36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1493 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1493  cobalt transport protein  100 
 
 
231 aa  455  1e-127  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.192292  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1604  ABC transporter, permease protein, putative  43.98 
 
 
228 aa  189  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2654  cobalt transport protein  27.6 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.36556  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0335  cobalt transport protein  30.77 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0310  hypothetical protein  33.12 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0573771  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1433  cobalt transport protein  30.86 
 
 
277 aa  65.5  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.43153  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2623  hypothetical protein  23.18 
 
 
246 aa  62  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0283  transporter, putative  26.15 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0242  hypothetical protein  28.46 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25720  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  25.21 
 
 
241 aa  58.5  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4773  cobalt transport protein  26.15 
 
 
239 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0905  hypothetical protein  24.43 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.313677  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2319  cobalt transport protein  25.71 
 
 
245 aa  57  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.945459 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1597  transporter, putative  29.09 
 
 
235 aa  56.6  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0330  cobalt transport protein  23.42 
 
 
238 aa  56.6  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3088  cobalt transport protein  26.61 
 
 
226 aa  56.2  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0314  cobalt transport protein  26.21 
 
 
250 aa  55.8  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.892766  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0256  hypothetical protein  25.23 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1483  cobalt transport protein  29.36 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23150  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  24.29 
 
 
240 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1768  cobalt transport protein  25.22 
 
 
232 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0420  cobalt ABC transporter permease  23.85 
 
 
233 aa  52.8  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0190437  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4171  cobalt transport protein  28.15 
 
 
249 aa  53.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00476195  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0380  cobalt transport protein  23.63 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.709452  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0899  ABC transporter, permease protein, putative  26.85 
 
 
238 aa  50.1  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2157  ABC transporter, permease protein, putative  19.51 
 
 
237 aa  48.9  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000133808  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4597  cobalt transport protein  29.03 
 
 
244 aa  48.5  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0314465 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1488  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.69 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.308498  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  27.27 
 
 
267 aa  46.2  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  27.27 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0323  cobalt transport protein  23.96 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  27.27 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3101  cobalt transport protein  29.41 
 
 
233 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.486493  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2306  cobalt transport protein  25.24 
 
 
257 aa  43.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3473  cobalt transport protein  25.87 
 
 
259 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1768  ABC transporter, permease protein  25.19 
 
 
297 aa  42.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.689624  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>