116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2341 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2341  cobalt transport system permease protein  100 
 
 
293 aa  564  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112211  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2867  cobalt transport protein  60.55 
 
 
290 aa  338  7e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3229  cobalt transport protein  60.55 
 
 
290 aa  338  7e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.500857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0884  cobalt transport protein  59.11 
 
 
291 aa  329  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1229  cobalt transport protein  56.88 
 
 
322 aa  324  9e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.379694 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2897  cobalt transport protein  54.25 
 
 
308 aa  293  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00540411  hitchhiker  0.000146213 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3565  cobalt transport protein  57 
 
 
309 aa  286  2.9999999999999996e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0616568  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4901  cobalt transport protein  51.12 
 
 
334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.703439  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04441  cobalt ABC transporter permease  39.14 
 
 
304 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0555726  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1727  cobalt ABC transporter permease  38.89 
 
 
304 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.856144  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03891  cobalt ABC transporter permease  40.38 
 
 
305 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21501  cobalt ABC transporter permease  43.23 
 
 
304 aa  161  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0645  cobalt ABC transporter permease  41.76 
 
 
302 aa  160  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.706305  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2027  cobalt ABC transporter permease  38.87 
 
 
302 aa  157  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0388  cobalt ABC transporter permease  35.77 
 
 
304 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.290241  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04541  cobalt ABC transporter permease  31.31 
 
 
304 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.727221  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_4931  ABC(membrane) family transporter: cobalt ion  35.02 
 
 
257 aa  138  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04431  cobalt ABC transporter permease  33.72 
 
 
304 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04121  cobalt ABC transporter permease  33.46 
 
 
304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0888623  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  24.18 
 
 
267 aa  90.5  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  27.13 
 
 
262 aa  84  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2470  cobalt transport protein  28.35 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105266  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  24.29 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  21.51 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  30.63 
 
 
263 aa  78.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  30.63 
 
 
263 aa  78.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  21.12 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  30.06 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  25.91 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  25.91 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  25.55 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  25.55 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  25.55 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  25.55 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  25.55 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  26.52 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  26.52 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  25.55 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  26.81 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  22.35 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  25.55 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  26.04 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  23.53 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  29.87 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  27.16 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  21.03 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  24.9 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  23.89 
 
 
332 aa  68.6  0.0000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  27.03 
 
 
269 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  25.19 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  26.15 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.49 
 
 
255 aa  67  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  25.63 
 
 
265 aa  67  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  25.65 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  27.03 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2300  cobalt ABC transporter permease protein  33.58 
 
 
263 aa  65.1  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000489641  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  22.94 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  26.06 
 
 
438 aa  65.1  0.000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  23.72 
 
 
269 aa  63.9  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  26.39 
 
 
266 aa  63.9  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  26.89 
 
 
267 aa  63.9  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  23.94 
 
 
310 aa  62.4  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  29.08 
 
 
241 aa  62.4  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  26.97 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  20.12 
 
 
336 aa  57.8  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  23.08 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  23.23 
 
 
268 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf374  cobalt ABC transporter, permease protein  22.34 
 
 
314 aa  56.6  0.0000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004205  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2799  cobalt transport protein  25.71 
 
 
284 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161091  hitchhiker  0.0000401783 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19680  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  29.41 
 
 
231 aa  54.7  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0554754  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  24.07 
 
 
264 aa  53.9  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3473  cobalt transport protein  26.8 
 
 
259 aa  52.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12580  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  25.2 
 
 
269 aa  52.8  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  26.28 
 
 
287 aa  52.8  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  26.24 
 
 
263 aa  52  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  23.16 
 
 
266 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  24.54 
 
 
266 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  25.42 
 
 
279 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0997  cobalt transport protein  28.57 
 
 
264 aa  50.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  normal  0.445886 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  22.87 
 
 
283 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3288  cobalt transport protein  31.29 
 
 
249 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.972587  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  24.51 
 
 
257 aa  49.7  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  23.46 
 
 
810 aa  49.7  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  23.4 
 
 
279 aa  49.7  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  23.46 
 
 
270 aa  49.7  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  25.97 
 
 
279 aa  49.3  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0274  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.81 
 
 
265 aa  48.9  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.916365  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0337  cobalt transport protein  22.32 
 
 
256 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  25.62 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  25.62 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  26.42 
 
 
285 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1597  transporter, putative  28.15 
 
 
235 aa  47.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  23.16 
 
 
264 aa  46.6  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2659  cobalt transport protein  23.44 
 
 
266 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000035997 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  23.91 
 
 
266 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  24.26 
 
 
287 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1067  cobalt transport protein  33.33 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0352  cobalt transport protein  27.34 
 
 
264 aa  45.4  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  29.09 
 
 
196 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  23.93 
 
 
271 aa  45.4  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>