128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1597 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1597  transporter, putative  100 
 
 
235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1768  cobalt transport protein  30 
 
 
232 aa  99.4  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1483  cobalt transport protein  30.85 
 
 
225 aa  99  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1433  cobalt transport protein  28.63 
 
 
277 aa  97.8  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.43153  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0420  cobalt ABC transporter permease  28.24 
 
 
233 aa  95.9  5e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0190437  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0314  cobalt transport protein  28.95 
 
 
250 aa  93.6  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.892766  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2654  cobalt transport protein  27.23 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.36556  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0242  hypothetical protein  29.67 
 
 
236 aa  89.4  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0330  cobalt transport protein  29.67 
 
 
238 aa  89.4  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2623  hypothetical protein  32.34 
 
 
246 aa  86.7  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00730  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  31.51 
 
 
250 aa  85.5  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.648464  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1604  ABC transporter, permease protein, putative  30.19 
 
 
228 aa  82  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4597  cobalt transport protein  28.12 
 
 
244 aa  81.6  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0314465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4171  cobalt transport protein  26.41 
 
 
249 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00476195  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0678  cobalt transport protein  29.77 
 
 
227 aa  78.2  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4773  cobalt transport protein  28.31 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0905  hypothetical protein  30.23 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.313677  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2319  cobalt transport protein  24.77 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.945459 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23150  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  29.25 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0283  transporter, putative  31.86 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0899  ABC transporter, permease protein, putative  32.26 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2157  ABC transporter, permease protein, putative  28.46 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000133808  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2306  cobalt transport protein  32.11 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25720  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  33.59 
 
 
241 aa  67  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0310  hypothetical protein  27.94 
 
 
241 aa  67  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0573771  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0380  cobalt transport protein  26.72 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.709452  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0256  hypothetical protein  28.38 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0335  cobalt transport protein  33.65 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  26.83 
 
 
267 aa  63.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1493  cobalt transport protein  30.09 
 
 
231 aa  61.6  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.192292  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  23.77 
 
 
273 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0337  cobalt transport protein  25.22 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  27.91 
 
 
310 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1972  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  26.52 
 
 
275 aa  60.1  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  27.83 
 
 
273 aa  59.7  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  31.54 
 
 
332 aa  58.9  0.00000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3088  cobalt transport protein  28.85 
 
 
226 aa  58.5  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  28.8 
 
 
252 aa  58.5  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  29.79 
 
 
266 aa  57.8  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  29.73 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  29.73 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  23.43 
 
 
259 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0323  cobalt transport protein  23.61 
 
 
242 aa  56.6  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  26.4 
 
 
279 aa  56.2  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  28.97 
 
 
267 aa  56.2  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  25.17 
 
 
243 aa  55.8  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  27.15 
 
 
266 aa  55.5  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  24.22 
 
 
291 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  25.17 
 
 
268 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  24.22 
 
 
291 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  27.73 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  27.73 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  27.73 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  27.73 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  27.73 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  23.31 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  28.45 
 
 
264 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  25.6 
 
 
279 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  27.73 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  27.73 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  28.1 
 
 
264 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  26.39 
 
 
266 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  21.26 
 
 
283 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  26.43 
 
 
336 aa  53.1  0.000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  24.64 
 
 
279 aa  53.1  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  22.73 
 
 
276 aa  52.8  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  26.72 
 
 
264 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  26.72 
 
 
264 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  25.2 
 
 
276 aa  52.4  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  27.03 
 
 
265 aa  52  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  28.7 
 
 
264 aa  51.2  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0007  cobalt transport protein  22.8 
 
 
258 aa  50.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  24.28 
 
 
266 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  25 
 
 
276 aa  49.7  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  24.46 
 
 
241 aa  50.1  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  25.71 
 
 
266 aa  50.1  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  24.89 
 
 
257 aa  49.3  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  26.75 
 
 
259 aa  49.3  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  28.7 
 
 
267 aa  48.9  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  26.36 
 
 
269 aa  48.9  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  23.7 
 
 
266 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2867  cobalt transport protein  26.57 
 
 
290 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3229  cobalt transport protein  26.57 
 
 
290 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.500857 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1652  cobalt transport protein  25.71 
 
 
275 aa  48.5  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.761015  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  30.17 
 
 
264 aa  48.5  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  23.81 
 
 
276 aa  48.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  26.32 
 
 
271 aa  48.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3101  cobalt transport protein  25.4 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.486493  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  29.89 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  27.18 
 
 
265 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3473  cobalt transport protein  20.3 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  20.74 
 
 
256 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  26.92 
 
 
266 aa  47.4  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1501  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  21.03 
 
 
293 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1539  cobalt transport protein  31.13 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0884  cobalt transport protein  24.22 
 
 
291 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  21.67 
 
 
269 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  21.93 
 
 
285 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.68 
 
 
269 aa  46.2  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3565  cobalt transport protein  25.87 
 
 
309 aa  46.2  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0616568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>