182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0755 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0755  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 124 aa  250  4.0000000000000004e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1323  carboxymuconolactone decarboxylase  66.13 
 
 		 137 aa  156  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.376227  normal  0.0337516 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2524  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  64.04 
 
 		 136 aa  152  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1186  carboxymuconolactone decarboxylase  64.04 
 
 		 136 aa  152  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396733  normal  0.385259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1996  carboxymuconolactone decarboxylase  62.28 
 
 		 136 aa  148  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0349754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2236  carboxymuconolactone decarboxylase  55.93 
 
 		 134 aa  137  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1189  carboxymuconolactone decarboxylase  50.82 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1188  carboxymuconolactone decarboxylase  38.14 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.373506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  39.36 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.36 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  39.36 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  39.36 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.3 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  38.3 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  36 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0521  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.78 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  36.17 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2237  carboxymuconolactone decarboxylase  34.43 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  30.83 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.71 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2361  hypothetical protein  29.66 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.68 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.48 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.55 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2931  carboxymuconolactone decarboxylase  37.04 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000640912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.48 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  32.97 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  32.97 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.69 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.16 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  33.71 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  40.48 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  39.29 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1326  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.1 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171416  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3905  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.34 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00819268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4019  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.34 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000710611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.56 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  39.29 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.48 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.69 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3459  carboxymuconolactone decarboxylase  37.65 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.07 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  32.26 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  32.29 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01020  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  31.33 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.141102 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  29.79 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.52 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.52 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  31 
 
 		 261 aa  51.6  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.65 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5410  carboxymuconolactone decarboxylase  39.13 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0441836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0952  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.58 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.52 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.52 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.52 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.52 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.52 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2446  carboxymuconolactone decarboxylase  38.04 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0521  carboxymuconolactone decarboxylase  28 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00160379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4700  carboxymuconolactone decarboxylase  39.13 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3662  carboxymuconolactone decarboxylase  39.13 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.318309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58220  hypothetical protein  36.9 
 
 		 128 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.876359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3566  carboxymuconolactone decarboxylase  38.04 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199431  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.12 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0944  carboxymuconolactone decarboxylase  32.61 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  32.14 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.03 
 
 		 402 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  30.34 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.18 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  35.44 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2511  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.52 
 
 		 281 aa  48.1  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  28 
 
 		 295 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5222  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.94 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3859  carboxymuconolactone decarboxylase  38.04 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.604596 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.47 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  27.17 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1368  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.78 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1430  carboxymuconolactone decarboxylase  35.96 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  34.15 
 
 		 391 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4519  carboxymuconolactone decarboxylase  32.94 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5046  carboxymuconolactone decarboxylase  37.65 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.336576 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0538  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.59 
 
 		 185 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1291  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.59 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2542  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.59 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0234299  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1458  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.93 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.61 
 
 		 299 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0268  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.59 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.578525  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1289  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.59 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1029  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.59 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.1 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  32.94 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.11 
 
 		 260 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.73 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2960  carboxymuconolactone decarboxylase  34.21 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00839552  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1781  carboxymuconolactone decarboxylase  34.83 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.44 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 248 aa  47  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  34.18 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>