194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2470 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2470  cobalt transport protein  100 
 
 		 275 aa  533  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105266  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  39.84 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  35.93 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  35.48 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  33.21 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  34.26 
 
 		 268 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  33.47 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  41.2 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  37.6 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  37.6 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  39.38 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  37.3 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  37.84 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  31.72 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  34.77 
 
 		 266 aa  150  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  33.72 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  41.35 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  33.87 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  32.83 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  32.83 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  32.83 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  32.83 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  32.83 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  32.82 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  32.83 
 
 		 264 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  32.83 
 
 		 264 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  33.58 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  33.85 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  32.83 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  32.83 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  32.45 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  32.8 
 
 		 262 aa  142  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  29.88 
 
 		 262 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  30.8 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  32.42 
 
 		 264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  31.58 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  29.02 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  29.02 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  31.37 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0320  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  33.06 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00398229  hitchhiker  1.85295e-17 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12580  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  34.4 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  30.95 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  32.5 
 
 		 265 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2300  cobalt ABC transporter permease protein  34.26 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000489641  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  32.8 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  30.13 
 
 		 255 aa  108  9.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0997  cobalt transport protein  33.07 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  normal  0.445886 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24080  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  31.42 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  28.57 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  33.8 
 
 		 438 aa  100  2e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  26.75 
 
 		 770 aa  96.7  4e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  24.71 
 
 		 269 aa  96.7  4e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  24.32 
 
 		 336 aa  96.3  5e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2799  cobalt transport protein  33.33 
 
 		 284 aa  96.3  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161091  hitchhiker  0.0000401783 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  30.65 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  29.96 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  25.36 
 
 		 332 aa  93.6  3e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  29.96 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  30.42 
 
 		 810 aa  87.8  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf374  cobalt ABC transporter, permease protein  22.18 
 
 		 314 aa  87  3e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004205  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19680  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  33.09 
 
 		 231 aa  85.5  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0554754  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2867  cobalt transport protein  25.36 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3229  cobalt transport protein  25.36 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.500857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0884  cobalt transport protein  24.91 
 
 		 291 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  23.92 
 
 		 246 aa  82  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1229  cobalt transport protein  33.12 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.379694 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3565  cobalt transport protein  24.5 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0616568  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  29.64 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1836  cobalt transport protein  25.65 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.507525  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  28.78 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2341  cobalt transport system permease protein  28.14 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1130  cobalt transport protein  28.75 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0352  cobalt transport protein  25.75 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  26.59 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2897  cobalt transport protein  21.28 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00540411  hitchhiker  0.000146213 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  23.26 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4901  cobalt transport protein  28.75 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.703439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1150  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.63 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  24.91 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  23.36 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  24.4 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  23.36 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  24.08 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01470  Cobalt transport protein  35.87 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0260035  normal  0.244881 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  26.4 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  27.39 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0162  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.6 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.227232  normal  0.133608 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  25.85 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  26.74 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1008  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.69 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0328725  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  24.9 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0514  cobalt ABC transporter inner membrane subunit CbiQ  29.5 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.113619  normal  0.150411 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1329  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.2 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378958  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1006  ABC transporter membrane spanning protein  30 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  25.21 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1964  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit  27.86 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  30.94 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2425  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  24.1 
 
 		 287 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  24.5 
 
 		 287 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1413  cobalt transport protein  29.93 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>