96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4171 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4171  cobalt transport protein  100 
 
 
249 aa  475  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00476195  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4597  cobalt transport protein  92.18 
 
 
244 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0314465 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2623  hypothetical protein  34.5 
 
 
246 aa  97.4  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1433  cobalt transport protein  35.4 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.43153  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0420  cobalt ABC transporter permease  29.57 
 
 
233 aa  82  0.000000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0190437  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23150  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  28.77 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2306  cobalt transport protein  29.61 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2654  cobalt transport protein  25.63 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.36556  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2319  cobalt transport protein  32.17 
 
 
245 aa  79  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.945459 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0242  hypothetical protein  28.77 
 
 
236 aa  78.2  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4773  cobalt transport protein  34.48 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0283  transporter, putative  26.76 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1768  cobalt transport protein  29.77 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1483  cobalt transport protein  34.18 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2157  ABC transporter, permease protein, putative  21.7 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000133808  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1597  transporter, putative  26.41 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25720  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  27.35 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0905  hypothetical protein  30.48 
 
 
238 aa  71.6  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.313677  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0330  cobalt transport protein  33.63 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0314  cobalt transport protein  30.86 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.892766  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1604  ABC transporter, permease protein, putative  29.85 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  28.74 
 
 
279 aa  63.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  30.06 
 
 
287 aa  63.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0323  cobalt transport protein  30.25 
 
 
242 aa  62.4  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0310  hypothetical protein  29.2 
 
 
241 aa  61.6  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0573771  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3088  cobalt transport protein  34.17 
 
 
226 aa  60.5  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  30 
 
 
243 aa  60.1  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0335  cobalt transport protein  37.61 
 
 
253 aa  60.1  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2425  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  26.52 
 
 
287 aa  56.2  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  27.27 
 
 
287 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2659  cobalt transport protein  26.52 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000035997 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  27.13 
 
 
266 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0337  cobalt transport protein  26.56 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  27.27 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2642  cobalt transport protein  25.76 
 
 
273 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.357292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2462  cobalt transport protein  25.76 
 
 
287 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  26.8 
 
 
269 aa  52.8  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0256  hypothetical protein  27.07 
 
 
232 aa  52.4  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  20.42 
 
 
273 aa  52.4  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  24.79 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00730  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  33.08 
 
 
250 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.648464  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  28.12 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1493  cobalt transport protein  30.56 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.192292  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  24.14 
 
 
279 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  25.21 
 
 
279 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  20.71 
 
 
273 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  24.84 
 
 
332 aa  50.4  0.00003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1608  cobalt transport protein  29.01 
 
 
262 aa  50.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  24.39 
 
 
241 aa  50.4  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25 
 
 
276 aa  50.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  27.68 
 
 
283 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4125  cobalt transport protein  31.37 
 
 
217 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.902173  hitchhiker  0.0000589617 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0678  cobalt transport protein  27.27 
 
 
227 aa  49.7  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  30.09 
 
 
267 aa  49.7  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3473  cobalt transport protein  23.29 
 
 
259 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  24.22 
 
 
291 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  23.02 
 
 
266 aa  48.9  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  24.22 
 
 
291 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  25.86 
 
 
285 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  23.36 
 
 
256 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  26.8 
 
 
271 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0380  cobalt transport protein  27.34 
 
 
254 aa  46.6  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.709452  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1972  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  22.92 
 
 
275 aa  46.6  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2707  cobalt transport protein  19.38 
 
 
277 aa  46.6  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2764  cobalt transport protein  19.38 
 
 
277 aa  46.6  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  25 
 
 
266 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  26.67 
 
 
266 aa  46.2  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8786  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporter-like protein  25.62 
 
 
272 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1922  cobalt transport protein  29.71 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.493439  hitchhiker  0.00315513 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  24.24 
 
 
266 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1501  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  20.82 
 
 
293 aa  44.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  21.14 
 
 
262 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  27.94 
 
 
261 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0682  cobalt transport protein  29.29 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000924748  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  28.57 
 
 
259 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  28.35 
 
 
270 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  25.86 
 
 
264 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  22.39 
 
 
276 aa  43.5  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0352  cobalt transport protein  27.15 
 
 
264 aa  43.5  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  25.49 
 
 
271 aa  43.5  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  23.53 
 
 
264 aa  43.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  24.03 
 
 
259 aa  43.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  25.86 
 
 
266 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  25.93 
 
 
264 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  25.93 
 
 
264 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  25.93 
 
 
264 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  25.93 
 
 
264 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0369  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  24.11 
 
 
273 aa  42.7  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  25.93 
 
 
264 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  25.93 
 
 
264 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  25.93 
 
 
264 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  29.73 
 
 
276 aa  42.7  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf374  cobalt ABC transporter, permease protein  29.58 
 
 
314 aa  42.4  0.007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004205  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  25.25 
 
 
336 aa  42.4  0.007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  25.47 
 
 
276 aa  42  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  26.32 
 
 
438 aa  42  0.01  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>