177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1950 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  100 
 
 		 241 aa  472  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3473  cobalt transport protein  63.71 
 
 		 259 aa  295  5e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0337  cobalt transport protein  40.76 
 
 		 256 aa  181  9.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  30.42 
 
 		 291 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  30.04 
 
 		 291 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  33.12 
 
 		 283 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  28.93 
 
 		 285 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  29.55 
 
 		 267 aa  91.7  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  30.17 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  30.17 
 
 		 264 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  30.17 
 
 		 264 aa  90.9  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  30.17 
 
 		 264 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  30.17 
 
 		 264 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  30.17 
 
 		 264 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  30.17 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  30.59 
 
 		 287 aa  90.1  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1768  ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 297 aa  89.4  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.689624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  30.47 
 
 		 264 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  29.22 
 
 		 264 aa  88.6  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  28.81 
 
 		 264 aa  88.6  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  28.63 
 
 		 264 aa  87  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  30.25 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  29.34 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  26.69 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  27.56 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  28.33 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  27.19 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  26.1 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  26.1 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  30.77 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  28.97 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  28.4 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  27.46 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  27.63 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2300  cobalt ABC transporter permease protein  30.36 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000489641  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  27.63 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  28.69 
 
 		 269 aa  75.1  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0370  cobalt transport protein  31.61 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  26.64 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  25.93 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  28.23 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  28.72 
 
 		 273 aa  72  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  28.14 
 
 		 268 aa  71.6  0.000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  28.24 
 
 		 269 aa  72  0.000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  29.22 
 
 		 273 aa  72  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.83 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  32.53 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  27.8 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  26.61 
 
 		 810 aa  69.7  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  30.92 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  29.75 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  25.85 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  35.1 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  28.51 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  29.29 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2707  cobalt transport protein  33.9 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2764  cobalt transport protein  33.9 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  27.03 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  30.3 
 
 		 279 aa  65.1  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0320  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  27.07 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00398229  hitchhiker  1.85295e-17 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  25.48 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  26.86 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  26.86 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  29.13 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  28.07 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  25.1 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  27.35 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  27.17 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1539  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  24.68 
 
 		 278 aa  62  0.000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  26.71 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2341  cobalt transport system permease protein  29.66 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1972  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  29.32 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  25.68 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19680  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  29.87 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0554754  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  23.38 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  29.17 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  29.17 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1539  cobalt transport protein  31.88 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  25.33 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  26.55 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3444  cobalt transport protein  28.43 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4408  cobalt transport protein  28.16 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.371368  normal  0.0141186 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  29.11 
 
 		 336 aa  58.9  0.00000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2044  cobalt transport protein  26.75 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1964  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit  28.46 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1257  cobalt transport protein  25.33 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000290738  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  26.02 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  30.69 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  20.83 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2485  cobalt transport protein  29.11 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  23.49 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  25.94 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0682  cobalt transport protein  24.77 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000924748  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2677  cobalt transport protein  29.49 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.503395  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3451  cobalt transport protein  25.44 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  27.12 
 
 		 764 aa  56.2  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2688  cobalt transport protein  30.94 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1894  cobalt transport protein  28.3 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154103  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  27.93 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf374  cobalt ABC transporter, permease protein  29.47 
 
 		 314 aa  54.7  0.000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>