245  Urease accessory protein UreD  35.92 
 
 		 309 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3209  Urease accessory protein UreD  33.96 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0953  urease accessory protein UreD  32.17 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2455  urease accessory protein UreD  28.93 
 
 		 287 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2842  urease accessory protein UreD  30.64 
 
 		 277 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2318  urease accessory protein UreD  23.08 
 
 		 278 aa  45.8  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00527457  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2361  urease accessory protein UreD  23.08 
 
 		 278 aa  45.8  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.361313  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3936  Urease accessory protein UreD  26.9 
 
 		 292 aa  45.8  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0879  urease accessory protein UreD  29.38 
 
 		 302 aa  45.8  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2414  urease accessory protein UreD  31.9 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  30.21 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  30.93 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2847  urease accessory protein UreD  29.48 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0396  Urease accessory protein UreD  26.71 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4431  urease accessory protein UreD  28.99 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3313  Urease accessory protein UreD  31.31 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2624  urease accessory protein D  30.82 
 
 		 327 aa  45.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.829261  normal  0.578413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3057  Urease accessory protein UreD  29.29 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4890  urease accessory protein UreD  28.26 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0247  urease accessory protein UreD  27.33 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2444  urease accessory protein UreD  27.78 
 
 		 274 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792758  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1082  urease accessory protein UreD  29.19 
 
 		 276 aa  43.5  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1478  Urease accessory protein UreD  26.72 
 
 		 260 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0751352  normal  0.245102 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2680  urease accessory protein UreD  26.01 
 
 		 302 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64335  urease accessory protein  27.83 
 
 		 280 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5585  urease accessory protein  27.83 
 
 		 280 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0977  Urease accessory protein UreD  32.99 
 
 		 298 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2014  Urease accessory protein UreD  28.21 
 
 		 282 aa  42.4  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>