89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2623 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2623  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  483  1e-136  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23150  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  44.86 
 
 
240 aa  178  5.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2319  cobalt transport protein  42.52 
 
 
245 aa  176  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.945459 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4773  cobalt transport protein  44.54 
 
 
239 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25720  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  40.97 
 
 
241 aa  149  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2306  cobalt transport protein  40.09 
 
 
257 aa  123  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0283  transporter, putative  36.04 
 
 
234 aa  119  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0420  cobalt ABC transporter permease  37 
 
 
233 aa  109  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0190437  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4171  cobalt transport protein  34.5 
 
 
249 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00476195  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0678  cobalt transport protein  29.81 
 
 
227 aa  98.6  8e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4597  cobalt transport protein  33.48 
 
 
244 aa  97.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0314465 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1768  cobalt transport protein  40.94 
 
 
232 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0330  cobalt transport protein  38.98 
 
 
238 aa  94  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0242  hypothetical protein  28.94 
 
 
236 aa  87  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2654  cobalt transport protein  27.66 
 
 
231 aa  85.9  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.36556  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00730  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  29.87 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.648464  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0323  cobalt transport protein  30 
 
 
242 aa  77  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1597  transporter, putative  32.39 
 
 
235 aa  77.4  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0314  cobalt transport protein  33.82 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.892766  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1433  cobalt transport protein  27.95 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.43153  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2157  ABC transporter, permease protein, putative  25.55 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000133808  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0905  hypothetical protein  28.21 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.313677  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0256  hypothetical protein  27.46 
 
 
232 aa  62.4  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  28.45 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1493  cobalt transport protein  25.71 
 
 
231 aa  60.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.192292  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1483  cobalt transport protein  27.67 
 
 
225 aa  59.7  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0899  ABC transporter, permease protein, putative  31.25 
 
 
238 aa  59.7  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  24.8 
 
 
770 aa  58.2  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3088  cobalt transport protein  28.16 
 
 
226 aa  56.2  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  29.69 
 
 
264 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1604  ABC transporter, permease protein, putative  26.67 
 
 
228 aa  54.7  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  27.34 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0335  cobalt transport protein  25.21 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  31.15 
 
 
270 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 
287 aa  53.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  28.12 
 
 
264 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  28.12 
 
 
264 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  28.12 
 
 
264 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0310  hypothetical protein  27.52 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0573771  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  28.12 
 
 
264 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  28.12 
 
 
264 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  28.12 
 
 
264 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  28.12 
 
 
264 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  27.34 
 
 
264 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  26.62 
 
 
276 aa  53.1  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  27.34 
 
 
264 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  27.82 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  27.78 
 
 
276 aa  49.7  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  27.73 
 
 
266 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  28.57 
 
 
266 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  29.41 
 
 
262 aa  48.9  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  23.21 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  26.19 
 
 
273 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  28.16 
 
 
287 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  25.4 
 
 
266 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1488  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  24.16 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.308498  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  25.4 
 
 
266 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  25.98 
 
 
273 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3473  cobalt transport protein  23.45 
 
 
259 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4125  cobalt transport protein  28.57 
 
 
217 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.902173  hitchhiker  0.0000589617 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  23.7 
 
 
276 aa  45.8  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  27.2 
 
 
336 aa  45.8  0.0006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  27.45 
 
 
279 aa  45.8  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  27.88 
 
 
291 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  28.43 
 
 
279 aa  45.8  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  23.13 
 
 
259 aa  45.4  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  31.4 
 
 
332 aa  45.8  0.0007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0660  cobalt transport family protein  26.67 
 
 
279 aa  45.4  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.11691  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  27.88 
 
 
291 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  26.19 
 
 
279 aa  45.4  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2659  cobalt transport protein  25.58 
 
 
266 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000035997 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2462  cobalt transport protein  27.36 
 
 
287 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  24.14 
 
 
266 aa  44.7  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2425  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  27.36 
 
 
287 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  25 
 
 
263 aa  43.9  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf374  cobalt ABC transporter, permease protein  26.61 
 
 
314 aa  43.9  0.002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004205  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1034  cobalt transport protein  29.56 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.876495  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  21.77 
 
 
285 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  27.33 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2642  cobalt transport protein  25.58 
 
 
273 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.357292  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  24 
 
 
266 aa  44.3  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1539  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.6 
 
 
278 aa  43.5  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0337  cobalt transport protein  24.11 
 
 
256 aa  42.7  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0766  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  21.83 
 
 
213 aa  42.7  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.156344  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1922  cobalt transport protein  28.57 
 
 
221 aa  42.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.493439  hitchhiker  0.00315513 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  24.62 
 
 
268 aa  42.4  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  24.62 
 
 
268 aa  42.4  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1102  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.98 
 
 
270 aa  42  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4361  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.56 
 
 
269 aa  42  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>