117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0283 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0283  transporter, putative  100 
 
 		 234 aa  463  1e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1768  cobalt transport protein  37.9 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0330  cobalt transport protein  36.23 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2623  hypothetical protein  34.04 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1433  cobalt transport protein  31.22 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.43153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0420  cobalt ABC transporter permease  30.05 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0190437  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0323  cobalt transport protein  32.85 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0314  cobalt transport protein  32.55 
 
 		 250 aa  105  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.892766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2654  cobalt transport protein  31.88 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0905  hypothetical protein  29.25 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.313677  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1483  cobalt transport protein  34.52 
 
 		 225 aa  95.1  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23150  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  30.7 
 
 		 240 aa  92.4  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2157  ABC transporter, permease protein, putative  26.49 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000133808  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2319  cobalt transport protein  30.33 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.945459 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25720  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  30.77 
 
 		 241 aa  89  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4773  cobalt transport protein  26.55 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00730  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  29.44 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.648464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0242  hypothetical protein  26.14 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2306  cobalt transport protein  33.8 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4597  cobalt transport protein  27.98 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0314465 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0899  ABC transporter, permease protein, putative  31.36 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1604  ABC transporter, permease protein, putative  26.42 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0335  cobalt transport protein  28.57 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4171  cobalt transport protein  26.73 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00476195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1597  transporter, putative  31.19 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0678  cobalt transport protein  25.6 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0256  hypothetical protein  28.78 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0310  hypothetical protein  26.79 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0573771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1972  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  28.1 
 
 		 275 aa  62  0.000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.2 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  27.38 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  26.62 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  26.92 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  35.56 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  25.64 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1493  cobalt transport protein  26.61 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.192292  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  27.52 
 
 		 276 aa  53.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  26.89 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3088  cobalt transport protein  26.92 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1539  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  26.52 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  26.85 
 
 		 243 aa  53.1  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  23.01 
 
 		 259 aa  52.8  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0369  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  27.69 
 
 		 273 aa  52.8  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  31.25 
 
 		 256 aa  52.4  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  25.51 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  24.84 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  25.71 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  25.51 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  25 
 
 		 266 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  25.64 
 
 		 273 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  29.81 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  23.85 
 
 		 266 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  24.49 
 
 		 264 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  23.33 
 
 		 266 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  26.4 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  26.4 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  26.4 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  26.4 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  30.56 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  26.4 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  26.19 
 
 		 270 aa  49.7  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  23.77 
 
 		 279 aa  49.7  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  24.44 
 
 		 287 aa  49.3  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 336 aa  49.3  0.00005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  23.23 
 
 		 269 aa  49.3  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  23.05 
 
 		 268 aa  49.3  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  23.05 
 
 		 268 aa  49.3  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  26.32 
 
 		 270 aa  49.3  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  23.14 
 
 		 266 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  24.03 
 
 		 266 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2707  cobalt transport protein  24.31 
 
 		 277 aa  48.5  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2764  cobalt transport protein  24.31 
 
 		 277 aa  48.5  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  25.6 
 
 		 264 aa  48.5  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  22.8 
 
 		 291 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  22.8 
 
 		 291 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  26.13 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  24.53 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf374  cobalt ABC transporter, permease protein  26.5 
 
 		 314 aa  47.8  0.0001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004205  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  23.08 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  25.78 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1006  ABC transporter membrane spanning protein  27.87 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  26.09 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1539  cobalt transport protein  30.63 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  30.91 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  26.15 
 
 		 268 aa  46.6  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  24.37 
 
 		 310 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3462  cobalt transport protein  28.71 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  24.45 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3226  cobalt transport protein  26.23 
 
 		 200 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2659  cobalt transport protein  23.14 
 
 		 266 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000035997 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  23.27 
 
 		 269 aa  45.8  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2462  cobalt transport protein  24.53 
 
 		 287 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2425  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  24.53 
 
 		 287 aa  45.4  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2799  cobalt transport protein  31.25 
 
 		 284 aa  45.4  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161091  hitchhiker  0.0000401783 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  24.68 
 
 		 264 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12580  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  30.48 
 
 		 269 aa  45.4  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2642  cobalt transport protein  24.53 
 
 		 273 aa  45.1  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.357292  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0380  cobalt transport protein  23.28 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.709452  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3136  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.42 
 
 		 255 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  28.32 
 
 		 196 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>