52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0899 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0899  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 238 aa  470  1e-132  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2654  cobalt transport protein  27.88 
 
 		 231 aa  85.5  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0283  transporter, putative  33.51 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0314  cobalt transport protein  35.71 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.892766  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2157  ABC transporter, permease protein, putative  32.56 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000133808  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1433  cobalt transport protein  27.2 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.43153  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1597  transporter, putative  35 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0242  hypothetical protein  31.13 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1604  ABC transporter, permease protein, putative  24.09 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1483  cobalt transport protein  26.15 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00730  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  40.37 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.648464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0905  hypothetical protein  23.96 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.313677  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0335  cobalt transport protein  30.83 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2623  hypothetical protein  31.25 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25720  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  26.73 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1768  cobalt transport protein  28.28 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0256  hypothetical protein  29.25 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0420  cobalt ABC transporter permease  32.93 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0190437  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0310  hypothetical protein  23.58 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0573771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0330  cobalt transport protein  24.27 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3088  cobalt transport protein  27.27 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4773  cobalt transport protein  33.33 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  29.81 
 
 		 267 aa  53.1  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  33.33 
 
 		 268 aa  52  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  33.33 
 
 		 268 aa  52  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23150  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  30.3 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2306  cobalt transport protein  33.33 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4597  cobalt transport protein  24.15 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0314465 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1493  cobalt transport protein  25.96 
 
 		 231 aa  48.9  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.192292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  25.93 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0380  cobalt transport protein  20.5 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.709452  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0323  cobalt transport protein  29.89 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2319  cobalt transport protein  27.72 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.945459 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  26.98 
 
 		 263 aa  46.6  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  26.98 
 
 		 263 aa  46.6  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  29.75 
 
 		 279 aa  46.6  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  27.37 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  30.28 
 
 		 196 aa  46.2  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  27.64 
 
 		 268 aa  46.2  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4171  cobalt transport protein  23.38 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00476195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0682  cobalt transport protein  26.11 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000924748  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  25 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  23.46 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  26.28 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  25 
 
 		 270 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  26.98 
 
 		 268 aa  42.4  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  23.08 
 
 		 273 aa  42.4  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  23.08 
 
 		 273 aa  42.4  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0609  cobalt transport protein  24.58 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  28.33 
 
 		 269 aa  42.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  26.98 
 
 		 268 aa  42.4  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  28.06 
 
 		 243 aa  42  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>