More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1453 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  100 
 
 
267 aa  536  1e-151  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  46.91 
 
 
266 aa  231  7.000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  46.15 
 
 
264 aa  228  6e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  41.6 
 
 
266 aa  226  2e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0320  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  50.41 
 
 
267 aa  226  3e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00398229  hitchhiker  1.85295e-17 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  40.89 
 
 
268 aa  222  6e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  40.89 
 
 
268 aa  222  6e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  46.83 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  39.41 
 
 
268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  39.41 
 
 
268 aa  218  7e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  43.51 
 
 
264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  43.51 
 
 
264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  42.13 
 
 
268 aa  211  7.999999999999999e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  43.13 
 
 
264 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  43.13 
 
 
264 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  43.13 
 
 
264 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  43.13 
 
 
264 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  43.13 
 
 
264 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  43.13 
 
 
264 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  42.37 
 
 
264 aa  209  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  42.37 
 
 
264 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  44.62 
 
 
267 aa  207  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  42.75 
 
 
264 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  41.94 
 
 
267 aa  205  7e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  40.16 
 
 
270 aa  203  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  40.68 
 
 
267 aa  203  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  41.53 
 
 
265 aa  201  9e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  42.68 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  37.75 
 
 
263 aa  195  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  37.75 
 
 
263 aa  195  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  36.67 
 
 
269 aa  193  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  37.02 
 
 
268 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  45.23 
 
 
262 aa  186  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  35.47 
 
 
264 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  37.24 
 
 
266 aa  179  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  40.95 
 
 
255 aa  178  9e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  34.87 
 
 
269 aa  175  8e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  36.95 
 
 
265 aa  175  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  36.48 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  36.07 
 
 
269 aa  160  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  34.22 
 
 
262 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  30.34 
 
 
336 aa  159  6e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  37.92 
 
 
264 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  35.17 
 
 
259 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  31.96 
 
 
332 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  33.2 
 
 
265 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  33.84 
 
 
263 aa  149  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  35.1 
 
 
271 aa  148  8e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  34.98 
 
 
271 aa  145  9e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2470  cobalt transport protein  32.4 
 
 
275 aa  142  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105266  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  40.54 
 
 
438 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  31.51 
 
 
810 aa  134  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf374  cobalt ABC transporter, permease protein  32.12 
 
 
314 aa  133  3e-30  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004205  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  31.18 
 
 
246 aa  133  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0997  cobalt transport protein  32.11 
 
 
264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  normal  0.445886 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2799  cobalt transport protein  29.68 
 
 
284 aa  125  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161091  hitchhiker  0.0000401783 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2300  cobalt ABC transporter permease protein  32.11 
 
 
263 aa  125  8.000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000489641  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24080  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  33.08 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1836  cobalt transport protein  31.97 
 
 
244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.507525  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12580  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  28.09 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  32.66 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1751  cobalt transport protein  30.8 
 
 
272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253796  normal  0.0321598 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  31.27 
 
 
270 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.04 
 
 
770 aa  101  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  25.89 
 
 
217 aa  99.8  5e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  27.48 
 
 
262 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0352  cobalt transport protein  26.51 
 
 
264 aa  98.2  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  27.57 
 
 
259 aa  97.8  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1130  cobalt transport protein  30.88 
 
 
258 aa  95.9  7e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  28.2 
 
 
255 aa  95.1  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19680  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  26.96 
 
 
231 aa  93.6  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0554754  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  28.31 
 
 
196 aa  92.4  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  28.33 
 
 
252 aa  89.7  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1964  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit  26.95 
 
 
255 aa  89.4  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  28.2 
 
 
287 aa  86.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  26.52 
 
 
256 aa  85.9  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  25.1 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  28.2 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1608  cobalt transport protein  29.35 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  31.03 
 
 
276 aa  81.6  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  28.23 
 
 
243 aa  82  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3687  cobalt transport protein  27.48 
 
 
197 aa  81.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4408  cobalt transport protein  24.9 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.371368  normal  0.0141186 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2485  cobalt transport protein  26.15 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  31.29 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0370  cobalt transport protein  30.29 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  28.4 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3473  cobalt transport protein  26.64 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3451  cobalt transport protein  27.31 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  25.09 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  26.32 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2897  cobalt transport protein  26.5 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00540411  hitchhiker  0.000146213 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  28.57 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5368  cobalt transport protein  25.78 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539179  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5279  cobalt transport protein  25.78 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  38.24 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5658  cobalt transport protein  25.78 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1229  cobalt transport protein  31.68 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.379694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2867  cobalt transport protein  30.97 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3229  cobalt transport protein  30.97 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.500857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>