144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4408 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4408  cobalt transport protein  100 
 
 
260 aa  492  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.371368  normal  0.0141186 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3451  cobalt transport protein  82.75 
 
 
261 aa  410  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2111  cobalt transport protein  38.96 
 
 
253 aa  139  7e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.105406  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1894  cobalt transport protein  36.21 
 
 
244 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154103  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1257  cobalt transport protein  35.09 
 
 
259 aa  135  7.000000000000001e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000290738  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  31.88 
 
 
268 aa  82  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1652  cobalt transport protein  31.87 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.761015  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  26.46 
 
 
259 aa  77  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1645  cobalt transport protein  32.72 
 
 
247 aa  75.1  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  26.04 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  27.69 
 
 
270 aa  72  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  31.75 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  26.49 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  26.12 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  28.35 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  28 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1046  cobalt transport protein  24.41 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  25 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  33.33 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  27.91 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  24.39 
 
 
285 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  28.23 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  29.46 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  25.56 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  30.06 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  25.43 
 
 
273 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1693  cobalt transport protein  27.92 
 
 
265 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0637761  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  26.61 
 
 
264 aa  63.9  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  28.03 
 
 
271 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  24.47 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  24.47 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  28.57 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  26.77 
 
 
262 aa  63.5  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1501  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  31.43 
 
 
293 aa  63.5  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  30.1 
 
 
279 aa  63.5  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  27.21 
 
 
273 aa  63.2  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0007  cobalt transport protein  23.66 
 
 
258 aa  63.2  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  26.83 
 
 
264 aa  63.5  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  26.84 
 
 
259 aa  63.2  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  23.75 
 
 
269 aa  62.8  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2707  cobalt transport protein  32.71 
 
 
277 aa  62.8  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  27.35 
 
 
270 aa  63.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2764  cobalt transport protein  32.71 
 
 
277 aa  62.8  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  29.79 
 
 
263 aa  62.4  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  29.79 
 
 
263 aa  62.4  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  27.35 
 
 
271 aa  62.4  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  30.47 
 
 
276 aa  62.4  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  27.04 
 
 
266 aa  61.6  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  29.61 
 
 
332 aa  60.5  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  30.6 
 
 
276 aa  60.8  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  31.3 
 
 
256 aa  61.2  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2485  cobalt transport protein  29.5 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  29.89 
 
 
266 aa  60.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3444  cobalt transport protein  30.7 
 
 
265 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  32.75 
 
 
264 aa  59.7  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  28.16 
 
 
241 aa  59.3  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  28.81 
 
 
262 aa  59.7  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  23.53 
 
 
257 aa  59.3  0.00000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  25.22 
 
 
263 aa  59.3  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  28.06 
 
 
255 aa  58.9  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3649  cobalt transport protein  29.02 
 
 
266 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1539  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  24.24 
 
 
278 aa  57.4  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  23.26 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  26.32 
 
 
267 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  24.8 
 
 
267 aa  57.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  27.97 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1972  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  26.85 
 
 
275 aa  57  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  29.76 
 
 
264 aa  56.6  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  23.26 
 
 
264 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  23.26 
 
 
264 aa  56.6  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  23.26 
 
 
264 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  22.31 
 
 
291 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  23.26 
 
 
264 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0369  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  28.08 
 
 
273 aa  56.6  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  23.26 
 
 
264 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  27.49 
 
 
243 aa  56.6  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  24.03 
 
 
264 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  23.98 
 
 
266 aa  55.8  0.0000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2677  cobalt transport protein  31.91 
 
 
287 aa  56.2  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.503395  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4125  cobalt transport protein  31.39 
 
 
217 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.902173  hitchhiker  0.0000589617 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3473  cobalt transport protein  25.6 
 
 
259 aa  55.8  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  23.51 
 
 
291 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3823  cobalt transport protein  32.33 
 
 
266 aa  55.8  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457934  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  23.64 
 
 
264 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  27.12 
 
 
266 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  24.35 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  25.41 
 
 
264 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  25.75 
 
 
267 aa  54.7  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07520  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  23.98 
 
 
270 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.508014 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0598  cobalt transport protein  26.67 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157547  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  28.27 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  28.32 
 
 
265 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8786  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporter-like protein  30.17 
 
 
272 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  25.41 
 
 
264 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2462  cobalt transport protein  28.04 
 
 
287 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2425  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  28.04 
 
 
287 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  28.04 
 
 
287 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2642  cobalt transport protein  28.04 
 
 
273 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.357292  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2659  cobalt transport protein  28.04 
 
 
266 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000035997 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  26.99 
 
 
810 aa  53.5  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>