61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1727 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1727  cobalt ABC transporter permease  100 
 
 
304 aa  578  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.856144  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04441  cobalt ABC transporter permease  99.34 
 
 
304 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0555726  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21501  cobalt ABC transporter permease  57.76 
 
 
304 aa  323  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03891  cobalt ABC transporter permease  56.11 
 
 
305 aa  306  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2027  cobalt ABC transporter permease  54.61 
 
 
302 aa  305  7e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0645  cobalt ABC transporter permease  56.83 
 
 
302 aa  280  3e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.706305  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04541  cobalt ABC transporter permease  49.5 
 
 
304 aa  262  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.727221  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04431  cobalt ABC transporter permease  47.52 
 
 
304 aa  249  3e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0388  cobalt ABC transporter permease  47.85 
 
 
304 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.290241  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04121  cobalt ABC transporter permease  46.86 
 
 
304 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0888623  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2867  cobalt transport protein  38.85 
 
 
290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3229  cobalt transport protein  38.85 
 
 
290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.500857 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2341  cobalt transport system permease protein  39.14 
 
 
293 aa  172  6.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112211  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1229  cobalt transport protein  36.07 
 
 
322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.379694 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0884  cobalt transport protein  39.54 
 
 
291 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2897  cobalt transport protein  34.93 
 
 
308 aa  148  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00540411  hitchhiker  0.000146213 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3565  cobalt transport protein  35.02 
 
 
309 aa  145  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0616568  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4901  cobalt transport protein  35.62 
 
 
334 aa  141  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.703439  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_4931  ABC(membrane) family transporter: cobalt ion  31.37 
 
 
257 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  29.46 
 
 
266 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  23.65 
 
 
264 aa  59.7  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  27.27 
 
 
264 aa  59.3  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  26.69 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  25 
 
 
262 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  26.11 
 
 
262 aa  55.8  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  24.03 
 
 
267 aa  55.8  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  26.64 
 
 
267 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  26.12 
 
 
268 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  23.64 
 
 
264 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  23.87 
 
 
269 aa  53.9  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  24.42 
 
 
264 aa  53.5  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  23.26 
 
 
264 aa  53.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  23.26 
 
 
264 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  23.26 
 
 
264 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  23.26 
 
 
264 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  23.26 
 
 
264 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  23.26 
 
 
264 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  23.26 
 
 
264 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  23.26 
 
 
264 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  23.26 
 
 
264 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  27.38 
 
 
269 aa  52.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  24.62 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf374  cobalt ABC transporter, permease protein  25.48 
 
 
314 aa  50.1  0.00005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004205  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  28.09 
 
 
263 aa  49.7  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  25.62 
 
 
267 aa  49.7  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  28.09 
 
 
263 aa  49.7  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  27.86 
 
 
241 aa  49.3  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  23.66 
 
 
268 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  23.66 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  27.91 
 
 
259 aa  48.9  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  20.81 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2470  cobalt transport protein  24.56 
 
 
275 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105266  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  23.44 
 
 
332 aa  47.4  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  24.62 
 
 
438 aa  47.4  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  25.55 
 
 
268 aa  46.2  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  22.14 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  22.14 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2300  cobalt ABC transporter permease protein  35.48 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000489641  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0320  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  23.04 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00398229  hitchhiker  1.85295e-17 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  24.51 
 
 
265 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  22.44 
 
 
265 aa  42.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>