53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0380 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0380  cobalt transport protein  100 
 
 
254 aa  493  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.709452  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0905  hypothetical protein  27.47 
 
 
238 aa  82  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.313677  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0420  cobalt ABC transporter permease  33.91 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0190437  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1597  transporter, putative  27.36 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0242  hypothetical protein  25.62 
 
 
236 aa  63.9  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0335  cobalt transport protein  29.17 
 
 
253 aa  63.2  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0314  cobalt transport protein  29.71 
 
 
250 aa  60.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.892766  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  27.53 
 
 
266 aa  59.7  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2157  ABC transporter, permease protein, putative  27.4 
 
 
237 aa  58.5  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000133808  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0330  cobalt transport protein  27.27 
 
 
238 aa  58.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1539  cobalt transport protein  28.57 
 
 
245 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0256  hypothetical protein  28.43 
 
 
232 aa  53.9  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1768  cobalt transport protein  29.35 
 
 
232 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2654  cobalt transport protein  28.15 
 
 
231 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.36556  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  26.75 
 
 
257 aa  52.8  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4597  cobalt transport protein  28.12 
 
 
244 aa  50.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0314465 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2306  cobalt transport protein  29.2 
 
 
257 aa  48.9  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0678  cobalt transport protein  26.4 
 
 
227 aa  48.9  0.00008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.58 
 
 
266 aa  48.9  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1433  cobalt transport protein  24.84 
 
 
277 aa  48.9  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.43153  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1493  cobalt transport protein  23.21 
 
 
231 aa  48.5  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.192292  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25720  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  26.83 
 
 
241 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  26.23 
 
 
256 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  34.67 
 
 
264 aa  46.6  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1483  cobalt transport protein  28.26 
 
 
225 aa  47  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4171  cobalt transport protein  27.34 
 
 
249 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00476195  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4773  cobalt transport protein  21.37 
 
 
239 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2319  cobalt transport protein  26.47 
 
 
245 aa  46.2  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.945459 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  22.13 
 
 
255 aa  45.8  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  24.81 
 
 
267 aa  45.4  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  25.1 
 
 
264 aa  45.4  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0283  transporter, putative  23.64 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1604  ABC transporter, permease protein, putative  23.62 
 
 
228 aa  45.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  25.2 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  25.2 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0310  hypothetical protein  27.45 
 
 
241 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0573771  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2485  cobalt transport protein  26.67 
 
 
256 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  25.2 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  25.2 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  25.2 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  25.2 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1768  ABC transporter, permease protein  24.18 
 
 
297 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.689624  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  26.05 
 
 
287 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  25.2 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0682  cobalt transport protein  25.86 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000924748  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  24.1 
 
 
285 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  27.71 
 
 
265 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0323  cobalt transport protein  23.11 
 
 
242 aa  43.5  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  24.8 
 
 
264 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  22.09 
 
 
262 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  24.8 
 
 
264 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3101  cobalt transport protein  33.33 
 
 
233 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.486493  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  21.9 
 
 
273 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>