279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2681 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 268 aa  534  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  99.25 
 
 		 268 aa  532  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  57.89 
 
 		 267 aa  325  5e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  60.45 
 
 		 268 aa  316  3e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  56.45 
 
 		 269 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  56.75 
 
 		 270 aa  301  8.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  56.54 
 
 		 263 aa  288  5.0000000000000004e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  56.54 
 
 		 263 aa  288  5.0000000000000004e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  58.17 
 
 		 262 aa  286  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  59.76 
 
 		 265 aa  272  4.0000000000000004e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  51.04 
 
 		 267 aa  249  4e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  48.68 
 
 		 264 aa  248  1e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  45.35 
 
 		 269 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  49.6 
 
 		 265 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  48.39 
 
 		 265 aa  231  9e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  46.56 
 
 		 266 aa  226  3e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  46.12 
 
 		 266 aa  226  4e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  44.27 
 
 		 264 aa  226  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  45.28 
 
 		 268 aa  224  9e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  45.28 
 
 		 268 aa  224  9e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  44.8 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  44.8 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  44.8 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  44.8 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  44.8 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  44.8 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  44.44 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  44.4 
 
 		 264 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  43.89 
 
 		 264 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  44.4 
 
 		 264 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  44.86 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  39.41 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  40.6 
 
 		 269 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  43.82 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  45.2 
 
 		 264 aa  206  4e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  42.06 
 
 		 268 aa  205  8e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  42.4 
 
 		 264 aa  202  4e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  39.16 
 
 		 262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0320  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  44.76 
 
 		 267 aa  192  5e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00398229  hitchhiker  1.85295e-17 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  40 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  36.29 
 
 		 259 aa  183  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  33.6 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2470  cobalt transport protein  34.54 
 
 		 275 aa  168  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105266  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0997  cobalt transport protein  41.13 
 
 		 264 aa  166  5e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  normal  0.445886 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  34.45 
 
 		 336 aa  165  9e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  36.29 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  37.09 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  35.66 
 
 		 269 aa  159  4e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  33.45 
 
 		 332 aa  158  7e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12580  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  35.79 
 
 		 269 aa  158  8e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  36.8 
 
 		 271 aa  158  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2300  cobalt ABC transporter permease protein  36.8 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000489641  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24080  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  38.58 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  46.71 
 
 		 438 aa  151  1e-35  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  34.75 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  32.35 
 
 		 810 aa  144  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  33.21 
 
 		 246 aa  142  7e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2799  cobalt transport protein  32.83 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161091  hitchhiker  0.0000401783 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf374  cobalt ABC transporter, permease protein  32.18 
 
 		 314 aa  133  3e-30  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004205  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1836  cobalt transport protein  33.61 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.507525  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 		 770 aa  124  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  35.39 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0352  cobalt transport protein  27.17 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1964  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit  32.46 
 
 		 255 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19680  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  27.2 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0554754  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  32.66 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  30.08 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  31.2 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  26.42 
 
 		 262 aa  96.3  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  28.12 
 
 		 217 aa  96.7  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3687  cobalt transport protein  28.89 
 
 		 197 aa  93.6  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1130  cobalt transport protein  32.76 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1751  cobalt transport protein  28.12 
 
 		 272 aa  91.3  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253796  normal  0.0321598 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  30.67 
 
 		 270 aa  89.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  28.87 
 
 		 243 aa  89.4  6e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  29.2 
 
 		 287 aa  89  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01470  Cobalt transport protein  23.12 
 
 		 350 aa  89  7e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0260035  normal  0.244881 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1257  cobalt transport protein  29.26 
 
 		 259 aa  89  8e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000290738  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  27.55 
 
 		 257 aa  87.8  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  28.05 
 
 		 196 aa  87  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  26.04 
 
 		 256 aa  85.5  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1229  cobalt transport protein  29.19 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.379694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2867  cobalt transport protein  23.72 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3229  cobalt transport protein  23.72 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.500857 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0370  cobalt transport protein  29.52 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  25.55 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  27.27 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3565  cobalt transport protein  21.65 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0616568  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  26.54 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0884  cobalt transport protein  22.3 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0682  cobalt transport protein  27.84 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000924748  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  23.89 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1067  cobalt transport protein  28.05 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  25.3 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  27.48 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  23.24 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1608  cobalt transport protein  27.54 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  25.47 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3687  cobalt transport protein  25.45 
 
 		 210 aa  72  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.600557  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4408  cobalt transport protein  26.49 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.371368  normal  0.0141186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>