53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_3088 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_3088  cobalt transport protein  100 
 
 
226 aa  441  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0256  hypothetical protein  27.49 
 
 
232 aa  96.3  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1433  cobalt transport protein  36.46 
 
 
277 aa  90.9  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.43153  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0335  cobalt transport protein  31.25 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2654  cobalt transport protein  31.64 
 
 
231 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.36556  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2157  ABC transporter, permease protein, putative  30.25 
 
 
237 aa  79  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000133808  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0314  cobalt transport protein  33.81 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.892766  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0330  cobalt transport protein  29.63 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1483  cobalt transport protein  35.14 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0905  hypothetical protein  26.67 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.313677  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23150  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  30.15 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1604  ABC transporter, permease protein, putative  29.5 
 
 
228 aa  64.3  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2319  cobalt transport protein  31.8 
 
 
245 aa  63.5  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.945459 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4773  cobalt transport protein  26.85 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0420  cobalt ABC transporter permease  28.32 
 
 
233 aa  62.4  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0190437  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2306  cobalt transport protein  32.74 
 
 
257 aa  62  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4171  cobalt transport protein  34.17 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00476195  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0242  hypothetical protein  26.76 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4597  cobalt transport protein  34.17 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0314465 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  28.68 
 
 
279 aa  60.1  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1768  cobalt transport protein  32.35 
 
 
232 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  29.05 
 
 
279 aa  59.3  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0310  hypothetical protein  31.91 
 
 
241 aa  58.5  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0573771  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2623  hypothetical protein  29.46 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00730  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  30.5 
 
 
250 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.648464  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0899  ABC transporter, permease protein, putative  25.38 
 
 
238 aa  55.5  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1597  transporter, putative  28.71 
 
 
235 aa  55.1  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  27.75 
 
 
276 aa  55.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1493  cobalt transport protein  29.66 
 
 
231 aa  53.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.192292  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0283  transporter, putative  27.18 
 
 
234 aa  53.1  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0323  cobalt transport protein  26.9 
 
 
242 aa  52.8  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  22.4 
 
 
273 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  22.4 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0678  cobalt transport protein  23.13 
 
 
227 aa  47  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  27.68 
 
 
279 aa  47  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25720  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  26.05 
 
 
241 aa  46.2  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  28.89 
 
 
268 aa  45.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  28.89 
 
 
268 aa  45.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  28.46 
 
 
255 aa  45.4  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  28.57 
 
 
310 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1972  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  21.97 
 
 
275 aa  44.7  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2425  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  19.69 
 
 
287 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2659  cobalt transport protein  19.69 
 
 
266 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000035997 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2462  cobalt transport protein  19.17 
 
 
287 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2642  cobalt transport protein  19.17 
 
 
273 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.357292  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1501  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  24.63 
 
 
293 aa  43.5  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  21.9 
 
 
287 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2764  cobalt transport protein  22.83 
 
 
277 aa  42.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2707  cobalt transport protein  22.83 
 
 
277 aa  42.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  26.26 
 
 
264 aa  42.7  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  22.05 
 
 
266 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  25.25 
 
 
264 aa  42  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  27.45 
 
 
257 aa  41.6  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>