127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1652 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1652  cobalt transport protein  100 
 
 
275 aa  525  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.761015  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1645  cobalt transport protein  58.9 
 
 
247 aa  212  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1257  cobalt transport protein  32.78 
 
 
259 aa  90.5  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000290738  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1894  cobalt transport protein  30.04 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154103  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3451  cobalt transport protein  31.09 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4408  cobalt transport protein  31.87 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.371368  normal  0.0141186 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2111  cobalt transport protein  33.95 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.105406  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  27.15 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  25.83 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  29.7 
 
 
259 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  24.89 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  24.89 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  27.46 
 
 
268 aa  63.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  27.46 
 
 
268 aa  63.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  27.74 
 
 
252 aa  63.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  27.49 
 
 
270 aa  63.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  29.21 
 
 
267 aa  62.8  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  27.32 
 
 
283 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  24.52 
 
 
285 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3415  ABC transporter permease  25.71 
 
 
235 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.119505 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  29.69 
 
 
268 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  34.34 
 
 
265 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3260  hypothetical protein  29.24 
 
 
235 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3355  hypothetical protein  29.24 
 
 
235 aa  59.3  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.587862  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3310  ABC transporter permease  26.5 
 
 
235 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  27.03 
 
 
268 aa  58.9  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3009  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  20.3 
 
 
292 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3313  ABC transporter permease protein  25.71 
 
 
235 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3246  ABC transporter permease  25.71 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3106  cobalt ABC transporter, permease  20.74 
 
 
292 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  30.63 
 
 
264 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3235  ABC transporter permease protein  26.29 
 
 
235 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3338  ABC transporter, permease protein  22.64 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0462941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  32.67 
 
 
265 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  26.53 
 
 
266 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  29.73 
 
 
264 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  29.73 
 
 
264 aa  55.8  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  29.73 
 
 
264 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  29.73 
 
 
264 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  32.22 
 
 
264 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  29.73 
 
 
264 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3338  ABC transporter, permease protein  22.17 
 
 
268 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  29.73 
 
 
264 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  29.73 
 
 
264 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3119  ABC transporter permease  20.52 
 
 
292 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3365  ABC transporter permease  20.52 
 
 
292 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  29.73 
 
 
264 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  32.97 
 
 
266 aa  55.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  26.78 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  26.12 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2485  cobalt transport protein  30.85 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  31.11 
 
 
264 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  32.91 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  31.33 
 
 
279 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3067  hypothetical protein  28.65 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0427863 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4227  hypothetical protein  28.65 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1046  cobalt transport protein  18.8 
 
 
268 aa  54.7  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  24.49 
 
 
266 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3044  cobalt transport protein  24.88 
 
 
294 aa  53.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  25.19 
 
 
279 aa  53.5  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3318  ABC transporter, permease protein  21.23 
 
 
267 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.427182  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1913  ABC transporter, permease protein  20.75 
 
 
268 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  22.64 
 
 
266 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  25 
 
 
276 aa  52.8  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1413  cobalt transport protein  27.57 
 
 
260 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  24.77 
 
 
261 aa  52.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  28.57 
 
 
255 aa  52.8  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0370  cobalt transport protein  28.93 
 
 
253 aa  52.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  31.43 
 
 
256 aa  52.4  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  31.37 
 
 
264 aa  51.6  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  27.88 
 
 
287 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  24.2 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0609  cobalt transport protein  26 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2115  cobalt transport protein  27.01 
 
 
268 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.990281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  24.39 
 
 
266 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  26.62 
 
 
336 aa  50.8  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  34.34 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  23.65 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3324  ABC transporter, permease protein  19.91 
 
 
292 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  23.46 
 
 
262 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  25.35 
 
 
279 aa  50.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  22.95 
 
 
269 aa  49.7  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  26.8 
 
 
276 aa  49.7  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  25.15 
 
 
267 aa  49.7  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0660  cobalt transport family protein  22.16 
 
 
279 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.11691  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0598  cobalt transport protein  30.77 
 
 
261 aa  49.3  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157547  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2677  cobalt transport protein  29.3 
 
 
287 aa  49.3  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.503395  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  27.67 
 
 
262 aa  49.3  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  25.35 
 
 
279 aa  49.3  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1597  transporter, putative  25.71 
 
 
235 aa  48.9  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  28.38 
 
 
257 aa  48.9  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  24.24 
 
 
287 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1608  cobalt transport protein  30.07 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0682  cobalt transport protein  27.69 
 
 
248 aa  48.5  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000924748  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  27.88 
 
 
264 aa  48.5  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0997  cobalt transport protein  29.88 
 
 
264 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  normal  0.445886 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1243  cobalt transport protein  23.38 
 
 
301 aa  47.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  29.91 
 
 
257 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  32 
 
 
438 aa  48.1  0.0002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2462  cobalt transport protein  22.7 
 
 
287 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>