158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1257 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1257  cobalt transport protein  100 
 
 
259 aa  508  1e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000290738  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2111  cobalt transport protein  36.9 
 
 
253 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.105406  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4408  cobalt transport protein  35.09 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.371368  normal  0.0141186 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1894  cobalt transport protein  32.79 
 
 
244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154103  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3451  cobalt transport protein  33.97 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  30.45 
 
 
269 aa  96.7  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  28.26 
 
 
252 aa  96.7  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  29.63 
 
 
268 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  29.28 
 
 
287 aa  93.2  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  29.26 
 
 
268 aa  92.4  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  29.71 
 
 
266 aa  92.4  6e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  26.47 
 
 
259 aa  92.4  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  29.76 
 
 
256 aa  92  9e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  23.6 
 
 
262 aa  89.7  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  29.66 
 
 
268 aa  88.6  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  30.49 
 
 
267 aa  86.3  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1652  cobalt transport protein  32.98 
 
 
275 aa  85.9  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.761015  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  30.59 
 
 
269 aa  85.9  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  28.99 
 
 
268 aa  85.5  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  28.99 
 
 
268 aa  85.5  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  26.64 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  26.64 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  26.86 
 
 
264 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  26.25 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  26.25 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  26.25 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  26.25 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  26.25 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  30.47 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  28.85 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  27.88 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  26.47 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  26.03 
 
 
264 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  29.57 
 
 
269 aa  78.6  0.00000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  27.78 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  25.61 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  26.64 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  27.87 
 
 
265 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  26.34 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  25.62 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  27.75 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  29.31 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  28.39 
 
 
336 aa  75.1  0.0000000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1645  cobalt transport protein  26.73 
 
 
247 aa  75.1  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  27.35 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  28.28 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  27.02 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  26.56 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1046  cobalt transport protein  25.91 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  26.67 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  27.39 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  25.11 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  27.31 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2485  cobalt transport protein  27.88 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  28.81 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  28.27 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  27.48 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  27.71 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  24.37 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  29.75 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0370  cobalt transport protein  26.77 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  24.89 
 
 
266 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  27.16 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  25.35 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  26.45 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1693  cobalt transport protein  27.23 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0637761  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0682  cobalt transport protein  26.89 
 
 
248 aa  67  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000924748  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  23.41 
 
 
285 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1972  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  30 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  25.19 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07520  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  24.05 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.508014 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  27.05 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  27.05 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  25.41 
 
 
264 aa  63.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  24.51 
 
 
263 aa  63.9  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  26.87 
 
 
273 aa  63.5  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  29.83 
 
 
255 aa  63.5  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  24.19 
 
 
276 aa  63.9  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  24.58 
 
 
267 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1539  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  29.7 
 
 
278 aa  63.2  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  25.1 
 
 
270 aa  62.4  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  24.17 
 
 
271 aa  62.4  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  27.13 
 
 
279 aa  62.4  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  26.14 
 
 
273 aa  62  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0609  cobalt transport protein  29.11 
 
 
261 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  27.98 
 
 
269 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3444  cobalt transport protein  25.34 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  29.79 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  23.75 
 
 
271 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  26.32 
 
 
267 aa  60.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  27.63 
 
 
266 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2707  cobalt transport protein  25.78 
 
 
277 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2764  cobalt transport protein  25.78 
 
 
277 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3355  hypothetical protein  25.19 
 
 
235 aa  59.3  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.587862  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1608  cobalt transport protein  24.79 
 
 
262 aa  59.3  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  27.16 
 
 
196 aa  58.9  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  25.53 
 
 
241 aa  59.3  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4227  hypothetical protein  25.19 
 
 
235 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3260  hypothetical protein  25.19 
 
 
235 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3067  hypothetical protein  25.19 
 
 
235 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0427863 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>