79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1189 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1189  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 141 aa  281  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1323  carboxymuconolactone decarboxylase  57.86 
 
 		 137 aa  134  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.376227  normal  0.0337516 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2236  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 		 134 aa  117  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1186  carboxymuconolactone decarboxylase  48.06 
 
 		 136 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396733  normal  0.385259 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2524  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.06 
 
 		 136 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303227  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0755  carboxymuconolactone decarboxylase  50.82 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1996  carboxymuconolactone decarboxylase  43.18 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0349754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1188  carboxymuconolactone decarboxylase  34.38 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.373506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.35 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  35.23 
 
 		 128 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.09 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2237  carboxymuconolactone decarboxylase  36.14 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  33.71 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.71 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  33.71 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.14 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0521  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.63 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  31.82 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.56 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  32.18 
 
 		 122 aa  47.4  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1458  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.8 
 
 		 132 aa  47.4  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0538  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.59 
 
 		 185 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2511  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.78 
 
 		 281 aa  47  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1368  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.59 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1289  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.59 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2542  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.59 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0234299  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.09 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4713  carboxymuconolactone decarboxylase  35.29 
 
 		 300 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0268  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.59 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.578525  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1291  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.59 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1029  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.59 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5046  carboxymuconolactone decarboxylase  37.04 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.336576 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3566  carboxymuconolactone decarboxylase  37.04 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199431  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.63 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  36.11 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2446  carboxymuconolactone decarboxylase  35.8 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  33.77 
 
 		 391 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.23 
 
 		 248 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2931  carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000640912  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.89 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  33.8 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4019  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.15 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000710611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  35.37 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3662  carboxymuconolactone decarboxylase  34.57 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.318309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.8 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3905  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.15 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00819268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4700  carboxymuconolactone decarboxylase  34.57 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  34.34 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3075  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.17 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  28.89 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1326  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.52 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171416  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  35.37 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58220  hypothetical protein  38.57 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.876359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  29.55 
 
 		 261 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1912  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.04 
 
 		 115 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116994  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5410  carboxymuconolactone decarboxylase  34.57 
 
 		 132 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0441836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 		 397 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.08 
 
 		 138 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01020  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  26.8 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.141102 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.89 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.08 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  37.14 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.4 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02910  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.31 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.62 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  29.87 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2687  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.53 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.22317 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2692  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.57 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00273056  normal  0.231258 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.11 
 
 		 117 aa  40.4  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0768  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.36 
 
 		 250 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000904176 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3257  carboxymuconolactone decarboxylase  30.12 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.146193  normal  0.0594926 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.36 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3459  carboxymuconolactone decarboxylase  32.14 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.27 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.47 
 
 		 260 aa  40.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1281  alkylhydroperoxidase  29.69 
 
 		 100 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.534657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4526  carboxymuconolactone decarboxylase  32.88 
 
 		 128 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>