106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0660 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0660  cobalt transport family protein  100 
 
 		 279 aa  558  1e-158  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.11691  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1135  cobalt transport protein  74.16 
 
 		 268 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1157  cobalt transport protein  74.16 
 
 		 268 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0609  cobalt transport protein  36.12 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1413  cobalt transport protein  31.85 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3823  cobalt transport protein  25.59 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457934  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3444  cobalt transport protein  27.07 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3864  cobalt transport protein  23.77 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  26.84 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3649  cobalt transport protein  26.35 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  25.39 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  28.4 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2044  cobalt transport protein  31.29 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0091  cobalt transport protein  24.71 
 
 		 258 aa  62  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0139648  normal  0.284452 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  23.81 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  27.51 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  27.51 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  30.43 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  22.09 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  26.46 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0821  cobalt ABC transporter permease  27.31 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.505848  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08030  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  24.65 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  23.91 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  23.23 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0253  cobalt transport protein  25.12 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.648323  normal  0.0540671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  25.63 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  27.78 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  25.14 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  25 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  24.26 
 
 		 266 aa  53.5  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  27.84 
 
 		 257 aa  52.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0589  ABC-type cobalt transport system  24.22 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946935  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  26.36 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  26.36 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07520  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  25.57 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.508014 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0337  cobalt transport protein  23.39 
 
 		 256 aa  49.7  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  27.23 
 
 		 266 aa  48.9  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  22.51 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23320  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  27.21 
 
 		 811 aa  48.9  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1894  cobalt transport protein  32.56 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154103  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1501  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  23.62 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  23.39 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  24.58 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  24.71 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2677  cobalt transport protein  27.37 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.503395  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  26.01 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  23.96 
 
 		 264 aa  47  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1768  ABC transporter, permease protein  27.33 
 
 		 297 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.689624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0370  cobalt transport protein  28.3 
 
 		 253 aa  47  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  23.79 
 
 		 276 aa  46.6  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.58 
 
 		 266 aa  46.2  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  24.72 
 
 		 263 aa  46.2  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  24.72 
 
 		 263 aa  46.2  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2623  hypothetical protein  26.67 
 
 		 246 aa  45.8  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1836  cobalt transport protein  23.53 
 
 		 244 aa  45.8  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.507525  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19680  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  23.19 
 
 		 231 aa  45.8  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0554754  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  24.53 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  32.14 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  23.98 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1652  cobalt transport protein  20.62 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.761015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  23.35 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  22.83 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  29.41 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2470  cobalt transport protein  23.81 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105266  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  23.81 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  26.46 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  23.46 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  24.12 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  25.49 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  22.01 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  23.93 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  22.01 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3044  cobalt transport protein  27.19 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  25.1 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2485  cobalt transport protein  20.33 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1539  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  22.73 
 
 		 278 aa  43.1  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1543  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  27.96 
 
 		 222 aa  43.5  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.690869  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1972  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  23.88 
 
 		 275 aa  43.5  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24080  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  27.68 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0682  cobalt transport protein  19.07 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000924748  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  25.55 
 
 		 764 aa  43.5  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  22.96 
 
 		 264 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  26.79 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  22.96 
 
 		 264 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  22.96 
 
 		 264 aa  42.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  22.96 
 
 		 264 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  22.96 
 
 		 264 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2115  cobalt transport protein  26.59 
 
 		 268 aa  42.7  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.990281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  22.87 
 
 		 264 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  22.96 
 
 		 264 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3009  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  25.44 
 
 		 292 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  26.34 
 
 		 267 aa  42.7  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  24.58 
 
 		 279 aa  42.7  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3338  ABC transporter, permease protein  25.44 
 
 		 268 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0462941  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3338  ABC transporter, permease protein  25.44 
 
 		 268 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3119  ABC transporter permease  25.44 
 
 		 292 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3106  cobalt ABC transporter, permease  30 
 
 		 292 aa  42.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3365  ABC transporter permease  25.44 
 
 		 292 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1229  cobalt transport protein  23.26 
 
 		 322 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.379694 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>