104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1067 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1067  cobalt transport protein  100 
 
 		 255 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3288  cobalt transport protein  71.57 
 
 		 249 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.972587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3687  cobalt transport protein  39.46 
 
 		 210 aa  97.4  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.600557  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  34.97 
 
 		 196 aa  94  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1006  ABC transporter membrane spanning protein  33.51 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  33.56 
 
 		 217 aa  87  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1332  cobalt transport protein  37.93 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256618  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  28.05 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  27.6 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1853  cobalt transport protein  29.08 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00024219 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2111  cobalt transport protein  30.26 
 
 		 216 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0552533  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3687  cobalt transport protein  32.46 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1679  cobalt transport protein  33.12 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  32.89 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  32.89 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  36.59 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  30.77 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01760  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  37.39 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.975631 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4656  cobalt transport protein  39.57 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.365501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  29.25 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1527  cobalt transport protein  37.04 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  31.71 
 
 		 438 aa  66.2  0.0000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  30.66 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  25 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  29.61 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  30.28 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  28.95 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  28.95 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  28.95 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  28.95 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  28.95 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  28.95 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  28.95 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  29.01 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  27.6 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  32.93 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3351  cobalt transport protein  30.32 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  33.09 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2312  putative cobalt transport system permease protein  31.69 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  31.3 
 
 		 336 aa  62  0.000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21860  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  32.96 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  33.87 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  34.43 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  28.26 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  27.84 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  27.84 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  30.94 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3226  cobalt transport protein  31.66 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  34.96 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  28.23 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  29.66 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1836  cobalt transport protein  26.83 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.507525  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  31.87 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5458  cobalt transport protein  41.9 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00259272  normal  0.0904003 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  33.59 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2004  cobalt transport protein  31.02 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.288516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  30.82 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  31.34 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  35.81 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  27.61 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  31.29 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0582  cobalt transport protein  44.44 
 
 		 202 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1229  cobalt transport protein  33.93 
 
 		 322 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.379694 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1730  cobalt transport protein  32.19 
 
 		 200 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  29.37 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2174  ABC transporter inner membrane protein  29.38 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  34.51 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf374  cobalt ABC transporter, permease protein  35.42 
 
 		 314 aa  53.1  0.000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004205  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0623  cobalt transport protein  42.67 
 
 		 202 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303566  normal  0.0342119 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0506  cobalt transport protein  33.33 
 
 		 204 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2319  hypothetical protein  30.89 
 
 		 155 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5279  cobalt transport protein  34.63 
 
 		 200 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5368  cobalt transport protein  34.63 
 
 		 200 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5658  cobalt transport protein  34.63 
 
 		 200 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  31.39 
 
 		 265 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  28.46 
 
 		 262 aa  52.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  26.06 
 
 		 246 aa  52.4  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0846  cobalt transport protein  30.08 
 
 		 198 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  31.54 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20540  Cobalt transport protein  32.5 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  30.77 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4600  cobalt transport protein  31.46 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.610496  normal  0.640124 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0502  cobalt transport protein  41.94 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1539  cobalt transport protein  35.19 
 
 		 197 aa  49.7  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1751  cobalt transport protein  30.77 
 
 		 272 aa  48.9  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253796  normal  0.0321598 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  30.08 
 
 		 265 aa  48.9  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  25.45 
 
 		 262 aa  48.9  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12580  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  32.81 
 
 		 269 aa  48.5  0.00009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2799  cobalt transport protein  28.7 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161091  hitchhiker  0.0000401783 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2470  cobalt transport protein  30.33 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105266  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2300  cobalt ABC transporter permease protein  31.31 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000489641  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2320  cobalt transport protein  35.19 
 
 		 197 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  29.73 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0884  cobalt transport protein  31.25 
 
 		 291 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5032  cobalt transport protein  31.78 
 
 		 205 aa  46.2  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.298232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0320  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  27.39 
 
 		 267 aa  45.4  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00398229  hitchhiker  1.85295e-17 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2341  cobalt transport system permease protein  34.41 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24080  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  32.95 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0652  cobalt transport protein  31.58 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2867  cobalt transport protein  29.46 
 
 		 290 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>