155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3444 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3444  cobalt transport protein  100 
 
 		 265 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3823  cobalt transport protein  89.43 
 
 		 266 aa  424  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457934  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2044  cobalt transport protein  49.4 
 
 		 264 aa  198  7.999999999999999e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3649  cobalt transport protein  47.22 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3864  cobalt transport protein  46.22 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0821  cobalt ABC transporter permease  36.4 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.505848  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0589  ABC-type cobalt transport system  44.08 
 
 		 258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946935  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5272  cobalt transport protein  44.89 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5361  cobalt transport protein  44.89 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5651  cobalt transport protein  44.89 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.263565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0972  cobalt transport protein  42.63 
 
 		 249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0253  cobalt transport protein  45.4 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.648323  normal  0.0540671 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0414  cobalt transport protein  33.47 
 
 		 895 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.624811 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4235  cobalt transport protein  39.58 
 
 		 294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08030  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  36.89 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  30.12 
 
 		 257 aa  88.6  8e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23320  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.57 
 
 		 811 aa  80.9  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07520  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  29.57 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.508014 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0091  cobalt transport protein  31.44 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0139648  normal  0.284452 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  26.51 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  24.89 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  24.89 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2485  cobalt transport protein  30.59 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0609  cobalt transport protein  27.71 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  30.68 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0660  cobalt transport family protein  28.02 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.11691  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  32.24 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  26.67 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  35.98 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1413  cobalt transport protein  30.33 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  22.54 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  25.98 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  21.97 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3451  cobalt transport protein  30.91 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0066  cobalt transport protein  32.31 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  33.33 
 
 		 764 aa  62.4  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4408  cobalt transport protein  30.12 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.371368  normal  0.0141186 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  28.57 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  28.97 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1539  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  26.87 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1367  cobalt ABC transporter, permease protein  28.14 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1693  cobalt transport protein  29.5 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0637761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  24.9 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1323  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  28.14 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3473  cobalt transport protein  30.65 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11750  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  36.27 
 
 		 656 aa  59.3  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.348562  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1257  cobalt transport protein  24.77 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000290738  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  27.97 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  23.83 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0071  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  30.66 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  25.79 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  33.33 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  26.6 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  26.32 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  26.32 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0682  cobalt transport protein  30.25 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000924748  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  26.32 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  26.32 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  26.32 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  26.32 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  26.32 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  27.37 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1972  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  22.99 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1135  cobalt transport protein  26.22 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1157  cobalt transport protein  26.22 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  32.3 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  30.86 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1488  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  32.14 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.308498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  26.32 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  26.32 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  23.48 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  25.73 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  24.23 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  27.54 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  25.21 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  32.47 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  22.83 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1663  cobalt transport protein  29.94 
 
 		 217 aa  53.1  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  28.14 
 
 		 267 aa  52.4  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0838  hypothetical protein  30.84 
 
 		 233 aa  52.4  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.103141  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2707  cobalt transport protein  25.34 
 
 		 277 aa  52  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2764  cobalt transport protein  25.34 
 
 		 277 aa  52  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0337  cobalt transport protein  27.46 
 
 		 256 aa  52  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  24.88 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  28.11 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  28.17 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  25.15 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  24.86 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0370  cobalt transport protein  28.29 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  33.55 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  24.9 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2111  cobalt transport protein  30.6 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.105406  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8786  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporter-like protein  31.93 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  27.89 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  26.57 
 
 		 310 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3139  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.14 
 
 		 255 aa  49.3  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.122579  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1539  cobalt transport protein  28.45 
 
 		 245 aa  49.3  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1751  cobalt transport protein  28.7 
 
 		 272 aa  48.9  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253796  normal  0.0321598 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  27.82 
 
 		 266 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>